Cel
This project aims at elucidating the mechanisms of intra-protein signalling and gaseous ligand discrimination in a heme-based gas sensor. As a model system, I propose to study the bacterial oxygen sensor FixL.
This protein contains a sensory PAS domain, which regulates the activity of a histidine kinase domain via the binding/release of oxygen to the heme. Structures of the O2-bound and unliganded isolated heme domain are available and provide models for the start- and endpoints of the intra-domain signalling process.
However, information on the intermediate pathway is lacking. In addition, the transmission to, and the influence of, the enzymatic domain, have not been taken into account. To address these issues, this proposal describes an approach integrating molecular biology, biochemical, ultrafast spectroscopic, and computational techniques.
Based on structural information and simulations, substitutions of residues potentially involved in the signalling pathway are designed. The initial set of mutations concerns residues in the heme pocket and in the 'FG loop', which is located at the presumed interface between the constituents of the functional homodimer.
The corresponding proteins will be over-expressed, as isolated sensor domain, as well as full-length proteins. Strategies are devised to address the challenging task of isolating stable and sufficient full-length proteins for spectroscopic analysis.
To generate intermediates in the signalling pathway, the unique possibility to photocleave the heme-ligand bond will be exploited. Using ultrafast absorption and vibrational (Raman and infrared) spectroscopy, this allows the characterization of the electronic and structural properties of transient states and their dynamics, with femtosecond time resolution.
Along with molecular dynamics modelling and with the perspective of ultrafast time resolved crystallography, pathways will be mapped and general features for intraprotein signal propagation proposed.
Dziedzina nauki (EuroSciVoc)
Klasyfikacja projektów w serwisie CORDIS opiera się na wielojęzycznej taksonomii EuroSciVoc, obejmującej wszystkie dziedziny nauki, w oparciu o półautomatyczny proces bazujący na technikach przetwarzania języka naturalnego. Więcej informacji: Europejski Słownik Naukowy.
Klasyfikacja projektów w serwisie CORDIS opiera się na wielojęzycznej taksonomii EuroSciVoc, obejmującej wszystkie dziedziny nauki, w oparciu o półautomatyczny proces bazujący na technikach przetwarzania języka naturalnego. Więcej informacji: Europejski Słownik Naukowy.
- nauki przyrodnicze nauki o Ziemi i pokrewne nauki o środowisku geologia mineralogia krystalografia
- nauki przyrodnicze nauki biologiczne biochemia biocząsteczki białka
- nauki przyrodnicze nauki biologiczne genetyka mutacja
- nauki przyrodnicze nauki chemiczne chemia organiczna aminy
- nauki przyrodnicze nauki biologiczne biologia molekularna
Aby użyć tej funkcji, musisz się zalogować lub zarejestrować
Słowa kluczowe
Słowa kluczowe dotyczące projektu wybrane przez koordynatora projektu. Nie należy mylić ich z pojęciami z taksonomii EuroSciVoc dotyczącymi dziedzin nauki.
Słowa kluczowe dotyczące projektu wybrane przez koordynatora projektu. Nie należy mylić ich z pojęciami z taksonomii EuroSciVoc dotyczącymi dziedzin nauki.
Program(-y)
Wieloletnie programy finansowania, które określają priorytety Unii Europejskiej w obszarach badań naukowych i innowacji.
Wieloletnie programy finansowania, które określają priorytety Unii Europejskiej w obszarach badań naukowych i innowacji.
Temat(-y)
Zaproszenia do składania wniosków dzielą się na tematy. Każdy temat określa wybrany obszar lub wybrane zagadnienie, których powinny dotyczyć wnioski składane przez wnioskodawców. Opis tematu obejmuje jego szczegółowy zakres i oczekiwane oddziaływanie finansowanego projektu.
Zaproszenia do składania wniosków dzielą się na tematy. Każdy temat określa wybrany obszar lub wybrane zagadnienie, których powinny dotyczyć wnioski składane przez wnioskodawców. Opis tematu obejmuje jego szczegółowy zakres i oczekiwane oddziaływanie finansowanego projektu.
Zaproszenie do składania wniosków
Procedura zapraszania wnioskodawców do składania wniosków projektowych w celu uzyskania finansowania ze środków Unii Europejskiej.
Procedura zapraszania wnioskodawców do składania wniosków projektowych w celu uzyskania finansowania ze środków Unii Europejskiej.
FP6-2005-MOBILITY-7
Zobacz inne projekty w ramach tego zaproszenia
System finansowania
Program finansowania (lub „rodzaj działania”) realizowany w ramach programu o wspólnych cechach. Określa zakres finansowania, stawkę zwrotu kosztów, szczegółowe kryteria oceny kwalifikowalności kosztów w celu ich finansowania oraz stosowanie uproszczonych form rozliczania kosztów, takich jak rozliczanie ryczałtowe.
Program finansowania (lub „rodzaj działania”) realizowany w ramach programu o wspólnych cechach. Określa zakres finansowania, stawkę zwrotu kosztów, szczegółowe kryteria oceny kwalifikowalności kosztów w celu ich finansowania oraz stosowanie uproszczonych form rozliczania kosztów, takich jak rozliczanie ryczałtowe.
IIF - Marie Curie actions-Incoming International Fellowships
Koordynator
PALAISEAU
Grecja
Ogół kosztów poniesionych przez organizację w związku z uczestnictwem w projekcie. Obejmuje koszty bezpośrednie i pośrednie. Kwota stanowi część całkowitego budżetu projektu.