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Contenuto archiviato il 2024-06-18

Functional organization of heterochromatin at the nuclear periphery in cell differentiation

Obiettivo

Co-ordinating the patterns of gene expression that drive the development of a complex organism requires multiple layers of regulation, extending from sequence-based DNA-protein interactions to higher-order architecture of the genome.
The spatial organization of chromatin within the nucleus is thought to reflect a functional compartmentalization that mirrors changes in cell fate. Recently, the signals and proteins involved in the topological organization of heterochromatin in complex organisms started to be addressed. In C. elegans, cell differentiation is accompanied by a cell-type specific 3D re-organization of the nucleus, leading to the internal localization of active tissue-specific promoters and the perinuclear sequestration of repressed tissue-specific promoters.
Through a highly successful genome-wide RNAi screen the Gasser laboratory identified histone H3K9 methylation as an essential signal for the peripheral anchoring of heterochromatin in undifferentiated embryonic C. elegans cells. However, as embryos differentiate into worms the perinuclear sequestration of heterochromatic arrays is re-established, even in absence of H3K9 methylation. This strongly argues that alternative, unknown anchoring pathways that are induced during differentiation exist and orchestrate heterochromatin spatial segregation.
With this project, I aim to identify the chromatin signals and “reader” molecules triggering heterochromatin anchoring at the nuclear periphery in differentiating worm cells. Moreover, I will determine whether compartmentalization of chromatin is required for appropriate cell-type differentiation. I predict that defects in tissue maintenance will arise, albeit possibly subtle ones, when chromatin fails to segregate into active and inactive domains.
Overall, this project will significantly contribute to understanding how genomic nuclear organization impinges on epigenetic regulation.

Campo scientifico (EuroSciVoc)

CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: Il Vocabolario Scientifico Europeo.

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Argomento(i)

Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.

Invito a presentare proposte

Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.

FP7-PEOPLE-2013-IEF
Vedi altri progetti per questo bando

Meccanismo di finanziamento

Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.

MC-IEF - Intra-European Fellowships (IEF)

Coordinatore

FRIEDRICH MIESCHER INSTITUTE FOR BIOMEDICAL RESEARCH FONDATION
Contributo UE
€ 199 317,60
Indirizzo
FABRIKSTRASSE 2
4056 BASEL
Svizzera

Mostra sulla mappa

Regione
Schweiz/Suisse/Svizzera Nordwestschweiz Basel-Stadt
Tipo di attività
Research Organisations
Collegamenti
Costo totale

I costi totali sostenuti dall’organizzazione per partecipare al progetto, compresi i costi diretti e indiretti. Questo importo è un sottoinsieme del bilancio complessivo del progetto.

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