Skip to main content
Przejdź do strony domowej Komisji Europejskiej (odnośnik otworzy się w nowym oknie)
polski polski
CORDIS - Wyniki badań wspieranych przez UE
CORDIS

Advanced bioinformatics for genome and metagenome analyses and discovery of novel biocatalists from extremophiles: implications for improving industrial bioprocesses

CORDIS oferuje możliwość skorzystania z odnośników do publicznie dostępnych publikacji i rezultatów projektów realizowanych w ramach programów ramowych HORYZONT.

Odnośniki do rezultatów i publikacji związanych z poszczególnymi projektami 7PR, a także odnośniki do niektórych konkretnych kategorii wyników, takich jak zbiory danych i oprogramowanie, są dynamicznie pobierane z systemu OpenAIRE .

Rezultaty

metagenome sequence and annotation (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Publication of sequenced and annotated metagenomes obtained with already available and new bioinformatics tools. Publication of metagenome data banks.

Improved bioinformatics tools (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Publication of new pipelines to assist genome annotation of unknown sequences.On-line open source softwares.

patenting and industrial applications (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Patents and preliminary tests of newly characterized enzymes and new metabolic pathways in industrial application

reports on new biocatalists (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Publications on new characterized biocatalists and their potential applications

Joint publications concerning WP1-WP5 (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

"Joint publications concerning WP1-WP5. The editor of ""Computational biology and chemistry"" (impact factor 1.7), Wentian Li, invited dr. Pietro Liò (Cambridge) to organize a special issues on this matter."

proposals for new projects (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

New proposals for EU projects.

Web page ,Twitter and Facebook account (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

"Publlished web pages ,Twitter and Facebook accounts. Participation to the followung workshops for dissemination: http://www3.unil.ch/wpmu/eseb2015/ http://sbg.org.br/Evolution2015/ http://www.smbe.org/ eccsb/icsb http://www.iscb.org/about-ismb masamb https://twitter.com/theosysbio/status/454249905088114688 cmsb http://cmsb2015.sciencesconf.org/ http://www.physoc.org/suggest-symposium#Physiology_2015 We would like to apply to EMBO (http://applications.embo.org/01/register.php?reg=L06Q). for the organization of a workshop. "

E. focardii genome database and identification of sequences encoding molecules of interest for industrial applications. (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Publication of an E. focardii genome database. Identified genomic sequences encoding molecules of interest for industrial applications

New insight on the molecular mechanisms responsible for cold-adaptation and/or environmental adaptation (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Publications on the characterized new insights on the molecular mechanisms responsible for cold and/or environmental adaptation. The coordinator the project has been invited to organize a special issue on Frontiers in Bioengineering and Biotechnology , that will focus on this topic.

New rules for system biology (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Pubblications of improved bionformatic competence and that defines new rules for system biology.

genome annotations (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Annotated genome to be analysed for discovering biomolecules of interest. Publications of data banks.

Characterized new metabolic pathways (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Characterized new metabolic pathways that may be of interest for bioremediation processes and industrial application

characterization of biocatalysts of interest (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

characterized new biocatalysts from extreme microorganisms that may be of interest for industrial applications

Optimized biomolecules (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

production of biomolecules with optimized properties at extreme conditions, such as improved catalytic activity, catalytic specificity, thermostability and many others.

Isolation of microbes that can survive to extreme environments for cultivation when possible that can survive to extreme environments for cultivation when possibles (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Isolated and cultivated microbes able to survive to extreme environments, in particular psychrophilic microbes. These microbes can be the source of new enzymes and/or metabolic pathways that can be exploited in industrial applications and for bioremediation.

trained researchers on bioinformatics (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Trained ESR on bioinformatics able to analyse genomic and metagenomic sequences.

optimized molecules for bioremediation (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Optimized molecules for bioremediation with improved degradation activity of pollutants.

Characterized new biocatalists (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Characterizaed biomolecules that may be involved in adaptation to cold and/or extreme environment able to produce compound at low temperatures (with saving of energy) and other extreme conditions (high salt concentration, extreme pH conditions), that may be of interest for industrial applications.

patent on optimized biomolecules (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

patent on optimized biomolecules that can be provided for industrial applications

Patents (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Patent of new softwares, tools and algorithms for system biology.

Publikacje

Bioinformatics Challenges and Potentialities in Studying Extreme Environments (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Claudio Angione, Pietro Liò, Sandra Pucciarelli, Basarbatu Can, Maxwell Conway, Marina Lotti, Habib Bokhari, Alessio Mancini, Ugur Sezerman, Andrea Telatin
Opublikowane w: Computational Intelligence Methods for Bioinformatics and Biostatistics, Numer 9874, 2016, Strona(/y) 205-219, ISBN 978-3-319-44331-7
Wydawca: Springer International Publishing
DOI: 10.1007/978-3-319-44332-4_16

Structure of a bacterial ice binding protein with two faces of interaction with ice (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Marco Mangiagalli, Guy Sarusi, Aleksei Kaleda, Maya Bar Dolev, Valentina Nardone, Vittoria Federica Vena, Ido Braslavsky, Marina Lotti, Marco Nardini
Opublikowane w: The FEBS Journal, Numer 285/9, 2018, Strona(/y) 1653-1666, ISSN 1742-464X
Wydawca: Blackwell Publishing Inc.
DOI: 10.1111/febs.14434

Antarctic marine ciliates under stress: superoxide dismutases from the psychrophilic Euplotes focardii are cold-active yet heat tolerant enzymes (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Alessandro Pischedda, Kesava Priyan Ramasamy, Marco Mangiagalli, Federica Chiappori, Luciano Milanesi, Cristina Miceli, Sandra Pucciarelli, Marina Lotti
Opublikowane w: Scientific Reports, Numer 8/1, 2018, ISSN 2045-2322
Wydawca: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41598-018-33127-1

Antibiotic activity of the antioxidant drink effective Microorganism-X (EM-X) extracts against common nosocomial pathogens: an in vitro study (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Alessio Mancini, Sandra Pucciarelli
Opublikowane w: Natural Product Research, 2018, Strona(/y) 1-6, ISSN 1478-6419
Wydawca: Taylor & Francis
DOI: 10.1080/14786419.2018.1517344

CiliateGEM: an open-project and a tool for predictions of ciliate metabolic variations and experimental condition design (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Alessio Mancini, Filmon Eyassu, Maxwell Conway, Annalisa Occhipinti, Pietro Liò, Claudio Angione, Sandra Pucciarelli
Opublikowane w: BMC Bioinformatics, Numer 19/S15, 2018, Strona(/y) 1-11, ISSN 1471-2105
Wydawca: BioMed Central
DOI: 10.1186/s12859-018-2422-9

Enzymes and ice binding proteins from Antarctic organisms (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: M. Lotti, S. Brocca, M. Mangiagalli, A. Pischedda, M. Orlando, S. Maione, D. De Pascale, S. Pucciarelli, M. Nardini, I. Braslavsky
Opublikowane w: New Biotechnology, Numer 44, 2018, Strona(/y) S43-S44, ISSN 1871-6784
Wydawca: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.nbt.2018.05.091

Saturn-Shaped Ice Burst Pattern and Fast Basal Binding of an Ice-Binding Protein from an Antarctic Bacterial Consortium (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Aleksei Kaleda, Lotem Haleva, Guy Sarusi, Tova Pinsky, Marco Mangiagalli, Maya Bar Dolev, Marina Lotti, Marco Nardini, Ido Braslavsky
Opublikowane w: Langmuir, 2018, ISSN 0743-7463
Wydawca: American Chemical Society
DOI: 10.1021/acs.langmuir.8b01914

Mechanisms of toxic action of silver nanoparticles in the protozoan Tetrahymena thermophila : From gene expression to phenotypic events (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Katre Juganson, Monika Mortimer, Angela Ivask, Sandra Pucciarelli, Cristina Miceli, Kaja Orupõld, Anne Kahru
Opublikowane w: Environmental Pollution, 2017, ISSN 0269-7491
Wydawca: Pergamon Press Ltd.
DOI: 10.1016/j.envpol.2017.03.013

Rational engineering of a cold-adapted α-amylase from the Antarctic ciliate Euplotes focardii for simultaneous improvement of thermostability and catalytic activity (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Guang Yang, Hua Yao, Matteo Mozzicafreddo, Patrizia Ballarini, Sandra Pucciarelli, Cristina Miceli
Opublikowane w: Applied and Environmental Microbiology, 2017, Strona(/y) AEM.00449-17, ISSN 0099-2240
Wydawca: American Society for Microbiology
DOI: 10.1128/AEM.00449-17

Ice-binding proteins and the ‘domain of unknown function’ 3494 family (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Tyler D.R. Vance, Maddalena Bayer-Giraldi, Peter L. Davies, Marco Mangiagalli
Opublikowane w: The FEBS Journal, 2019, ISSN 1742-464X
Wydawca: Blackwell Publishing Inc.
DOI: 10.1111/febs.14764

Wyszukiwanie danych OpenAIRE...

Podczas wyszukiwania danych OpenAIRE wystąpił błąd

Brak wyników

Moja broszura 0 0