Structure function relationships of the phyllosphere microbiota

Projektinformationen

PhyMo

ID Finanzhilfevereinbarung: 668991

DOI

10.3030/668991

Projekt abgeschlossen

EK-Unterschriftsdatum 17 August 2015

Startdatum 1 September 2015

Enddatum 31 Dezember 2020

Finanziert unter

• EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)

Gesamtkosten

€ 2 499 980,00

EU-Beitrag

€ 2 499 980,00

Koordiniert durch

EIDGENOESSISCHE TECHNISCHE HOCHSCHULE ZUERICH
Switzerland

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Veröffentlichungen

Peer reviewed articles (10)

Bipartite interactions, antibiotic production and biosynthetic potential of the Arabidopsis leaf microbiome

Autoren: Eric J. N. Helfrich, Christine M. Vogel, Reiko Ueoka, Martin Schäfer, Florian Ryffel, Daniel B. Müller, Silke Probst, Markus Kreuzer, Jörn Piel, Julia A. Vorholt
Veröffentlicht in: Nature Microbiology, Ausgabe 3/8, 2018, Seite(n) 909-919, ISSN 2058-5276
Herausgeber: Springer Nature
DOI: 10.1038/s41564-018-0200-0

Synthetic microbiota reveal priority effects and keystone strains in the Arabidopsis phyllosphere

Autoren: Charlotte I. Carlström, Christopher M. Field, Miriam Bortfeld-Miller, Barbara Müller, Shinichi Sunagawa, Julia A. Vorholt
Veröffentlicht in: Nature Ecology & Evolution, Ausgabe 3/10, 2019, Seite(n) 1445-1454, ISSN 2397-334X
Herausgeber: Springer Nature
DOI: 10.1038/s41559-019-0994-z

Critical Assessment of Metagenome Interpretation—a benchmark of metagenomics software

Autoren: Alexander Sczyrba, Peter Hofmann, Peter Belmann, David Koslicki, Stefan Janssen, Johannes Dröge, Ivan Gregor, Stephan Majda, Jessika Fiedler, Eik Dahms, Andreas Bremges, Adrian Fritz, Ruben Garrido-Oter, Tue Sparholt Jørgensen, Nicole Shapiro, Philip D Blood, Alexey Gurevich, Yang Bai, Dmitrij Turaev, Matthew Z DeMaere, Rayan Chikhi, Niranjan Nagarajan, Christopher Quince, Fernando Meyer, Monika
Veröffentlicht in: Nature Methods, Ausgabe 14/11, 2017, Seite(n) 1063-1071, ISSN 1548-7091
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/nmeth.4458

Establishing Causality: Opportunities of Synthetic Communities for Plant Microbiome Research

Autoren: Julia A. Vorholt, Christine Vogel, Charlotte I. Carlström, Daniel B. Müller
Veröffentlicht in: Cell Host & Microbe, Ausgabe 22/2, 2017, Seite(n) 142-155, ISSN 1931-3128
Herausgeber: Cell Press
DOI: 10.1016/j.chom.2017.07.004

Genomic features of bacterial adaptation to plants

Autoren: Asaf Levy, Isai Salas Gonzalez, Maximilian Mittelviefhaus, Scott Clingenpeel, Sur Herrera Paredes, Jiamin Miao, Kunru Wang, Giulia Devescovi, Kyra Stillman, Freddy Monteiro, Bryan Rangel Alvarez, Derek S. Lundberg, Tse-Yuan Lu, Sarah Lebeis, Zhao Jin, Meredith McDonald, Andrew P. Klein, Meghan E. Feltcher, Tijana Glavina Rio, Sarah R. Grant, Sharon L. Doty, Ruth E. Ley, Bingyu Zhao, Vittorio Ventu
Veröffentlicht in: Nature Genetics, Ausgabe 50/1, 2018, Seite(n) 138-150, ISSN 1061-4036
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41588-017-0012-9

The Plant Microbiota: Systems-Level Insights and Perspectives

Autoren: Daniel B. Müller, Christine Vogel, Yang Bai, Julia A. Vorholt
Veröffentlicht in: Annual Review of Genetics, Ausgabe 50/1, 2016, Seite(n) 211-234, ISSN 0066-4197
Herausgeber: Annual Reviews, Inc.
DOI: 10.1146/annurev-genet-120215-034952

Systems-level Proteomics of Two Ubiquitous Leaf Commensals Reveals Complementary Adaptive Traits for Phyllosphere Colonization

Autoren: Daniel B. Müller, Olga T. Schubert, Hannes Röst, Ruedi Aebersold, Julia A. Vorholt
Veröffentlicht in: Molecular & Cellular Proteomics, Ausgabe 15/10, 2016, Seite(n) 3256-3269, ISSN 1535-9476
Herausgeber: American Society for Biochemistry and Molecular Biology Inc.
DOI: 10.1074/mcp.M116.058164

The Arabidopsis leaf transcriptome reveals distinct but also overlapping responses to colonization by phyllosphere commensals and pathogen infection with impact on plant health

Autoren: Christine Vogel, Natacha Bodenhausen, Wilhelm Gruissem, Julia A. Vorholt
Veröffentlicht in: New Phytologist, Ausgabe 212/1, 2016, Seite(n) 192-207, ISSN 0028-646X
Herausgeber: Blackwell Publishing Inc.
DOI: 10.1111/nph.14036

Functional overlap of the Arabidopsis leaf and root microbiota

Autoren: Yang Bai, Daniel B. Müller, Girish Srinivas, Ruben Garrido-Oter, Eva Potthoff, Matthias Rott, Nina Dombrowski, Philipp C. Münch, Stijn Spaepen, Mitja Remus-Emsermann, Bruno Hüttel, Alice C. McHardy, Julia A. Vorholt, Paul Schulze-Lefert
Veröffentlicht in: Nature, Ausgabe 528/7582, 2015, Seite(n) 364-369, ISSN 0028-0836
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/nature16192

A modular atomic force microscopy approach reveals a large range of hydrophobic adhesion forces among bacterial members of the leaf microbiota

Autoren: Maximilian Mittelviefhaus, Daniel B. Müller, Tomaso Zambelli, Julia A. Vorholt
Veröffentlicht in: The ISME Journal, Ausgabe 13/7, 2019, Seite(n) 1878-1882, ISSN 1751-7362
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41396-019-0404-1