Structure function relationships of the phyllosphere microbiota

Informazioni relative al progetto

PhyMo

ID dell’accordo di sovvenzione: 668991

DOI

10.3030/668991

Progetto chiuso

Data della firma CE 17 Agosto 2015

Data di avvio 1 Settembre 2015

Data di completamento 31 Dicembre 2020

Finanziato da

• EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)

Costo totale

€ 2 499 980,00

Contributo UE

€ 2 499 980,00

Coordinato da

EIDGENOESSISCHE TECHNISCHE HOCHSCHULE ZUERICH
Switzerland

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Pubblicazioni

Peer reviewed articles (10)

Bipartite interactions, antibiotic production and biosynthetic potential of the Arabidopsis leaf microbiome

Autori: Eric J. N. Helfrich, Christine M. Vogel, Reiko Ueoka, Martin Schäfer, Florian Ryffel, Daniel B. Müller, Silke Probst, Markus Kreuzer, Jörn Piel, Julia A. Vorholt
Pubblicato in: Nature Microbiology, Numero 3/8, 2018, Pagina/e 909-919, ISSN 2058-5276
Editore: Springer Nature
DOI: 10.1038/s41564-018-0200-0

Synthetic microbiota reveal priority effects and keystone strains in the Arabidopsis phyllosphere

Autori: Charlotte I. Carlström, Christopher M. Field, Miriam Bortfeld-Miller, Barbara Müller, Shinichi Sunagawa, Julia A. Vorholt
Pubblicato in: Nature Ecology & Evolution, Numero 3/10, 2019, Pagina/e 1445-1454, ISSN 2397-334X
Editore: Springer Nature
DOI: 10.1038/s41559-019-0994-z

Critical Assessment of Metagenome Interpretation—a benchmark of metagenomics software

Autori: Alexander Sczyrba, Peter Hofmann, Peter Belmann, David Koslicki, Stefan Janssen, Johannes Dröge, Ivan Gregor, Stephan Majda, Jessika Fiedler, Eik Dahms, Andreas Bremges, Adrian Fritz, Ruben Garrido-Oter, Tue Sparholt Jørgensen, Nicole Shapiro, Philip D Blood, Alexey Gurevich, Yang Bai, Dmitrij Turaev, Matthew Z DeMaere, Rayan Chikhi, Niranjan Nagarajan, Christopher Quince, Fernando Meyer, Monika
Pubblicato in: Nature Methods, Numero 14/11, 2017, Pagina/e 1063-1071, ISSN 1548-7091
Editore: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/nmeth.4458

Establishing Causality: Opportunities of Synthetic Communities for Plant Microbiome Research

Autori: Julia A. Vorholt, Christine Vogel, Charlotte I. Carlström, Daniel B. Müller
Pubblicato in: Cell Host & Microbe, Numero 22/2, 2017, Pagina/e 142-155, ISSN 1931-3128
Editore: Cell Press
DOI: 10.1016/j.chom.2017.07.004

Genomic features of bacterial adaptation to plants

Autori: Asaf Levy, Isai Salas Gonzalez, Maximilian Mittelviefhaus, Scott Clingenpeel, Sur Herrera Paredes, Jiamin Miao, Kunru Wang, Giulia Devescovi, Kyra Stillman, Freddy Monteiro, Bryan Rangel Alvarez, Derek S. Lundberg, Tse-Yuan Lu, Sarah Lebeis, Zhao Jin, Meredith McDonald, Andrew P. Klein, Meghan E. Feltcher, Tijana Glavina Rio, Sarah R. Grant, Sharon L. Doty, Ruth E. Ley, Bingyu Zhao, Vittorio Ventu
Pubblicato in: Nature Genetics, Numero 50/1, 2018, Pagina/e 138-150, ISSN 1061-4036
Editore: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41588-017-0012-9

The Plant Microbiota: Systems-Level Insights and Perspectives

Autori: Daniel B. Müller, Christine Vogel, Yang Bai, Julia A. Vorholt
Pubblicato in: Annual Review of Genetics, Numero 50/1, 2016, Pagina/e 211-234, ISSN 0066-4197
Editore: Annual Reviews, Inc.
DOI: 10.1146/annurev-genet-120215-034952

Systems-level Proteomics of Two Ubiquitous Leaf Commensals Reveals Complementary Adaptive Traits for Phyllosphere Colonization

Autori: Daniel B. Müller, Olga T. Schubert, Hannes Röst, Ruedi Aebersold, Julia A. Vorholt
Pubblicato in: Molecular & Cellular Proteomics, Numero 15/10, 2016, Pagina/e 3256-3269, ISSN 1535-9476
Editore: American Society for Biochemistry and Molecular Biology Inc.
DOI: 10.1074/mcp.M116.058164

The Arabidopsis leaf transcriptome reveals distinct but also overlapping responses to colonization by phyllosphere commensals and pathogen infection with impact on plant health

Autori: Christine Vogel, Natacha Bodenhausen, Wilhelm Gruissem, Julia A. Vorholt
Pubblicato in: New Phytologist, Numero 212/1, 2016, Pagina/e 192-207, ISSN 0028-646X
Editore: Blackwell Publishing Inc.
DOI: 10.1111/nph.14036

Functional overlap of the Arabidopsis leaf and root microbiota

Autori: Yang Bai, Daniel B. Müller, Girish Srinivas, Ruben Garrido-Oter, Eva Potthoff, Matthias Rott, Nina Dombrowski, Philipp C. Münch, Stijn Spaepen, Mitja Remus-Emsermann, Bruno Hüttel, Alice C. McHardy, Julia A. Vorholt, Paul Schulze-Lefert
Pubblicato in: Nature, Numero 528/7582, 2015, Pagina/e 364-369, ISSN 0028-0836
Editore: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/nature16192

A modular atomic force microscopy approach reveals a large range of hydrophobic adhesion forces among bacterial members of the leaf microbiota

Autori: Maximilian Mittelviefhaus, Daniel B. Müller, Tomaso Zambelli, Julia A. Vorholt
Pubblicato in: The ISME Journal, Numero 13/7, 2019, Pagina/e 1878-1882, ISSN 1751-7362
Editore: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41396-019-0404-1