Genomics of Chromosome Architecture and Dynamics in Single Cells

Pubblicazioni

Local rewiring of genome–nuclear lamina interactions by transcription.

Autori: Brueckner L, Zhao PA, van Schaik T, Leemans C, Sima J, Peric-Hupkes D, Gilbert DM, van Steensel B
Pubblicato in: EMBO Journal, Numero 39, 2020, Pagina/e e103159, ISSN 0261-4189
Editore: Nature Publishing Group
DOI: 10.15252/embj.2019103159

Systematicanalysis of intrinsic enhancer-promoter compatibility in the mouse genome.

Autori: Martinez-Ara M, Comoglio F, van Arensbergen J, van Steensel B.
Pubblicato in: Mol. Cell, Numero 10972765, 2022, Pagina/e 2519-2531, ISSN 1097-2765
Editore: Cell Press
DOI: 10.1016/j.molcel.2022.04.009

CTCF and cohesin promote focal detachment of DNA from the nuclear lamina

Autori: van Schaik T, Liu NQ, Manzo SG, Peric-Hupkes D, de Wit E, van Steensel B.
Pubblicato in: Genome Biology, Numero 23, 2022, Pagina/e 185, ISSN 1465-6906
Editore: BMC/Springer Nature
DOI: 10.1186/s13059-022-02754-3

Impact of chromatin context on Cas9-induced DNA double-strand break repair pathway balance

Autori: Schep R, Brinkman EK, Leemans C, Vergara X, van der Weide RH, Morris B, van Schaik T, Manzo SG, Peric-Hupkes D, van den Berg J, Beijersbergen RL, Medema RH, van Steensel B
Pubblicato in: Mol. Cell, Numero 81, 2021, Pagina/e 2216-2230, ISSN 1097-2765
Editore: Cell Press
DOI: 10.1016/j.molcel.2021.03.032

Dynamic chromosomal interactions and control of heterochromatinpositioning by Ki-67.

Autori: van Schaik T, Manzo SG, Vouzas AE, Liu NQ, Teunissen H, de Wit E, Gilbert DM, van Steensel B.
Pubblicato in: EMBO Reports, Numero 1469221X, 2022, Pagina/e e55782, ISSN 1469-221X
Editore: Nature Publishing Group
DOI: 10.15252/embr.202255782

Kinetics and Fidelity of the Repair of Cas9-Induced Double-Strand DNA Breaks

Autori: Eva K. Brinkman, Tao Chen, Marcel de Haas, Hanna A. Holland, Waseem Akhtar, Bas van Steensel
Pubblicato in: Molecular Cell, Numero 70/5, 2018, Pagina/e 801-813.e6, ISSN 1097-2765
Editore: Cell Press
DOI: 10.1016/j.molcel.2018.04.016

Easy quantification of template-directed CRISPR/Cas9 editing

Autori: Eva K Brinkman, Arne N Kousholt, Tim Harmsen, Christ Leemans, Tao Chen, Jos Jonkers, Bas van Steensel
Pubblicato in: Nucleic Acids Research, Numero 46/10, 2018, Pagina/e e58-e58, ISSN 0305-1048
Editore: Oxford University Press
DOI: 10.1093/nar/gky164

High-throughput identification of human SNPs affecting regulatory element activity

Autori: Joris van Arensbergen, Ludo Pagie, Vincent D. FitzPatrick, Marcel de Haas, Marijke P. Baltissen, Federico Comoglio, Robin H. van der Weide, Hans Teunissen, Urmo Võsa, Lude Franke, Elzo de Wit, Michiel Vermeulen, Harmen J. Bussemaker, Bas van Steensel
Pubblicato in: Nature Genetics, Numero 51/7, 2019, Pagina/e 1160-1169, ISSN 1061-4036
Editore: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41588-019-0455-2

The role of transcription in shaping the spatial organization of the genome

Autori: Bas van Steensel, Eileen E. M. Furlong
Pubblicato in: Nature Reviews Molecular Cell Biology, Numero 20/6, 2019, Pagina/e 327-337, ISSN 1471-0072
Editore: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41580-019-0114-6

The large fraction of heterochromatin in Drosophila neurons is bound by both B-type lamin and HP1a

Autori: Alexey V. Pindyurin, Artem A. Ilyin, Anton V. Ivankin, Mikhail V. Tselebrovsky, Valentina V. Nenasheva, Elena A. Mikhaleva, Ludo Pagie, Bas van Steensel, Yuri Y. Shevelyov
Pubblicato in: Epigenetics & Chromatin, Numero 11/1, 2018, ISSN 1756-8935
Editore: BioMed Central
DOI: 10.1186/s13072-018-0235-8

Promoter-Intrinsic and Local Chromatin Features Determine Gene Repression in LADs

Autori: Christ Leemans, Marloes C.H. van der Zwalm, Laura Brueckner, Federico Comoglio, Tom van Schaik, Ludo Pagie, Joris van Arensbergen, Bas van Steensel
Pubblicato in: Cell, Numero 177/4, 2019, Pagina/e 852-864.e14, ISSN 0092-8674
Editore: Cell Press
DOI: 10.1016/j.cell.2019.03.009

È in corso la ricerca di dati su OpenAIRE...

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