Genomics of Chromosome Architecture and Dynamics in Single Cells

Informacje na temat projektu

GoCADiSC

Identyfikator umowy o grant: 694466

DOI

10.3030/694466

Projekt został zamknięty

Data podpisania przez KE 20 Maja 2016

Data rozpoczęcia 1 Marca 2017

Data zakończenia 31 Sierpnia 2022

Finansowanie w ramach

• EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)

Koszt całkowity

€ 2 497 125,00

Wkład UE

€ 2 497 125,00

Koordynowany przez

STICHTING HET NEDERLANDS KANKER INSTITUUT-ANTONI VAN LEEUWENHOEK ZIEKENHUIS
Netherlands

CORDIS oferuje możliwość skorzystania z odnośników do publicznie dostępnych publikacji i rezultatów projektów realizowanych w ramach programów ramowych HORYZONT.

Odnośniki do rezultatów i publikacji związanych z poszczególnymi projektami 7PR, a także odnośniki do niektórych konkretnych kategorii wyników, takich jak zbiory danych i oprogramowanie, są dynamicznie pobierane z systemu OpenAIRE .

Publikacje

Peer reviewed articles (11)

Local rewiring of genome–nuclear lamina interactions by transcription.

Autorzy: Brueckner L, Zhao PA, van Schaik T, Leemans C, Sima J, Peric-Hupkes D, Gilbert DM, van Steensel B
Opublikowane w: EMBO Journal, Numer 39, 2020, Strona(/y) e103159, ISSN 0261-4189
Wydawca: Nature Publishing Group
DOI: 10.15252/embj.2019103159

Systematicanalysis of intrinsic enhancer-promoter compatibility in the mouse genome.

Autorzy: Martinez-Ara M, Comoglio F, van Arensbergen J, van Steensel B.
Opublikowane w: Mol. Cell, Numer 10972765, 2022, Strona(/y) 2519-2531, ISSN 1097-2765
Wydawca: Cell Press
DOI: 10.1016/j.molcel.2022.04.009

CTCF and cohesin promote focal detachment of DNA from the nuclear lamina

Autorzy: van Schaik T, Liu NQ, Manzo SG, Peric-Hupkes D, de Wit E, van Steensel B.
Opublikowane w: Genome Biology, Numer 23, 2022, Strona(/y) 185, ISSN 1465-6906
Wydawca: BMC/Springer Nature
DOI: 10.1186/s13059-022-02754-3

Impact of chromatin context on Cas9-induced DNA double-strand break repair pathway balance

Autorzy: Schep R, Brinkman EK, Leemans C, Vergara X, van der Weide RH, Morris B, van Schaik T, Manzo SG, Peric-Hupkes D, van den Berg J, Beijersbergen RL, Medema RH, van Steensel B
Opublikowane w: Mol. Cell, Numer 81, 2021, Strona(/y) 2216-2230, ISSN 1097-2765
Wydawca: Cell Press
DOI: 10.1016/j.molcel.2021.03.032

Dynamic chromosomal interactions and control of heterochromatinpositioning by Ki-67.

Autorzy: van Schaik T, Manzo SG, Vouzas AE, Liu NQ, Teunissen H, de Wit E, Gilbert DM, van Steensel B.
Opublikowane w: EMBO Reports, Numer 1469221X, 2022, Strona(/y) e55782, ISSN 1469-221X
Wydawca: Nature Publishing Group
DOI: 10.15252/embr.202255782

Kinetics and Fidelity of the Repair of Cas9-Induced Double-Strand DNA Breaks

Autorzy: Eva K. Brinkman, Tao Chen, Marcel de Haas, Hanna A. Holland, Waseem Akhtar, Bas van Steensel
Opublikowane w: Molecular Cell, Numer 70/5, 2018, Strona(/y) 801-813.e6, ISSN 1097-2765
Wydawca: Cell Press
DOI: 10.1016/j.molcel.2018.04.016

Easy quantification of template-directed CRISPR/Cas9 editing

Autorzy: Eva K Brinkman, Arne N Kousholt, Tim Harmsen, Christ Leemans, Tao Chen, Jos Jonkers, Bas van Steensel
Opublikowane w: Nucleic Acids Research, Numer 46/10, 2018, Strona(/y) e58-e58, ISSN 0305-1048
Wydawca: Oxford University Press
DOI: 10.1093/nar/gky164

High-throughput identification of human SNPs affecting regulatory element activity

Autorzy: Joris van Arensbergen, Ludo Pagie, Vincent D. FitzPatrick, Marcel de Haas, Marijke P. Baltissen, Federico Comoglio, Robin H. van der Weide, Hans Teunissen, Urmo Võsa, Lude Franke, Elzo de Wit, Michiel Vermeulen, Harmen J. Bussemaker, Bas van Steensel
Opublikowane w: Nature Genetics, Numer 51/7, 2019, Strona(/y) 1160-1169, ISSN 1061-4036
Wydawca: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41588-019-0455-2

The role of transcription in shaping the spatial organization of the genome

Autorzy: Bas van Steensel, Eileen E. M. Furlong
Opublikowane w: Nature Reviews Molecular Cell Biology, Numer 20/6, 2019, Strona(/y) 327-337, ISSN 1471-0072
Wydawca: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41580-019-0114-6

The large fraction of heterochromatin in Drosophila neurons is bound by both B-type lamin and HP1a

Autorzy: Alexey V. Pindyurin, Artem A. Ilyin, Anton V. Ivankin, Mikhail V. Tselebrovsky, Valentina V. Nenasheva, Elena A. Mikhaleva, Ludo Pagie, Bas van Steensel, Yuri Y. Shevelyov
Opublikowane w: Epigenetics & Chromatin, Numer 11/1, 2018, ISSN 1756-8935
Wydawca: BioMed Central
DOI: 10.1186/s13072-018-0235-8

Promoter-Intrinsic and Local Chromatin Features Determine Gene Repression in LADs

Autorzy: Christ Leemans, Marloes C.H. van der Zwalm, Laura Brueckner, Federico Comoglio, Tom van Schaik, Ludo Pagie, Joris van Arensbergen, Bas van Steensel
Opublikowane w: Cell, Numer 177/4, 2019, Strona(/y) 852-864.e14, ISSN 0092-8674
Wydawca: Cell Press
DOI: 10.1016/j.cell.2019.03.009