Cel
Non-native conformations of proteins have recently attracted considerable attention in molecular and cell biology. Bionformatics studies of complete genomes suggested that a fairly large fraction of the proteins encoded by the DNA of different organisms ma y contain unstructured regions in the cell. Partially folded states of proteins have also been associated with misfolding diseases, such as Alzheimer's, type II diabetes and the transmissible encephalophaties.
In this research plan I propose to develop a strategy that uses experimental chemical shifts as a bias in computer simulations to determine the ensembles of structures corresponding to non-native states of proteins. Chemical shifts represent the diamagnetic screening on the atomic nuclei created by nearby electronic currents. They are relatively easy to measure experimentally by nuclear magnetic resonance (NMR) spectroscopy and they can be translated into structural information.
The proposed method will be applied using recent experimental results about the partially folded states of alpha-lactalbumin and Staphylococcal Nuclease. A combination of experiments and simulations will be carried out in order to characterize the mechanism of folding and the free energy landscape of these proteins. It will also be possible to study of the effect of mutations on the structure of native and partially folded states of proteins. Planned applications will include a study of Bovine pancreatic trypsin inhibitor (BTPTI), the SH3 (drk) domain and Barnase.
Dziedzina nauki (EuroSciVoc)
Klasyfikacja projektów w serwisie CORDIS opiera się na wielojęzycznej taksonomii EuroSciVoc, obejmującej wszystkie dziedziny nauki, w oparciu o półautomatyczny proces bazujący na technikach przetwarzania języka naturalnego. Więcej informacji: Europejski Słownik Naukowy.
Klasyfikacja projektów w serwisie CORDIS opiera się na wielojęzycznej taksonomii EuroSciVoc, obejmującej wszystkie dziedziny nauki, w oparciu o półautomatyczny proces bazujący na technikach przetwarzania języka naturalnego. Więcej informacji: Europejski Słownik Naukowy.
- nauki przyrodnicze nauki biologiczne biochemia biocząsteczki białka
- nauki przyrodnicze nauki biologiczne biologia komórki
- nauki przyrodnicze nauki biologiczne genetyka mutacja
- nauki przyrodnicze nauki fizyczne optyka spektroskopia
- nauki przyrodnicze matematyka matematyka stosowana model matematyczny
Aby użyć tej funkcji, musisz się zalogować lub zarejestrować
Program(-y)
Wieloletnie programy finansowania, które określają priorytety Unii Europejskiej w obszarach badań naukowych i innowacji.
Wieloletnie programy finansowania, które określają priorytety Unii Europejskiej w obszarach badań naukowych i innowacji.
Temat(-y)
Zaproszenia do składania wniosków dzielą się na tematy. Każdy temat określa wybrany obszar lub wybrane zagadnienie, których powinny dotyczyć wnioski składane przez wnioskodawców. Opis tematu obejmuje jego szczegółowy zakres i oczekiwane oddziaływanie finansowanego projektu.
Zaproszenia do składania wniosków dzielą się na tematy. Każdy temat określa wybrany obszar lub wybrane zagadnienie, których powinny dotyczyć wnioski składane przez wnioskodawców. Opis tematu obejmuje jego szczegółowy zakres i oczekiwane oddziaływanie finansowanego projektu.
Zaproszenie do składania wniosków
Procedura zapraszania wnioskodawców do składania wniosków projektowych w celu uzyskania finansowania ze środków Unii Europejskiej.
Procedura zapraszania wnioskodawców do składania wniosków projektowych w celu uzyskania finansowania ze środków Unii Europejskiej.
FP6-2002-MOBILITY-5
Zobacz inne projekty w ramach tego zaproszenia
System finansowania
Program finansowania (lub „rodzaj działania”) realizowany w ramach programu o wspólnych cechach. Określa zakres finansowania, stawkę zwrotu kosztów, szczegółowe kryteria oceny kwalifikowalności kosztów w celu ich finansowania oraz stosowanie uproszczonych form rozliczania kosztów, takich jak rozliczanie ryczałtowe.
Program finansowania (lub „rodzaj działania”) realizowany w ramach programu o wspólnych cechach. Określa zakres finansowania, stawkę zwrotu kosztów, szczegółowe kryteria oceny kwalifikowalności kosztów w celu ich finansowania oraz stosowanie uproszczonych form rozliczania kosztów, takich jak rozliczanie ryczałtowe.
Koordynator
CAMBRIDGE
Zjednoczone Królestwo
Ogół kosztów poniesionych przez organizację w związku z uczestnictwem w projekcie. Obejmuje koszty bezpośrednie i pośrednie. Kwota stanowi część całkowitego budżetu projektu.