Interaction Dynamics of Bacterial Biofilms with Bacteriophages

Veröffentlichungen

Advances and opportunities in image analysis of bacterial cells and communities

Autoren: Hannah Jeckel, Knut Drescher
Veröffentlicht in: FEMS Microbiology Reviews, Ausgabe 45/4, 2021, ISSN 1574-6976
Herausgeber: Oxford University Press
DOI: 10.1093/femsre/fuaa062

Multicellular and unicellular responses of microbial biofilms to stress

Autoren: Daniel K.H. Rode, Praveen K. Singh, Knut Drescher
Veröffentlicht in: Biological Chemistry, Ausgabe 401/12, 2020, Seite(n) 1365-1374, ISSN 1431-6730
Herausgeber: Walter de Gruyter GmbH & Co. KG
DOI: 10.1515/hsz-2020-0213

BacStalk: A comprehensive and interactive image analysis software tool for bacterial cell biology

Autoren: Raimo Hartmann, Muriel C. F. Teeseling, Martin Thanbichler, Knut Drescher
Veröffentlicht in: Molecular Microbiology, Ausgabe 114/1, 2020, Seite(n) 140-150, ISSN 0950-382X
Herausgeber: Blackwell Publishing Inc.
DOI: 10.1111/mmi.14501

Roadmap on emerging concepts in the physical biology of bacterial biofilms: From surface sensing to community formation

Autoren: Gerard C. L. Wong; Jyot D. Antani; Pushkar P. Lele; Jing Chen; Beiyan Nan; Marco Kühn; Alexandre Persat; Jean Louis Bru; Nina Molin Høyland-Kroghsbo; Albert Siryaporn; Jacinta C. Conrad; Francesco Carrara; Yutaka Yawata; Roman Stocker; Yves V. Brun; Gregory B. Whitfield; Calvin K. Lee; Jaime de Anda; William C. Schmidt; Ramin Golestanian; Ramin Golestanian; George A. O'Toole; Kyle A. Floyd; Fitn
Veröffentlicht in: Physical Biology, 18 (5), Ausgabe 5, 2021, ISSN 1478-3975
Herausgeber: IOP Publishing
DOI: 10.1088/1478-3975/abdc0e

Upregulation of virulence genes promotes Vibrio cholerae biofilm hyperinfectivity

Autoren: A. L. Gallego-Hernandez, W. H. DePas, J. H. Park, J. K. Teschler, R. Hartmann, H. Jeckel, K. Drescher, S. Beyhan, D. K. Newman, F. H. Yildiz
Veröffentlicht in: Proceedings of the National Academy of Sciences, Ausgabe 117/20, 2020, Seite(n) 11010-11017, ISSN 0027-8424
Herausgeber: National Academy of Sciences
DOI: 10.1073/pnas.1916571117

Biofilm Structure Promotes Coexistence of Phage-Resistant and Phage-Susceptible Bacteria

Autoren: Emilia L. Simmons, Matthew C. Bond, Britt Koskella, Knut Drescher, Vanni Bucci, Carey D. Nadell
Veröffentlicht in: mSystems, Ausgabe 5/3, 2020, ISSN 2379-5077
Herausgeber: American Society of Microbiology
DOI: 10.1128/msystems.00877-19

Breakdown of Vibrio cholerae biofilm architecture induced by antibiotics disrupts community barrier function

Autoren: Francisco Díaz-Pascual, Raimo Hartmann, Martin Lempp, Lucia Vidakovic, Boya Song, Hannah Jeckel, Kai M. Thormann, Fitnat H. Yildiz, Jörn Dunkel, Hannes Link, Carey D. Nadell, Knut Drescher
Veröffentlicht in: Nature Microbiology, Ausgabe 4/12, 2019, Seite(n) 2136-2145, ISSN 2058-5276
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41564-019-0579-2

Interkingdom assemblages in human saliva display group-level surface mobility and disease-promoting emergent functions

Autoren: Zhi Ren, Hannah Jeckel, Aurea Simon-Soro, Zhenting Xiang, Yuan Liu, Indira M. Cavalcanti, Jin Xiao, Nyi-Nyi, Anderson Hara, Knut Drescher, Hyun Koo
Veröffentlicht in: Proceedings of the National Academy of Sciences, Ausgabe 00278424, 2022, ISSN 0027-8424
Herausgeber: National Academy of Sciences
DOI: 10.1073/pnas.2209699119

Single-objective high-resolution confocal light sheet fluorescence microscopy for standard biological sample geometries

Autoren: Stoyan Yordanov, Konstantin Neuhaus, Raimo Hartmann, Francisco Díaz-Pascual, Lucia Vidakovic, Praveen K. Singh, Knut Drescher
Veröffentlicht in: Biomedical Optics Express, Ausgabe 12/6, 2021, Seite(n) 3372, ISSN 2156-7085
Herausgeber: The Optical Society
DOI: 10.1364/boe.420788

Topological Metric Detects Hidden Order in Disordered Media

Autoren: Dominic J. Skinner, Boya Song, Hannah Jeckel, Eric Jelli, Knut Drescher, Jörn Dunkel
Veröffentlicht in: Physical Review Letters, Ausgabe 126/4, 2021, ISSN 0031-9007
Herausgeber: American Physical Society
DOI: 10.1103/physrevlett.126.048101

Privatization of Biofilm Matrix in Structurally Heterogeneous Biofilms

Autoren: Simon B. Otto, Marivic Martin, Daniel Schäfer, Raimo Hartmann, Knut Drescher, Susanne Brix, Anna Dragoš, Ákos T. Kovács
Veröffentlicht in: mSystems, Ausgabe 5/4, 2020, ISSN 2379-5077
Herausgeber: American Society of Microbiology
DOI: 10.1128/msystems.00425-20

Division of Labor during Biofilm Matrix Production

Autoren: Anna Dragoš, Heiko Kiesewalter, Marivic Martin, Chih-Yu Hsu, Raimo Hartmann, Tobias Wechsler, Carsten Eriksen, Susanne Brix, Knut Drescher, Nicola Stanley-Wall, Rolf Kümmerli, Ákos T. Kovács
Veröffentlicht in: Current Biology, Ausgabe 28/12, 2018, Seite(n) 1903-1913.e5, ISSN 0960-9822
Herausgeber: Cell Press
DOI: 10.1016/j.cub.2018.04.046

Phage mobility is a core determinant of phage–bacteria coexistence in biofilms

Autoren: Matthew Simmons, Knut Drescher, Carey D Nadell, Vanni Bucci
Veröffentlicht in: The ISME Journal, Ausgabe 12/2, 2017, Seite(n) 531-543, ISSN 1751-7362
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/ismej.2017.190

Cell adhesion and fluid flow jointly initiate genotype spatial distribution in biofilms

Autoren: Ricardo Martínez-García, Carey D. Nadell, Raimo Hartmann, Knut Drescher, Juan A. Bonachela
Veröffentlicht in: PLOS Computational Biology, Ausgabe 14/4, 2018, Seite(n) e1006094, ISSN 1553-7358
Herausgeber: PLOS Computational Biology
DOI: 10.1371/journal.pcbi.1006094

Vibrio cholerae Combines Individual and Collective Sensing to Trigger Biofilm Dispersal

Autoren: Praveen K. Singh, Sabina Bartalomej, Raimo Hartmann, Hannah Jeckel, Lucia Vidakovic, Carey D. Nadell, Knut Drescher
Veröffentlicht in: Current Biology, Ausgabe 27/21, 2017, Seite(n) 3359-3366.e7, ISSN 0960-9822
Herausgeber: Cell Press
DOI: 10.1016/j.cub.2017.09.041

Dynamic biofilm architecture confers individual and collective mechanisms of viral protection

Autoren: Lucia Vidakovic, Praveen K. Singh, Raimo Hartmann, Carey D. Nadell, Knut Drescher
Veröffentlicht in: Nature Microbiology, Ausgabe 3/1, 2018, Seite(n) 26-31, ISSN 2058-5276
Herausgeber: Nature Microbiology
DOI: 10.1038/s41564-017-0050-1

Learning the space-time phase diagram of bacterial swarm expansion

Autoren: Hannah Jeckel, Eric Jelli, Raimo Hartmann, Praveen K. Singh, Rachel Mok, Jan Frederik Totz, Lucia Vidakovic, Bruno Eckhardt, Jörn Dunkel, Knut Drescher
Veröffentlicht in: Proceedings of the National Academy of Sciences, Ausgabe 116/5, 2019, Seite(n) 1489-1494, ISSN 0027-8424
Herausgeber: National Academy of Sciences
DOI: 10.1073/pnas.1811722116

Emergence of three-dimensional order and structure in growing biofilms

Autoren: Raimo Hartmann, Praveen K. Singh, Philip Pearce, Rachel Mok, Boya Song, Francisco Díaz-Pascual, Jörn Dunkel, Knut Drescher
Veröffentlicht in: Nature Physics, Ausgabe 15/3, 2019, Seite(n) 251-256, ISSN 1745-2473
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41567-018-0356-9

Quantitative image analysis of microbial communities with BiofilmQ

Autoren: Raimo Hartmann, Hannah Jeckel, Eric Jelli, Praveen K. Singh, Sanika Vaidya, Miriam Bayer, Daniel K. H. Rode, Lucia Vidakovic, Francisco Díaz-Pascual, Jiunn C. N. Fong, Anna Dragoš, Olga Lamprecht, Janne G. Thöming, Niklas Netter, Susanne Häussler, Carey D. Nadell, Victor Sourjik, Ákos T. Kovács, Fitnat H. Yildiz, Knut Drescher
Veröffentlicht in: Nature Microbiology, Ausgabe 6/2, 2021, Seite(n) 151-156, ISSN 2058-5276
Herausgeber: Nature Publication Group
DOI: 10.1038/s41564-020-00817-4

Matrix-trapped viruses can prevent invasion of bacterial biofilms by colonizing cells

Autoren: Matthew C Bond, Lucia Vidakovic, Praveen K Singh, Knut Drescher, Carey D Nadell
Veröffentlicht in: eLife, Ausgabe 10, 2021, ISSN 2050-084X
Herausgeber: eLife Sciences Publications
DOI: 10.7554/elife.65355

RNA-mediated control of cell shape modulates antibiotic resistance in Vibrio cholerae

Autoren: Nikolai Peschek, Roman Herzog, Praveen K. Singh, Marcel Sprenger, Fabian Meyer, Kathrin S. Fröhlich, Luise Schröger, Marc Bramkamp, Knut Drescher, Kai Papenfort
Veröffentlicht in: Nature Communications, Ausgabe 11/1, 2020, ISSN 2041-1723
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-020-19890-8

VxrB Influences Antagonism within Biofilms by Controlling Competition through Extracellular Matrix Production and Type 6 Secretion

Autoren: Jennifer K. Teschler; Eva Jiménez-Siebert; Hannah Jeckel; Praveen K. Singh; Jin Hwan Park; Stefan Pukatzki; Carey D. Nadell; Knut Drescher; Fitnat H. Yildiz
Veröffentlicht in: mBio, Ausgabe 21507511, 2022, ISSN 2150-7511
Herausgeber: American Society for Microbiology
DOI: 10.1128/mbio.01885-22

A tyrosine phosphoregulatory system controls exopolysaccharide biosynthesis and biofilm formation in Vibrio cholerae

Autoren: Carmen Schwechheimer, Kassidy Hebert, Sarvind Tripathi, Praveen K. Singh, Kyle A. Floyd, Elise R. Brown, Monique E. Porcella, Jacqueline Osorio, Joseph T. M. Kiblen, Fernando A. Pagliai, Knut Drescher, Seth M. Rubin, Fitnat H. Yildiz
Veröffentlicht in: PLOS Pathogens, Ausgabe 16/8, 2020, Seite(n) e1008745, ISSN 1553-7374
Herausgeber: PLOS
DOI: 10.1371/journal.ppat.1008745

Flow-Induced Symmetry Breaking in Growing Bacterial Biofilms

Autoren: Philip Pearce, Boya Song, Dominic J. Skinner, Rachel Mok, Raimo Hartmann, Praveen K. Singh, Hannah Jeckel, Jeffrey S. Oishi, Knut Drescher, Jörn Dunkel
Veröffentlicht in: Physical Review Letters, Ausgabe 123/25, 2019, ISSN 0031-9007
Herausgeber: American Physical Society
DOI: 10.1103/physrevlett.123.258101

Vibrio cholerae biofilm scaffolding protein RbmA shows an intrinsic, phosphate‐dependent autoproteolysis activity

Autoren: Manuel Maestre‐Reyna, Wei‐Cheng Huang, Wen‐Jin Wu, Praveen K. Singh, Raimo Hartmann, Po‐Hsun Wang, Cheng‐Chung Lee, Takaaki Hikima, Masaki Yamamoto, Yoshitaka Bessho, Knut Drescher, Ming‐Daw Tsai, Andrew H.‐J. Wang
Veröffentlicht in: IUBMB Life, Ausgabe 73/2, 2021, Seite(n) 418-431, ISSN 1521-6543
Herausgeber: Taylor & Francis
DOI: 10.1002/iub.2439

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