Dissection of Glycan Function by Engineered Tissue Models

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Veröffentlichungen

CRISPR-screen identifies ZIP9 and dysregulated Zn2+ homeostasis as a cause of cancer-associated changes in glycosylation

Autoren: Troels Boldt Rømer; Fawzi Khoder-Agha; Mikkel Koed Møller Aasted; Noortje de Haan; Sabrina Horn; August Dylander; Tao Zhang; Emil Marek Heymans Pallesen; Sally Dabelsteen; Manfred Wuhrer; Christine Flodgaard Høgsbro; Emil Aagaard Thomsen; Jacob Giehm Mikkelsen; Hans H Wandall
Veröffentlicht in: Glycobiology, Ausgabe 2, 2023, ISSN 1460-2423
Herausgeber: Oxford Journals
DOI: 10.1093/glycob/cwad003

O‐glycan initiation directs distinct biological pathways and controls epithelial differentiation

Autoren: Ieva Bagdonaite, Emil MH Pallesen, Zilu Ye, Sergey Y Vakhrushev, Irina N Marinova, Mathias I Nielsen, Signe H Kramer, Stine F Pedersen, Hiren J Joshi, Eric P Bennett, Sally Dabelsteen, Hans H Wandall
Veröffentlicht in: EMBO reports, Ausgabe 21/6, 2020, ISSN 1469-221X
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.15252/embr.201948885

Global aspects of viral glycosylation

Autoren: Ieva Bagdonaite, Hans H Wandall
Veröffentlicht in: Glycobiology, Ausgabe 28/7, 2018, Seite(n) 443-467, ISSN 1460-2423
Herausgeber: Oxford Academic
DOI: 10.1093/glycob/cwy021

Reading and Writing the Human Glycocode

Autoren: Noortje de Haan, Mathias I. Nielsen, Hans H. Wandall
Veröffentlicht in: Annual Review of Biochemistry, Ausgabe 93, 2024, Seite(n) 529-564, ISSN 0066-4154
Herausgeber: Annual Reviews, Inc.
DOI: 10.1146/annurev-biochem-030122-044347

Developments and perspectives in high-throughput protein glycomics: enabling the analysis of thousands of samples

Autoren: Noortje de Haan, Maja Pučić-Baković, Mislav Novokmet, David Falck, Guinevere Lageveen-Kammeijer, Genadij Razdorov, Frano Vučković, Irena Trbojević-Akmačić, Olga Gornik, Maja Hanić, Manfred Wuhrer, Gordan Lauc, null null, Andras Guttman, Richard Cummings, Samia Mora, Yoann Rombouts, Andad Mehta
Veröffentlicht in: Glycobiology, Ausgabe 32, 2022, Seite(n) 651-663, ISSN 1460-2423
Herausgeber: Oxford University Press
DOI: 10.1093/glycob/cwac026

Global mapping of GalNAc-T isoform-specificities and O-glycosylation site-occupancy in a tissue-forming human cell line

Autoren: Mathias I. Nielsen, Noortje de Haan, Weston Kightlinger, Zilu Ye, Sally Dabelsteen, Minyan Li, Michael C. Jewett, Ieva Bagdonaite, Sergey Y. Vakhrushev, Hans H. Wandall
Veröffentlicht in: Nature Communications, Ausgabe 13, 2024, ISSN 2041-1723
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-022-33806-8

Binding of Akkermansia muciniphila to mucin is O-glycan specific

Autoren: Janneke Elzinga, Yoshiki Narimatsu, Noortje de Haan, Henrik Clausen, Willem M. de Vos, Hanne L. P. Tytgat
Veröffentlicht in: Nature Communications, Ausgabe 15, 2024, ISSN 2041-1723
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-024-48770-8

Cytoplasmic Citrate Flux Modulates the Immune Stimulatory NKG2D Ligand MICA in Cancer Cells

Autoren: Sofie H. Møller, Maiken Mellergaard, Mikkel Madsen, Amaia V. Bermejo, Stine D. Jepsen, Marie H. Hansen, Rikke I. Høgh, Blanca I. Aldana, Claus Desler, Lene Juel Rasmussen, Elahu G. Sustarsic, Zachary Gerhart-Hines, Evangelia Daskalaki, Craig E. Wheelock, Thomas K. Hiron, Da Lin, Christopher A. O’Callaghan, Hans H. Wandall, Lars Andresen, Søren Skov
Veröffentlicht in: Frontiers in Immunology, Ausgabe 11, 2020, ISSN 1664-3224
Herausgeber: Frontiers
DOI: 10.3389/fimmu.2020.01968

Role of N-Glycosylation in FcγRIIIa interaction with IgG

Autoren: Julie Van Coillie, Morten A. Schulz, Arthur E. H. Bentlage, Noortje de Haan, Zilu Ye, Dionne M. Geerdes, Wim J. E. van Esch, Lise Hafkenscheid, Rebecca L. Miller, Yoshiki Narimatsu, Sergey Y. Vakhrushev, Zhang Yang, Gestur Vidarsson, Henrik Clausen
Veröffentlicht in: Frontiers in Immunology, Ausgabe 13, 2023, ISSN 1664-3224
Herausgeber: Frontiers
DOI: 10.3389/fimmu.2022.987151

Glycoproteomics

Autoren: Ieva Bagdonaite, Stacy A. Malaker, Daniel A. Polasky, Nicholas M. Riley, Katrine Schjoldager, Sergey Y. Vakhrushev, Adnan Halim, Kiyoko F. Aoki-Kinoshita, Alexey I. Nesvizhskii, Carolyn R. Bertozzi, Hans H. Wandall, Benjamin L. Parker, Morten Thaysen-Andersen, Nichollas E. Scott
Veröffentlicht in: Nature Reviews Methods Primers, Ausgabe 2, 2024, ISSN 2662-8449
Herausgeber: Nature
DOI: 10.1038/s43586-022-00128-4

Sensitive and Specific Global Cell Surface <i>N</i>-Glycoproteomics Shows Profound Differences Between Glycosylation Sites and Subcellular Components

Autoren: Noortje de Haan; Ming Song; Oliver C. Grant; Zilu Ye; Fawzi Khoder Agha; Mikkel Koed Møller Aasted; Robert J. Woods; Sergey Y. Vakhrushev; Hans H. Wandall
Veröffentlicht in: Analytical Chemistry, Ausgabe 3, 2023, ISSN 0003-2700
Herausgeber: American Chemical Society
DOI: 10.1021/acs.analchem.3c03626

INDEL detection, the ‘Achilles heel’ of precise genome editing: a survey of methods for accurate profiling of gene editing induced indels

Autoren: Eric Paul Bennett, Bent Larsen Petersen, Ida Elisabeth Johansen, Yiyuan Niu, Zhang Yang, Christopher Aled Chamberlain, Özcan Met, Hans H Wandall, Morten Frödin
Veröffentlicht in: Nucleic Acids Research, Ausgabe 48/21, 2020, Seite(n) 11958-11981, ISSN 0305-1048
Herausgeber: Oxford University Press
DOI: 10.1093/nar/gkaa975

Site-Specific O-Glycosylation Analysis of SARS-CoV-2 Spike Protein Produced in Insect and Human Cells

Autoren: Ieva Bagdonaite, Andrew J. Thompson, Xiaoning Wang, Max Søgaard, Cyrielle Fougeroux, Martin Frank, Jolene K. Diedrich, John R. Yates, Ali Salanti, Sergey Y. Vakhrushev, James C. Paulson, Hans H. Wandall
Veröffentlicht in: Viruses, Ausgabe 13/4, 2021, Seite(n) 551, ISSN 1999-4915
Herausgeber: Multidisciplinary Digital Publishing Institute (MDPI)
DOI: 10.3390/v13040551

Genetic glycoengineering in mammalian cells

Autoren: Yoshiki Narimatsu, Christian Büll, Yen-Hsi Chen, Hans H. Wandall, Zhang Yang, Henrik Clausen
Veröffentlicht in: Journal of Biological Chemistry, Ausgabe 296, 2021, Seite(n) 100448, ISSN 0021-9258
Herausgeber: American Society for Biochemistry and Molecular Biology Inc.
DOI: 10.1016/j.jbc.2021.100448

Galectin binding to cells and glycoproteins with genetically modified glycosylation reveals galectin–glycan specificities in a natural context

Autoren: Mathias Ingemann Nielsen, John Stegmayr, Oliver C. Grant, Zhang Yang, Ulf J. Nilsson, Irene Boos, Michael C. Carlsson, Robert J. Woods, Carlo Unverzagt, Hakon Leffler, Hans H. Wandall
Veröffentlicht in: Journal of Biological Chemistry, Ausgabe 293/52, 2018, Seite(n) 20249-20262, ISSN 0021-9258
Herausgeber: American Society for Biochemistry and Molecular Biology Inc.
DOI: 10.1074/jbc.ra118.004636

Quantitative characterization of O-GalNAc glycosylation

Autoren: Tomislav Čaval, Noortje de Haan, Andriana Konstantinidi, Sergey Y Vakhrushev
Veröffentlicht in: Current Opinion in Structural Biology, Ausgabe 68, 2023, Seite(n) 135-141, ISSN 0959-440X
Herausgeber: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.sbi.2020.12.010

Twin Prime Editing Mediated Exon Skipping/Reinsertion for Restored Collagen VII Expression in Recessive Dystrophic Epidermolysis Bullosa

Autoren: Benjamin J. Steinbeck, Xin D. Gao, Amber N. McElroy, Smriti Pandey, Jordan L. Doman, Megan J. Riddle, Lily Xia, Weili Chen, Cindy R. Eide, Andre H. Lengert, Sang Won Han, Bruce R. Blazar, Hans H. Wandall, Sally Dabelsteen, David R. Liu, Jakub Tolar, Mark J. Osborn
Veröffentlicht in: Journal of Investigative Dermatology, Ausgabe 144, 2024, Seite(n) 2764-2777.e9, ISSN 0022-202X
Herausgeber: Blackwell Publishing Inc.
DOI: 10.1016/j.jid.2024.04.013

Essential Functions of Glycans in Human Epithelia Dissected by a CRISPR-Cas9-Engineered Human Organotypic Skin Model

Autoren: Sally Dabelsteen, Emil M.H. Pallesen, Irina N. Marinova, Mathias I. Nielsen, Maria Adamopoulou, Troels B. Rømer, Asha Levann, Mikkel M. Andersen, Zilu Ye, David Thein, Eric P. Bennett, Christian Büll, Sam J. Moons, Thomas Boltje, Henrik Clausen, Sergey Y. Vakhrushev, Ieva Bagdonaite, Hans H. Wandall
Veröffentlicht in: Developmental Cell, Ausgabe 54/5, 2020, Seite(n) 669-684.e7, ISSN 1534-5807
Herausgeber: Cell Press
DOI: 10.1016/j.devcel.2020.06.039

In-Depth Profiling of <i>O</i>-Glycan Isomers in Human Cells Using C18 Nanoliquid Chromatography–Mass Spectrometry and Glycogenomics

Autoren: Noortje de Haan; Yoshiki Narimatsu; Mikkel Koed Møller Aasted; Ida S. B. Larsen; Irina N. Marinova; Sally Dabelsteen; Sergey Y. Vakhrushev; Hans H. Wandall
Veröffentlicht in: Analytical Chemistry, Ausgabe 2, 2022, ISSN 0003-2700
Herausgeber: American Chemical Society
DOI: 10.1021/acs.analchem.1c05068

Golgi fragmentation – One of the earliest organelle phenotypes in Alzheimer’s disease neurons

Autoren: Henriette Haukedal, Giulia I. Corsi, Veerendra P. Gadekar, Nadezhda T. Doncheva, Shekhar Kedia, Noortje de Haan, Abinaya Chandrasekaran, Pia Jensen, Pernille Schiønning, Sarah Vallin, Frederik Ravnkilde Marlet, Anna Poon, Carlota Pires, Fawzi Khoder Agha, Hans H. Wandall, Susanna Cirera, Anja Hviid Simonsen, Troels Tolstrup Nielsen, Jørgen Erik Nielsen, Poul Hyttel, Ravi Muddashetty, Blanca I. A
Veröffentlicht in: Frontiers in Neuroscience, Ausgabe 17, 2024, ISSN 1662-453X
Herausgeber: Frontiers
DOI: 10.3389/fnins.2023.1120086

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