Dissection of Glycan Function by Engineered Tissue Models

Informacje na temat projektu

GlycoSkin

Identyfikator umowy o grant: 772735

DOI

10.3030/772735

Projekt został zamknięty

Data podpisania przez KE 7 Lutego 2018

Data rozpoczęcia 1 Marca 2018

Data zakończenia 30 Listopada 2023

Finansowanie w ramach

• EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)

Koszt całkowity

€ 1 995 199,00

Wkład UE

€ 1 995 199,00

Koordynowany przez

KOBENHAVNS UNIVERSITET
Denmark

CORDIS oferuje możliwość skorzystania z odnośników do publicznie dostępnych publikacji i rezultatów projektów realizowanych w ramach programów ramowych HORYZONT.

Odnośniki do rezultatów i publikacji związanych z poszczególnymi projektami 7PR, a także odnośniki do niektórych konkretnych kategorii wyników, takich jak zbiory danych i oprogramowanie, są dynamicznie pobierane z systemu OpenAIRE .

Publikacje

Peer reviewed articles (20)

CRISPR-screen identifies ZIP9 and dysregulated Zn2+ homeostasis as a cause of cancer-associated changes in glycosylation

Autorzy: Troels Boldt Rømer; Fawzi Khoder-Agha; Mikkel Koed Møller Aasted; Noortje de Haan; Sabrina Horn; August Dylander; Tao Zhang; Emil Marek Heymans Pallesen; Sally Dabelsteen; Manfred Wuhrer; Christine Flodgaard Høgsbro; Emil Aagaard Thomsen; Jacob Giehm Mikkelsen; Hans H Wandall
Opublikowane w: Glycobiology, Numer 2, 2023, ISSN 1460-2423
Wydawca: Oxford Journals
DOI: 10.1093/glycob/cwad003

O‐glycan initiation directs distinct biological pathways and controls epithelial differentiation

Autorzy: Ieva Bagdonaite, Emil MH Pallesen, Zilu Ye, Sergey Y Vakhrushev, Irina N Marinova, Mathias I Nielsen, Signe H Kramer, Stine F Pedersen, Hiren J Joshi, Eric P Bennett, Sally Dabelsteen, Hans H Wandall
Opublikowane w: EMBO reports, Numer 21/6, 2020, ISSN 1469-221X
Wydawca: Nature Publishing Group
DOI: 10.15252/embr.201948885

Global aspects of viral glycosylation

Autorzy: Ieva Bagdonaite, Hans H Wandall
Opublikowane w: Glycobiology, Numer 28/7, 2018, Strona(/y) 443-467, ISSN 1460-2423
Wydawca: Oxford Academic
DOI: 10.1093/glycob/cwy021

Reading and Writing the Human Glycocode

Autorzy: Noortje de Haan, Mathias I. Nielsen, Hans H. Wandall
Opublikowane w: Annual Review of Biochemistry, Numer 93, 2024, Strona(/y) 529-564, ISSN 0066-4154
Wydawca: Annual Reviews, Inc.
DOI: 10.1146/annurev-biochem-030122-044347

Developments and perspectives in high-throughput protein glycomics: enabling the analysis of thousands of samples

Autorzy: Noortje de Haan, Maja Pučić-Baković, Mislav Novokmet, David Falck, Guinevere Lageveen-Kammeijer, Genadij Razdorov, Frano Vučković, Irena Trbojević-Akmačić, Olga Gornik, Maja Hanić, Manfred Wuhrer, Gordan Lauc, null null, Andras Guttman, Richard Cummings, Samia Mora, Yoann Rombouts, Andad Mehta
Opublikowane w: Glycobiology, Numer 32, 2022, Strona(/y) 651-663, ISSN 1460-2423
Wydawca: Oxford University Press
DOI: 10.1093/glycob/cwac026

Global mapping of GalNAc-T isoform-specificities and O-glycosylation site-occupancy in a tissue-forming human cell line

Autorzy: Mathias I. Nielsen, Noortje de Haan, Weston Kightlinger, Zilu Ye, Sally Dabelsteen, Minyan Li, Michael C. Jewett, Ieva Bagdonaite, Sergey Y. Vakhrushev, Hans H. Wandall
Opublikowane w: Nature Communications, Numer 13, 2024, ISSN 2041-1723
Wydawca: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-022-33806-8

Binding of Akkermansia muciniphila to mucin is O-glycan specific

Autorzy: Janneke Elzinga, Yoshiki Narimatsu, Noortje de Haan, Henrik Clausen, Willem M. de Vos, Hanne L. P. Tytgat
Opublikowane w: Nature Communications, Numer 15, 2024, ISSN 2041-1723
Wydawca: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-024-48770-8

Cytoplasmic Citrate Flux Modulates the Immune Stimulatory NKG2D Ligand MICA in Cancer Cells

Autorzy: Sofie H. Møller, Maiken Mellergaard, Mikkel Madsen, Amaia V. Bermejo, Stine D. Jepsen, Marie H. Hansen, Rikke I. Høgh, Blanca I. Aldana, Claus Desler, Lene Juel Rasmussen, Elahu G. Sustarsic, Zachary Gerhart-Hines, Evangelia Daskalaki, Craig E. Wheelock, Thomas K. Hiron, Da Lin, Christopher A. O’Callaghan, Hans H. Wandall, Lars Andresen, Søren Skov
Opublikowane w: Frontiers in Immunology, Numer 11, 2020, ISSN 1664-3224
Wydawca: Frontiers
DOI: 10.3389/fimmu.2020.01968

Role of N-Glycosylation in FcγRIIIa interaction with IgG

Autorzy: Julie Van Coillie, Morten A. Schulz, Arthur E. H. Bentlage, Noortje de Haan, Zilu Ye, Dionne M. Geerdes, Wim J. E. van Esch, Lise Hafkenscheid, Rebecca L. Miller, Yoshiki Narimatsu, Sergey Y. Vakhrushev, Zhang Yang, Gestur Vidarsson, Henrik Clausen
Opublikowane w: Frontiers in Immunology, Numer 13, 2023, ISSN 1664-3224
Wydawca: Frontiers
DOI: 10.3389/fimmu.2022.987151

Glycoproteomics

Autorzy: Ieva Bagdonaite, Stacy A. Malaker, Daniel A. Polasky, Nicholas M. Riley, Katrine Schjoldager, Sergey Y. Vakhrushev, Adnan Halim, Kiyoko F. Aoki-Kinoshita, Alexey I. Nesvizhskii, Carolyn R. Bertozzi, Hans H. Wandall, Benjamin L. Parker, Morten Thaysen-Andersen, Nichollas E. Scott
Opublikowane w: Nature Reviews Methods Primers, Numer 2, 2024, ISSN 2662-8449
Wydawca: Nature
DOI: 10.1038/s43586-022-00128-4

Sensitive and Specific Global Cell Surface <i>N</i>-Glycoproteomics Shows Profound Differences Between Glycosylation Sites and Subcellular Components

Autorzy: Noortje de Haan; Ming Song; Oliver C. Grant; Zilu Ye; Fawzi Khoder Agha; Mikkel Koed Møller Aasted; Robert J. Woods; Sergey Y. Vakhrushev; Hans H. Wandall
Opublikowane w: Analytical Chemistry, Numer 3, 2023, ISSN 0003-2700
Wydawca: American Chemical Society
DOI: 10.1021/acs.analchem.3c03626

INDEL detection, the ‘Achilles heel’ of precise genome editing: a survey of methods for accurate profiling of gene editing induced indels

Autorzy: Eric Paul Bennett, Bent Larsen Petersen, Ida Elisabeth Johansen, Yiyuan Niu, Zhang Yang, Christopher Aled Chamberlain, Özcan Met, Hans H Wandall, Morten Frödin
Opublikowane w: Nucleic Acids Research, Numer 48/21, 2020, Strona(/y) 11958-11981, ISSN 0305-1048
Wydawca: Oxford University Press
DOI: 10.1093/nar/gkaa975

Site-Specific O-Glycosylation Analysis of SARS-CoV-2 Spike Protein Produced in Insect and Human Cells

Autorzy: Ieva Bagdonaite, Andrew J. Thompson, Xiaoning Wang, Max Søgaard, Cyrielle Fougeroux, Martin Frank, Jolene K. Diedrich, John R. Yates, Ali Salanti, Sergey Y. Vakhrushev, James C. Paulson, Hans H. Wandall
Opublikowane w: Viruses, Numer 13/4, 2021, Strona(/y) 551, ISSN 1999-4915
Wydawca: Multidisciplinary Digital Publishing Institute (MDPI)
DOI: 10.3390/v13040551

Genetic glycoengineering in mammalian cells

Autorzy: Yoshiki Narimatsu, Christian Büll, Yen-Hsi Chen, Hans H. Wandall, Zhang Yang, Henrik Clausen
Opublikowane w: Journal of Biological Chemistry, Numer 296, 2021, Strona(/y) 100448, ISSN 0021-9258
Wydawca: American Society for Biochemistry and Molecular Biology Inc.
DOI: 10.1016/j.jbc.2021.100448

Galectin binding to cells and glycoproteins with genetically modified glycosylation reveals galectin–glycan specificities in a natural context

Autorzy: Mathias Ingemann Nielsen, John Stegmayr, Oliver C. Grant, Zhang Yang, Ulf J. Nilsson, Irene Boos, Michael C. Carlsson, Robert J. Woods, Carlo Unverzagt, Hakon Leffler, Hans H. Wandall
Opublikowane w: Journal of Biological Chemistry, Numer 293/52, 2018, Strona(/y) 20249-20262, ISSN 0021-9258
Wydawca: American Society for Biochemistry and Molecular Biology Inc.
DOI: 10.1074/jbc.ra118.004636

Quantitative characterization of O-GalNAc glycosylation

Autorzy: Tomislav Čaval, Noortje de Haan, Andriana Konstantinidi, Sergey Y Vakhrushev
Opublikowane w: Current Opinion in Structural Biology, Numer 68, 2023, Strona(/y) 135-141, ISSN 0959-440X
Wydawca: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.sbi.2020.12.010

Twin Prime Editing Mediated Exon Skipping/Reinsertion for Restored Collagen VII Expression in Recessive Dystrophic Epidermolysis Bullosa

Autorzy: Benjamin J. Steinbeck, Xin D. Gao, Amber N. McElroy, Smriti Pandey, Jordan L. Doman, Megan J. Riddle, Lily Xia, Weili Chen, Cindy R. Eide, Andre H. Lengert, Sang Won Han, Bruce R. Blazar, Hans H. Wandall, Sally Dabelsteen, David R. Liu, Jakub Tolar, Mark J. Osborn
Opublikowane w: Journal of Investigative Dermatology, Numer 144, 2024, Strona(/y) 2764-2777.e9, ISSN 0022-202X
Wydawca: Blackwell Publishing Inc.
DOI: 10.1016/j.jid.2024.04.013

Essential Functions of Glycans in Human Epithelia Dissected by a CRISPR-Cas9-Engineered Human Organotypic Skin Model

Autorzy: Sally Dabelsteen, Emil M.H. Pallesen, Irina N. Marinova, Mathias I. Nielsen, Maria Adamopoulou, Troels B. Rømer, Asha Levann, Mikkel M. Andersen, Zilu Ye, David Thein, Eric P. Bennett, Christian Büll, Sam J. Moons, Thomas Boltje, Henrik Clausen, Sergey Y. Vakhrushev, Ieva Bagdonaite, Hans H. Wandall
Opublikowane w: Developmental Cell, Numer 54/5, 2020, Strona(/y) 669-684.e7, ISSN 1534-5807
Wydawca: Cell Press
DOI: 10.1016/j.devcel.2020.06.039

In-Depth Profiling of <i>O</i>-Glycan Isomers in Human Cells Using C18 Nanoliquid Chromatography–Mass Spectrometry and Glycogenomics

Autorzy: Noortje de Haan; Yoshiki Narimatsu; Mikkel Koed Møller Aasted; Ida S. B. Larsen; Irina N. Marinova; Sally Dabelsteen; Sergey Y. Vakhrushev; Hans H. Wandall
Opublikowane w: Analytical Chemistry, Numer 2, 2022, ISSN 0003-2700
Wydawca: American Chemical Society
DOI: 10.1021/acs.analchem.1c05068

Golgi fragmentation – One of the earliest organelle phenotypes in Alzheimer’s disease neurons

Autorzy: Henriette Haukedal, Giulia I. Corsi, Veerendra P. Gadekar, Nadezhda T. Doncheva, Shekhar Kedia, Noortje de Haan, Abinaya Chandrasekaran, Pia Jensen, Pernille Schiønning, Sarah Vallin, Frederik Ravnkilde Marlet, Anna Poon, Carlota Pires, Fawzi Khoder Agha, Hans H. Wandall, Susanna Cirera, Anja Hviid Simonsen, Troels Tolstrup Nielsen, Jørgen Erik Nielsen, Poul Hyttel, Ravi Muddashetty, Blanca I. A
Opublikowane w: Frontiers in Neuroscience, Numer 17, 2024, ISSN 1662-453X
Wydawca: Frontiers
DOI: 10.3389/fnins.2023.1120086