Opis projektu
Mapowanie powiązań międzygatunkowych w badaniach nad genomiką
Klasyczne podejście do genetyki nie umożliwia badania wariacji pomiędzy gatunkami, jako że odmienne gatunki nie mogą się krzyżować, zaś ich genomy są zwykle w dużej mierze zmienione. W związku z tym twórcy finansowanego ze środków UE projektu INTERACT zamierzają opracować metody oparte na genomice i wykorzystać je do mapowania powiązań pomiędzy gatunkami (powiązań filogenetycznych). Pozwoliłoby to na odkrycie określonych sygnałów w bardzo odmiennych genomach różnych gatunków. Podejście to zostanie zwalidowane poprzez zastosowanie go do badania różnic w zakresie metabolitów wtórnych u roślin z rodziny kapustowatych. Wybrano ten właśnie czynnik, jako że metabolity wtórne cechują się dużą odmiennością, a przy tym są powszechnie stosowane w profilaktyce nowotworów, zwalczaniu szkodników oraz projektowaniu żywności. Prace badaczy i uzyskane przez nich wyniki przyczynią się do dużych postępów w genetyce.
Cel
During the past years, great progress has been made in connecting phenotypes to genotypes based on within-species variation. However, the more dramatic variation that can be found between species has not been explored for phenotype/genotype associations so-far. Using classical genetics to mine between-species variation is mostly impossible, because crosses between distinct species hardly work and their genomes are usually highly rearranged.
The goal of this project is to develop unprecedented genomics-based methods for inter-species (phylogenetic) association mapping, which can find signals even in highly re-arranged genomes of different species. To ensure that these methods are also useful in practice, we will apply them to the variation in secondary metabolites within the Brassicaceae plant family. Secondary metabolites are highly variable, genetically controlled, easy to measure and have broad application in cancer prevention, pest control and food design. Given the great potential of phylogenetic association mapping in general and secondary metabolites in particular, our work promises to be ground-breaking and have profound impact on many different fields of genetic research.
Specifically, our work plan includes the following points:
I) We will develop strategies for phylogenetic association mapping and implement them in publicly-available software.
II) We will establish a panel of inbred lines from ~200 Brassicaceae species and generate whole-genome assemblies for each of them.
III) We will exemplify the usefulness of phylogenetic association mapping by correlating the diversity of secondary metabolites to the differences in the respective genomes and validate the results by transforming or mutating candidate genes in appropriate species.
Dziedzina nauki (EuroSciVoc)
Klasyfikacja projektów w serwisie CORDIS opiera się na wielojęzycznej taksonomii EuroSciVoc, obejmującej wszystkie dziedziny nauki, w oparciu o półautomatyczny proces bazujący na technikach przetwarzania języka naturalnego. Więcej informacji: Europejski Słownik Naukowy.
Klasyfikacja projektów w serwisie CORDIS opiera się na wielojęzycznej taksonomii EuroSciVoc, obejmującej wszystkie dziedziny nauki, w oparciu o półautomatyczny proces bazujący na technikach przetwarzania języka naturalnego. Więcej informacji: Europejski Słownik Naukowy.
Aby użyć tej funkcji, musisz się zalogować lub zarejestrować
Przepraszamy… podczas wykonywania operacji wystąpił nieoczekiwany błąd.
Wymagane uwierzytelnienie. Powodem może być wygaśnięcie sesji.
Dziękujemy za przesłanie opinii. Wkrótce otrzymasz wiadomość e-mail z potwierdzeniem zgłoszenia. W przypadku wybrania opcji otrzymywania powiadomień o statusie zgłoszenia, skontaktujemy się również gdy status ulegnie zmianie.
Słowa kluczowe
Słowa kluczowe dotyczące projektu wybrane przez koordynatora projektu. Nie należy mylić ich z pojęciami z taksonomii EuroSciVoc dotyczącymi dziedzin nauki.
Słowa kluczowe dotyczące projektu wybrane przez koordynatora projektu. Nie należy mylić ich z pojęciami z taksonomii EuroSciVoc dotyczącymi dziedzin nauki.
Program(-y)
Wieloletnie programy finansowania, które określają priorytety Unii Europejskiej w obszarach badań naukowych i innowacji.
Wieloletnie programy finansowania, które określają priorytety Unii Europejskiej w obszarach badań naukowych i innowacji.
-
H2020-EU.1.1. - EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)
GŁÓWNY PROGRAM
Wyświetl wszystkie projekty finansowane w ramach tego programu
Temat(-y)
Zaproszenia do składania wniosków dzielą się na tematy. Każdy temat określa wybrany obszar lub wybrane zagadnienie, których powinny dotyczyć wnioski składane przez wnioskodawców. Opis tematu obejmuje jego szczegółowy zakres i oczekiwane oddziaływanie finansowanego projektu.
Zaproszenia do składania wniosków dzielą się na tematy. Każdy temat określa wybrany obszar lub wybrane zagadnienie, których powinny dotyczyć wnioski składane przez wnioskodawców. Opis tematu obejmuje jego szczegółowy zakres i oczekiwane oddziaływanie finansowanego projektu.
System finansowania
Program finansowania (lub „rodzaj działania”) realizowany w ramach programu o wspólnych cechach. Określa zakres finansowania, stawkę zwrotu kosztów, szczegółowe kryteria oceny kwalifikowalności kosztów w celu ich finansowania oraz stosowanie uproszczonych form rozliczania kosztów, takich jak rozliczanie ryczałtowe.
Program finansowania (lub „rodzaj działania”) realizowany w ramach programu o wspólnych cechach. Określa zakres finansowania, stawkę zwrotu kosztów, szczegółowe kryteria oceny kwalifikowalności kosztów w celu ich finansowania oraz stosowanie uproszczonych form rozliczania kosztów, takich jak rozliczanie ryczałtowe.
ERC-STG - Starting Grant
Wyświetl wszystkie projekty finansowane w ramach tego programu finansowania
Zaproszenie do składania wniosków
Procedura zapraszania wnioskodawców do składania wniosków projektowych w celu uzyskania finansowania ze środków Unii Europejskiej.
Procedura zapraszania wnioskodawców do składania wniosków projektowych w celu uzyskania finansowania ze środków Unii Europejskiej.
(odnośnik otworzy się w nowym oknie) ERC-2018-STG
Wyświetl wszystkie projekty finansowane w ramach tego zaproszeniaInstytucja przyjmująca
Kwota netto dofinansowania ze środków Unii Europejskiej. Suma środków otrzymanych przez uczestnika, pomniejszona o kwotę unijnego dofinansowania przekazanego powiązanym podmiotom zewnętrznym. Uwzględnia podział unijnego dofinansowania pomiędzy bezpośrednich beneficjentów projektu i pozostałych uczestników, w tym podmioty zewnętrzne.
80539 MUNCHEN
Niemcy
Ogół kosztów poniesionych przez organizację w związku z uczestnictwem w projekcie. Obejmuje koszty bezpośrednie i pośrednie. Kwota stanowi część całkowitego budżetu projektu.