Opis projektu
Odkrycie ukrytego porządku w pozornym chaosie może pomóc w opracowaniu leku o ukierunkowanym działaniu
Wiele chorób oddechowych oraz niektóre powszechne choroby wieku dziecięcego, takie jak odra czy świnka, są spowodowane paramyksowirusami. W USA ludzki syncytialny wirus oddechowy (RSV) jest główną przyczyną hospitalizacji niemowląt. Opracowanie szczepionki jest priorytetem dla Światowej Organizacji Zdrowia, jako że brakuje skutecznych leków zwalczających zakażenie paramyksowirusami. Nietypowe zaburzenie w kompleksie replikacyjnym paramyksowirusów może stanowić potencjalny cel dla nowych leków, jednak problem stanowi wymóg dynamicznych zmian konformacyjnych w maszynerii replikacyjnej. Twórcy finansowanego przez UE projektu DynamicAssemblies planują objaśnić tę maszynerię, wykorzystując bezprecedensową rozdzielczość atomową. Będzie to pierwszy, bardzo ważny krok na drodze do opracowania leku o ukierunkowanym działaniu.
Cel
Paramyxoviruses, including, measles and a number of dangerous human pathogens, are negative strand RNA viruses that express their own machinery for transcription and replication. Different interactions between the nucleoprotein (N) and the phosphoprotein (P) are essential for chaperoning and assembly of N on newly synthesized RNA genomes to form nucleocapsids (NCs), as well as for initiating replication and transcription. Both N and tetrameric P exhibit extensive conformational disorder, with very long, unfolded regions that host important post-translational modification sites as well as regulatory interactions with host and viral partners. The presence of this level of disorder, in viruses whose genetic information is normally so parsimoniously exploited, remains unexplained. The elaboration of time-resolved, atomic resolution descriptions of the interaction trajectories of these highly disordered N:P complexes is extremely challenging, requiring the development of adapted methodologies that can account for their intrinsic flexibility. The role of N and P has been rendered yet more enigmatic following our recent observation that when mixed in solution they form liquid-like droplets. Such membraneless organelles are revolutionizing our understanding of cellular chemical biology, although their physical basis is poorly understood. Our aim is to describe these important complexes at atomic resolution, in particular to understand the role of the extensive conformational dynamics of N and P in the replication cycle. Our recent success in engineering soluble N:P complexes from measles that assemble into NCs, combined with ongoing development of NMR-based methods to investigate the structure, dynamics and interaction kinetics of large, intrinsically disordered proteins, fluorescence spectroscopy, cryoEM, SAXS, crystallography and molecular simulation, will provide the essential tools to investigate the functional mechanisms of these previously inaccessible complexes.
Dziedzina nauki
- medical and health scienceshealth sciencesinfectious diseasesRNA viruses
- natural sciencesbiological sciencesmicrobiologyvirology
- natural sciencesearth and related environmental sciencesgeologymineralogycrystallography
- natural sciencesphysical sciencesopticsspectroscopyemission spectroscopy
- natural sciencesbiological sciencesgeneticsRNA
Program(-y)
Temat(-y)
System finansowania
ERC-ADG - Advanced GrantInstytucja przyjmująca
75015 PARIS 15
Francja