Opis projektu
Poszerzenie wiedzy na temat regulacji transkrypcji genów
Uzyskane w ciągu ostatniej dekady dowody wskazują na to, że większość genomu podlega transkrypcji, prowadząc do powstawania różnego rodzaju cząsteczek RNA. Zjawisko to znane jest pod pojęciem wszechobecnej transkrypcji i ma udokumentowaną rolę regulacyjną w transkrypcji genów kodujących białka. Zespół finansowanego ze środków UE projektu uTSSreg stosuje innowacyjne podejście do badania wpływu regulacyjnego wszechobecnej transkrypcji na aktywność promotorów. Stosując strategię pozbawiania komórek białka in vitro, naukowcy będą obserwować ukryte zdarzenia transkrypcyjne na promotorach genów. Wyniki badań przyczynią się do poszerzenia naszej wiedzy na temat złożonego procesu regulacji genów kodujących białka.
Cel
Regulation and fidelity of gene expression is fundamental to the differentiation and maintenance of living organisms. Moreover, understanding how genes are regulated is an essential research question of importance for biomedical application. Although our knowledge about key factors influencing gene expression has increased substantially over the past years, the complexity of gene expression regulation remains elusive. In this project, I intend to discover novel gene expression regulatory circuits operating in mammalian genomes facilitated by pervasive transcription. Although some scattered examples of how pervasive transcription may regulate gene promoter activity exist, no systematic study has been conducted. Here, I will address this question by using a new protein depletion strategy, developed in the host laboratory, to inactivate the nuclear exosome, a major 3’-to-5’ ribonuclease complex, and its co-factors in HeLa and mouse embryonic stem (mES) cells, thus, to create an ideal situation to observe ‘hidden’ cellular transcription events, which would not normally be visible. I intend to assess whether and how this ‘hidden’ transcription contributes to the regulation of promoter activity in HeLa and mES cells, further expanding our knowledge of the regulation of protein-coding genes and ultimately revealing the extent of regulation instigated by pervasive transcription. This study will lay a foundation for future research in the field and at the same time provide novel conceptual information, which might be exploited in prevention or treatment of human diseases.
Dziedzina nauki (EuroSciVoc)
Klasyfikacja projektów w serwisie CORDIS opiera się na wielojęzycznej taksonomii EuroSciVoc, obejmującej wszystkie dziedziny nauki, w oparciu o półautomatyczny proces bazujący na technikach przetwarzania języka naturalnego.
Klasyfikacja projektów w serwisie CORDIS opiera się na wielojęzycznej taksonomii EuroSciVoc, obejmującej wszystkie dziedziny nauki, w oparciu o półautomatyczny proces bazujący na technikach przetwarzania języka naturalnego.
- inżynieria i technologiabiotechnologia środowiskabioremediacjabioreaktor
- nauki przyrodniczenauki biologicznebiochemiabiocząsteczkibiałka
- nauki przyrodniczenauki biologicznebiologia komórki
- nauki przyrodniczenauki biologicznegenetykagenom
Aby użyć tej funkcji, musisz się zalogować lub zarejestrować
Program(-y)
Temat(-y)
System finansowania
MSCA-IF-EF-ST - Standard EFKoordynator
8000 Aarhus C
Dania