Opis projektu
Bliższe spojrzenie na rozwój sztucznych enzymów
Ewolucja kierowana jest skuteczną metodą inżynierii białek, która stanowi jedno z najpopularniejszych narzędzi w biologii podstawowej i stosowanej. Zespół finansowanego ze środków Unii Europejskiej projektu GuideArtifEvol zamierza zastosować sekwencjonowanie następnej generacji całych genów, co pozwoli na przeprowadzenie badania wariantów na poziomie sekwencji oraz ilościowe scharakteryzowanie kondycji ze szczególnym uwzględnieniem nieaddytywnego wpływu mutacji na kondycję (epistazy). Informacje te zostaną uwzględnione w protokołach DE, które pozwolą na bardziej efektywną eksplorację przestrzeni sekwencjonowania. Celem projektu jest lepsze zrozumienie topologii krajobrazu kondycji enzymu i jego zniekształceń pod wpływem presji selekcyjnej oraz wyjaśnienie korelacji między sekwencją, funkcją i rozwojem białek.
Cel
Directed evolution is an effective method for protein engineering. The host laboratory is designing innovative techniques for the directed evolution experiments of enzymes, with the possibility to test millions or billions of variants to be tested at each cycle. In this project, I will introduce the use of full-gene next generation sequencing to supervise the exploration of variants at the sequence level and quantitatively characterize the fitness landscape, with a focus on non-additive effects of mutations into fitness (epistasis). Furthermore, this information will be included in DE protocols to guide a more efficient exploration of the sequence space.
The project is a strongly interdisciplinary project consisting of experimental synthetic biology, physics modelling and bioinformatics analysis. It is focused in the study of DNA processing enzymes such as polymerase and endonucleases. The proposal includes the development of specific tools which should have an immediate impact on the scientific community: i. extend the applications of next generation sequencers to characterize full length genetic libraries of protein variants ; ii. adapt quantitative methods, previously developed for sets of structurally homologous proteins and derived from Potts model to study the catalytic properties of during directed evolution. iii. develop a new experimental protocol to control the number of mutations in libraries.
The analysis will provide a better understanding of the topology of the fitness landscape of an enzyme, and its distortions under selective pressures, thereby clarifying the relations between sequence,function and evolution in proteins.
Dziedzina nauki (EuroSciVoc)
Klasyfikacja projektów w serwisie CORDIS opiera się na wielojęzycznej taksonomii EuroSciVoc, obejmującej wszystkie dziedziny nauki, w oparciu o półautomatyczny proces bazujący na technikach przetwarzania języka naturalnego. Więcej informacji: Europejski Słownik Naukowy.
Klasyfikacja projektów w serwisie CORDIS opiera się na wielojęzycznej taksonomii EuroSciVoc, obejmującej wszystkie dziedziny nauki, w oparciu o półautomatyczny proces bazujący na technikach przetwarzania języka naturalnego. Więcej informacji: Europejski Słownik Naukowy.
- nauki przyrodnicze nauki biologiczne biologia syntetyczna
- nauki przyrodnicze matematyka matematyka czysta topologia
- nauki przyrodnicze nauki biologiczne genetyka mutacja
- nauki przyrodnicze nauki chemiczne kataliza
- nauki przyrodnicze nauki biologiczne biochemia biocząsteczki białka enzymy
Aby użyć tej funkcji, musisz się zalogować lub zarejestrować
Program(-y)
Wieloletnie programy finansowania, które określają priorytety Unii Europejskiej w obszarach badań naukowych i innowacji.
Wieloletnie programy finansowania, które określają priorytety Unii Europejskiej w obszarach badań naukowych i innowacji.
-
H2020-EU.1.3. - EXCELLENT SCIENCE - Marie Skłodowska-Curie Actions
GŁÓWNY PROGRAM
Wyświetl wszystkie projekty finansowane w ramach tego programu -
H2020-EU.1.3.2. - Nurturing excellence by means of cross-border and cross-sector mobility
Wyświetl wszystkie projekty finansowane w ramach tego programu
Temat(-y)
Zaproszenia do składania wniosków dzielą się na tematy. Każdy temat określa wybrany obszar lub wybrane zagadnienie, których powinny dotyczyć wnioski składane przez wnioskodawców. Opis tematu obejmuje jego szczegółowy zakres i oczekiwane oddziaływanie finansowanego projektu.
Zaproszenia do składania wniosków dzielą się na tematy. Każdy temat określa wybrany obszar lub wybrane zagadnienie, których powinny dotyczyć wnioski składane przez wnioskodawców. Opis tematu obejmuje jego szczegółowy zakres i oczekiwane oddziaływanie finansowanego projektu.
System finansowania
Program finansowania (lub „rodzaj działania”) realizowany w ramach programu o wspólnych cechach. Określa zakres finansowania, stawkę zwrotu kosztów, szczegółowe kryteria oceny kwalifikowalności kosztów w celu ich finansowania oraz stosowanie uproszczonych form rozliczania kosztów, takich jak rozliczanie ryczałtowe.
Program finansowania (lub „rodzaj działania”) realizowany w ramach programu o wspólnych cechach. Określa zakres finansowania, stawkę zwrotu kosztów, szczegółowe kryteria oceny kwalifikowalności kosztów w celu ich finansowania oraz stosowanie uproszczonych form rozliczania kosztów, takich jak rozliczanie ryczałtowe.
MSCA-IF-EF-ST - Standard EF
Wyświetl wszystkie projekty finansowane w ramach tego programu finansowania
Zaproszenie do składania wniosków
Procedura zapraszania wnioskodawców do składania wniosków projektowych w celu uzyskania finansowania ze środków Unii Europejskiej.
Procedura zapraszania wnioskodawców do składania wniosków projektowych w celu uzyskania finansowania ze środków Unii Europejskiej.
(odnośnik otworzy się w nowym oknie) H2020-MSCA-IF-2018
Wyświetl wszystkie projekty finansowane w ramach tego zaproszeniaKoordynator
Kwota netto dofinansowania ze środków Unii Europejskiej. Suma środków otrzymanych przez uczestnika, pomniejszona o kwotę unijnego dofinansowania przekazanego powiązanym podmiotom zewnętrznym. Uwzględnia podział unijnego dofinansowania pomiędzy bezpośrednich beneficjentów projektu i pozostałych uczestników, w tym podmioty zewnętrzne.
75231 Paris
Francja
Ogół kosztów poniesionych przez organizację w związku z uczestnictwem w projekcie. Obejmuje koszty bezpośrednie i pośrednie. Kwota stanowi część całkowitego budżetu projektu.