Opis projektu
Obserwacja mobilnych cząsteczek RNA w roślinach i wykrywanie ich celów pozwoli na sprawniejsze wyciszanie genów
Regulacyjne małe RNA (sRNA) występuje powszechnie w świecie roślin, odgrywając kluczową rolę w rozprzestrzenianiu interferencji RNA (RNAi) na cały organizm rośliny. RNAi to genetyczny system regulacyjny, który wycisza aktywność pewnych określonych genów. Biorąc pod uwagę różnorodność sRNA i ich celów połączoną z mobilnością, opracowanie kompleksowej charakterystyki par mobilnych sRNA i ich celów stanowiło dotychczas ogromne wyzwanie. Naukowcy skupieni wokół finansowanego ze środków Unii Europejskiej projektu GeminiDECODER wykorzystują nowatorską sondę, aby przeprowadzić takie badania z niespotykaną dotąd rozdzielczością. Jest to możliwe dzięki białku w wirusie zakażającym rośliny, który jest w stanie zakłócać rozprzestrzenianie się RNAi między komórkami. Wyniki badań pozwolą naukowcom na izolowanie mobilnego sRNA oraz poszczególnych celów w różnych warunkach i w przypadku różnych roślin, co może umożliwić regulowanie wydajności upraw.
Cel
In plants, RNA interference (RNAi) is involved in processes ranging from development to stress responses. The core element of this regulatory mechanism, the small RNA (sRNA), has been characterized as a mobile molecule able to spread the RNAi beyond the initiation sites, acting as a cell non-autonomous process. Examples of mobile sRNAs are known: mobile small interfering RNAs (siRNAs) deriving from viruses spread throughout the plant, and are responsible for the activation of the viral silencing in uninfected tissues; other siRNAs, together with microRNAs (miRNAs), have been described to move through different cell layers, acting as morphogens; finally, some miRNAs have been shown to move through the vasculature under stress conditions, activating protective responses. Mobile sRNAs are therefore of capital importance for plant biology, and many approaches have been followed to analyze them; however, the number of mobile sRNA/target pairs fully characterized is scarce. Recently, the C4 protein from Tomato yellow leaf curl virus (TYLCV) has been shown to interfere specifically with the cell-to-cell movement of RNAi, affecting neither accumulation nor activity of the sRNAs. In this project, C4 will be used as a novel and powerful tool to isolate mobile sRNAs and their targets, under different conditions (basal vs viral infection) and in different plants (Arabidopsis and tomato), in a large scale and with unprecedented resolution. By using C4-expressing plants, out-of-location mobile sRNAs as well as increased levels of their unprocessed targets are expected to be easily detected. Thanks to this viral probe, a whole picture of the different populations of mobile sRNAs and their targets will be obtained, and the biological relevance of the most prominent candidates will be assessed. As a result, relevant new knowledge about the regulation of key biological processes in plants will be obtained, which may open new avenues for the design of more productive crops.
Dziedzina nauki (EuroSciVoc)
Klasyfikacja projektów w serwisie CORDIS opiera się na wielojęzycznej taksonomii EuroSciVoc, obejmującej wszystkie dziedziny nauki, w oparciu o półautomatyczny proces bazujący na technikach przetwarzania języka naturalnego.
Klasyfikacja projektów w serwisie CORDIS opiera się na wielojęzycznej taksonomii EuroSciVoc, obejmującej wszystkie dziedziny nauki, w oparciu o półautomatyczny proces bazujący na technikach przetwarzania języka naturalnego.
- nauki przyrodniczenauki biologicznemikrobiologiawirusologia
- nauki przyrodniczenauki biologicznebiochemiabiocząsteczkibiałka
- nauki rolniczerolnictwo, leśnictwo i rybołówstworolnictwo
- nauki przyrodniczenauki biologicznegenetykaRNA
Aby użyć tej funkcji, musisz się zalogować lub zarejestrować
Słowa kluczowe
Program(-y)
Temat(-y)
System finansowania
MSCA-IF - Marie Skłodowska-Curie Individual Fellowships (IF)Koordynator
29016 Malaga
Hiszpania