Deciphering and Engineering the overlooked but Universal phenomenon of Subpopulations in BIOtechnology

Informacje na temat projektu

DEUSBIO

Identyfikator umowy o grant: 949080

DOI

10.3030/949080

Data podpisania przez KE 9 Października 2020

Data rozpoczęcia 1 Marca 2021

Data zakończenia 28 Lutego 2026

Finansowanie w ramach

• EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)

Koszt całkowity

€ 1 499 998,00

Wkład UE

€ 1 499 998,00

Koordynowany przez

IMPERIAL COLLEGE OF SCIENCE TECHNOLOGY AND MEDICINE
United Kingdom

CORDIS oferuje możliwość skorzystania z odnośników do publicznie dostępnych publikacji i rezultatów projektów realizowanych w ramach programów ramowych HORYZONT.

Odnośniki do rezultatów i publikacji związanych z poszczególnymi projektami 7PR, a także odnośniki do niektórych konkretnych kategorii wyników, takich jak zbiory danych i oprogramowanie, są dynamicznie pobierane z systemu OpenAIRE .

Publikacje

Peer reviewed articles (26)

<i>Vibrio natriegens</i> genome‐scale modeling reveals insights into halophilic adaptations and resource allocation

Autorzy: Lucas Coppens, Tanya Tschirhart, Dagmar H Leary, Sophie M Colston, Jaimee R Compton, William Judson Hervey, Karl L Dana, Gary J Vora, Sergio Bordel, Rodrigo Ledesma‐Amaro
Opublikowane w: Molecular Systems Biology, Numer 19, 2023, ISSN 1744-4292
Wydawca: Nature Publishing Group
DOI: 10.15252/msb.202110523

The microbial food revolution

Autorzy: Alicia E. Graham, Rodrigo Ledesma-Amaro
Opublikowane w: Nature Communications, Numer 14, 2023, ISSN 2041-1723
Wydawca: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-023-37891-1

Microbial conversion of ethanol to high-value products: progress and challenges

Autorzy: Manman Sun, Alex Xiong Gao, Xiuxia Liu, Zhonghu Bai, Peng Wang, Rodrigo Ledesma-Amaro
Opublikowane w: Biotechnology for Biofuels and Bioproducts, Numer 17, 2024, ISSN 2731-3654
Wydawca: Springer Science and Business Media LLC
DOI: 10.1186/s13068-024-02546-w

Synthetic, marine, light-driven, autotroph-heterotroph co-culture system for sustainable β-caryophyllene production

Autorzy: Wenchao Chen, Young-Kyoung Park, Lucie Studená, David Bell, Piotr Hapeta, Jing Fu, Peter J. Nixon, Rodrigo Ledesma-Amaro
Opublikowane w: Bioresource Technology, Numer 410, 2024, Strona(/y) 131232, ISSN 0960-8524
Wydawca: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.biortech.2024.131232

Metabolic engineering strategies to enable microbial utilization of C1 feedstocks

Autorzy: Jiang, Wei; Hernandez Villamor, David; Peng, Huadong; Chen, Jian; Liu, Long; Haritos, Victoria; Ledesma-Amaro, Rodrigo
Opublikowane w: Nature Chemical Biology, 2022, ISSN 1552-4469
Wydawca: Nature
DOI: 10.1038/s41589-021-00836-0

Fusarium-based mycoprotein: Advancements in the production of sustainable meat substitutes

Autorzy: Rima Gnaim, Paul S. Dyer, Rodrigo Ledesma-Amaro
Opublikowane w: Trends in Food Science &amp; Technology, Numer 159, 2025, Strona(/y) 104981, ISSN 0924-2244
Wydawca: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.tifs.2025.104981

Phenotypic heterogeneity follows a growth-viability tradeoff in response to amino acid identity

Autorzy: Kiyan Shabestary, Cinzia Klemm, Benedict Carling, James Marshall, Juline Savigny, Marko Storch, Rodrigo Ledesma-Amaro
Opublikowane w: Nature Communications, Numer 15, 2024, ISSN 2041-1723
Wydawca: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-024-50602-8

A molecular toolkit of cross-feeding strains for engineering synthetic yeast communities

Autorzy: Peng, H., Darlington, A.P.S., South, E.J. et al. Rodrigo Ledesma-Amaro
Opublikowane w: Nature Microbiology, 2024, ISSN 2058-5276
Wydawca: Nature
DOI: 10.1038/s41564-023-01596-4

Advances in the biosynthesis of β-carotene and its derivatives in yeast

Autorzy: Tingan Zhou, Young-Kyoung Park, Rodrigo Ledesma-Amaro
Opublikowane w: Bioresource Technology, Numer 435, 2025, Strona(/y) 132936, ISSN 0960-8524
Wydawca: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.biortech.2025.132936

DELLA proteins recruit the Mediator complex subunit MED15 to coactivate transcription in land plants

Autorzy: Jorge Hernández-García, Antonio Serrano-Mislata, María Lozano-Quiles, Cristina Úrbez, María A. Nohales, Noel Blanco-Touriñán, Huadong Peng, Rodrigo Ledesma-Amaro, Miguel A. Blázquez
Opublikowane w: Proceedings of the National Academy of Sciences, Numer 121, 2024, ISSN 0027-8424
Wydawca: National Academy of Sciences
DOI: 10.1073/pnas.2319163121

Designing synthetic microbial communities with the capacity to upcycle fermentation byproducts to increase production yields

Autorzy: Razieh Rafieenia, Cinzia Klemm, Piotr Hapeta, Jing Fu, María Gallego García, Rodrigo Ledesma-Amaro
Opublikowane w: Trends in Biotechnology, Numer 43, 2025, Strona(/y) 601-619, ISSN 0167-7799
Wydawca: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.tibtech.2024.10.015

Synthetic biology of Fusarium for the sustainable production of valuable bioproducts

Autorzy: Rima Gnaim, Rodrigo Ledesma-Amaro
Opublikowane w: Biotechnology Advances, Numer 81, 2025, Strona(/y) 108579, ISSN 0734-9750
Wydawca: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.biotechadv.2025.108579

Comparative Genomics Analysis of Keratin-Degrading Chryseobacterium Species Reveals Their Keratinolytic Potential for Secondary Metabolite Production

Autorzy: Dingrong Kang, Saeed Shoaie, Samuel Jacquiod, Søren J. Sørensen, Rodrigo Ledesma-Amaro
Opublikowane w: Microorganisms, Numer 9, 2025, Strona(/y) 1042, ISSN 2076-2607
Wydawca: MDPI AG
DOI: 10.3390/microorganisms9051042

Division of labor for substrate utilization in natural and synthetic microbial communities

Autorzy: Razieh Rafieenia; Eliza Atkinson; Rodrigo Ledesma-Amaro
Opublikowane w: Current opinion in Biotechnology, Numer 09581669, 2022, ISSN 0958-1669
Wydawca: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.copbio.2022.102706

Metabolic engineering of Yarrowia lipolytica for the production and secretion of the saffron ingredient crocetin

Autorzy: Tingan Zhou, Young-Kyoung Park, Jing Fu, Piotr Hapeta, Cinzia Klemm, Rodrigo Ledesma-Amaro
Opublikowane w: Biotechnology for Biofuels and Bioproducts, Numer 18, 2025, ISSN 2731-3654
Wydawca: Springer Science and Business Media LLC
DOI: 10.1186/s13068-024-02598-y

Resource-aware whole-cell model of division of labour in a microbial consortium for complex-substrate degradation

Autorzy: Ledesma Amaro, R; Stan, G-B; Atkinson, E; Perrino, G; Tuza, Z
Opublikowane w: Microbial cell factories, Numer 14752859, 2022, ISSN 1475-2859
Wydawca: BioMed Central
DOI: 10.1186/s12934-022-01842-0

Inducible expression of large gRNA arrays for multiplexed CRISPRai applications

Autorzy: Shaw, W.M., Studená, L., Roy, K. et al.
Opublikowane w: Nature Communications, Numer 20411723, 2022, ISSN 2041-1723
Wydawca: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-022-32603-7

New synthetic biology tools for metabolic control

Autorzy: Xueqin Lv, Angeles Hueso-Gil, Xinyu Bi, Yaokang Wu, Yanfeng Liu, Long Liu, RodrigoLedesma-Amaro
Opublikowane w: Current opinion in Biotechnology, Numer 09581669, 2022, ISSN 0958-1669
Wydawca: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.copbio.2022.102724

Engineered cross-feeding creates inter- and intra-species synthetic yeast communities with enhanced bioproduction

Autorzy: Young-Kyoung Park, Huadong Peng, Piotr Hapeta, Lara Sellés Vidal, Rodrigo Ledesma-Amaro
Opublikowane w: Nature Communications, Numer 15, 2024, ISSN 2041-1723
Wydawca: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-024-53117-4

Modular Metabolic Engineering and Synthetic Coculture Strategies for the Production of Aromatic Compounds in Yeast

Autorzy: Huadong Peng; Ruiqi Chen; William M. Shaw; Piotr Hapeta; Wei Jiang; David J. Bell; Tom Ellis; Rodrigo Ledesma-Amaro
Opublikowane w: ACS synthetic Biology, Numer 9, 2023, ISSN 2161-5063
Wydawca: American Chemical Society
DOI: 10.1021/acssynbio.3c00047

Efficient synthesis of limonene production in Yarrowia lipolytica by combinatorial engineering strategies

Autorzy: Young-Kyoung Park, Lara Sellés Vidal, David Bell, Jure Zabret, Mladen Soldat, Martin Kavšček, Rodrigo Ledesma-Amaro
Opublikowane w: Biotechnology for Biofuels and Bioproducts, Numer 17, 2024, ISSN 2731-3654
Wydawca: Springer Science and Business Media LLC
DOI: 10.1186/s13068-024-02535-z

Spontaneously established syntrophic yeast communities improve bioproduction

Autorzy: "Simran Kaur Aulakh # 1 2 , Lara Sellés Vidal # 3 , Eric J South # 3 , Huadong Peng 3 , Sreejith Jayasree Varma 4 , Lucia Herrera-Dominguez 1 4 , Markus Ralser 5 6 7 8 , Rodrigo Ledesma-Amaro 9"
Opublikowane w: Nature Chemical Biology, 2023, ISSN 1552-4469
Wydawca: Nature
DOI: 10.1038/s41589-023-01341-2

What makes Yarrowia lipolytica well suited for industry?

Autorzy: Young-KyoungPark, RodrigoLedesma-Amaro
Opublikowane w: Trends in Biotechnology, Numer 18793096, 2022, ISSN 1879-3096
Wydawca: Cell Press
DOI: 10.1016/j.tibtech.2022.07.006

A primer to directed evolution: current methodologies and future directions

Autorzy: Lara Sellés Vidal, Mark Isalan, John T. Heap, Rodrigo Ledesma-Amaro
Opublikowane w: RSC Chemical Biology, Numer 4, 2024, Strona(/y) 271-291, ISSN 2633-0679
Wydawca: Royal Society of Chemistry (RSC)
DOI: 10.1039/d2cb00231k

Investigating the Potential of Division of Labor in Synthetic Bacterial Communities for the Production of Violacein

Autorzy: Harman Mehta, Jose Jimenez, Rodrigo Ledesma-Amaro, Guy-Bart Stan
Opublikowane w: ACS Synthetic Biology, Numer 14, 2025, Strona(/y) 2703-2709, ISSN 2161-5063
Wydawca: American Chemical Society
DOI: 10.1021/acssynbio.5c00120

Synthetic biology and bioelectrochemical tools for electrogenetic system engineering

Autorzy: Joshua M. Lawrence, et al [...]Rodrigo Ledesma-Amaro
Opublikowane w: Science Advances, Numer 23752548, 2022, ISSN 2375-2548
Wydawca: Sciences Advanced
DOI: 10.1126/sciadv.abm5091