Cel
AVAILABILITY OF A TOOL FOR THE SOLUTION OF PRACTICAL PROTEIN DESIGN PROBLEMS IN MOLECULAR BIOLOGY, MOLECULAR MEDICINE AND BIOTECHNOLOGY, WITH LONG TERM ECONOMIC BENEFITS IN THESE FIELDS.
Data on known protein structures and amino acid sequences have proven to be very useful for deriving empirical rules for protein folding and design. With the growing volume of these data, more sophisticated systems for storing and handlingknowledge on macromolecular structures are urgently needed. Progress should be made by improving ways to exploit sequence homology to infer structural information from the more than 10000 proteins for which only sequence data are available.
Research was carried out in order to develop a database of protein knowledge containing structure and sequence information and extend the database to include information on inferred 3-dimensional structures of proteins for which only sequence data are available.
SESAM, a performing relational database for protein structure and sequence capable of containing data from public and private sources, was developed; it features powerful procedures for validating and cleaning up input data, and rapid data retrieval. It has been interfaced with a graphics package, BRUGEL, and specialized user friendly interfaces have been implemented. The database on known protein structures was extended to include inferred 3-dimensional structures, grouped into structural families, by exploiting the correlations between structural homology and sequence similarity above a certain threshold of the latter. A limited number of short sequence patterns characterising with high accuracy local structure motifs in proteins can be found. This does not improve protein structure prediction methods, due to the limited size of the structural database and to the influence of spatial interactions between distant residues in the sequence. Object oriented methods and logic programming (Prolog) yield important benefits in terms of speeding up the design, development and debugging stages.
DEVELOPMENT OF A SYSTEM FOR PROTEIN STRUCTURE PREDICTION, MERGING STATISTICAL AND INFORMATION ANALYSIS TECHNIQUES WITH ADVANCED TOOLS FROM COMPUTER SCIENCE (A.I.) AS WELL AS EXISTING METHODS IN MOLECULAR MODELLING.
IN THIS COLLABORATIVE EFFORT, THE SPECIFIC ROLE OF THIS PART OF THE PROJECT CONSISTS IN THE DEVELOPMENT OF THE REQUIRED COMPUTER TOOLS. DEFINITION AND IMPLEMENTATION OF LOGIC BASED REPRESENTATION SCHEMES (IN COLLABORATION WITH THE GROUPS A - C) OF RESOURCE EFFICIENT META-INTERPRETERS AND USER INTERFACES.
Dziedzina nauki (EuroSciVoc)
Klasyfikacja projektów w serwisie CORDIS opiera się na wielojęzycznej taksonomii EuroSciVoc, obejmującej wszystkie dziedziny nauki, w oparciu o półautomatyczny proces bazujący na technikach przetwarzania języka naturalnego. Więcej informacji: Europejski Słownik Naukowy.
Klasyfikacja projektów w serwisie CORDIS opiera się na wielojęzycznej taksonomii EuroSciVoc, obejmującej wszystkie dziedziny nauki, w oparciu o półautomatyczny proces bazujący na technikach przetwarzania języka naturalnego. Więcej informacji: Europejski Słownik Naukowy.
- nauki przyrodnicze informatyka sztuczna inteligencja
- nauki przyrodnicze nauki biologiczne biochemia biocząsteczki białka fałdowanie białek
- nauki przyrodnicze nauki chemiczne chemia organiczna aminy
- nauki przyrodnicze informatyka bazy danych relacyjne bazy danych
- nauki przyrodnicze nauki biologiczne biologia molekularna
Aby użyć tej funkcji, musisz się zalogować lub zarejestrować
Program(-y)
Wieloletnie programy finansowania, które określają priorytety Unii Europejskiej w obszarach badań naukowych i innowacji.
Wieloletnie programy finansowania, które określają priorytety Unii Europejskiej w obszarach badań naukowych i innowacji.
Temat(-y)
Zaproszenia do składania wniosków dzielą się na tematy. Każdy temat określa wybrany obszar lub wybrane zagadnienie, których powinny dotyczyć wnioski składane przez wnioskodawców. Opis tematu obejmuje jego szczegółowy zakres i oczekiwane oddziaływanie finansowanego projektu.
Brak dostępnych danych
Zaproszenia do składania wniosków dzielą się na tematy. Każdy temat określa wybrany obszar lub wybrane zagadnienie, których powinny dotyczyć wnioski składane przez wnioskodawców. Opis tematu obejmuje jego szczegółowy zakres i oczekiwane oddziaływanie finansowanego projektu.
Zaproszenie do składania wniosków
Procedura zapraszania wnioskodawców do składania wniosków projektowych w celu uzyskania finansowania ze środków Unii Europejskiej.
Brak dostępnych danych
Procedura zapraszania wnioskodawców do składania wniosków projektowych w celu uzyskania finansowania ze środków Unii Europejskiej.
System finansowania
Program finansowania (lub „rodzaj działania”) realizowany w ramach programu o wspólnych cechach. Określa zakres finansowania, stawkę zwrotu kosztów, szczegółowe kryteria oceny kwalifikowalności kosztów w celu ich finansowania oraz stosowanie uproszczonych form rozliczania kosztów, takich jak rozliczanie ryczałtowe.
Program finansowania (lub „rodzaj działania”) realizowany w ramach programu o wspólnych cechach. Określa zakres finansowania, stawkę zwrotu kosztów, szczegółowe kryteria oceny kwalifikowalności kosztów w celu ich finansowania oraz stosowanie uproszczonych form rozliczania kosztów, takich jak rozliczanie ryczałtowe.
Koordynator
3078 EVERBERG
Belgia
Ogół kosztów poniesionych przez organizację w związku z uczestnictwem w projekcie. Obejmuje koszty bezpośrednie i pośrednie. Kwota stanowi część całkowitego budżetu projektu.