Cel
The objectives of the proposed project are to develop and provide tools for the interpretation of genomic DNA sequences with special emphasis on regulatory regions.
Sequencing whole genomes will yield a huge amount of data in near future. Systematic functional analysis of these sequences with the standard experimental methods is far beyond existing laboratory research capacities. Thus, we have to rely on in silico approaches at least for planning of targeted experiments. The assessment of the biological meaning of a gene depends not only on methods to predict the structure and function of its gene product, but also on the ability to derive its regulatory expression pattern from the base sequence. Gene control regions pose particular difficulties to in silico function prediction approaches which may partly explain the modes of success of current algorithms addressing this problem. The elementary sequence signals are typically short (in the range of 5 to 30 base pairs) and highly variable, reflecting the biochemistry of the decoding mechanism. As a consequence of these properties, the physiological significance of an individual control module can only be assessed by a comprehensive search involving context analysis within the (putative) regulatory region combined with gene identification methods based on coding region prediction. The technical approaches suggested in this proposal particularly address the recognized difficulties outlined above.
Thus, there is an obvious need for programs that enable molecular biologists to efficiently annotate newly unravelled sequence data with tentative functional features.
To achieve this, we propose the following programme:
1. Databases that collect experimental relevant data such as TRANSFAC and EPD provide the basis for sequence analysis. They will be appropriately adapted and integrated.
2. The next step will be to develop algorithms that permit the identification of individual functional elements as precise as possible.
3. The third step is a comprehensive context analysis of potential cisregulatory sequence elements within promoters, enhancers or LCRs and in conjunction with coding regions / open reading frames.
4. Finally, all algorithms to be developed have to be continuously verified in close collaboration with experimental researchers using appropriate model genomes.
Dziedzina nauki (EuroSciVoc)
Klasyfikacja projektów w serwisie CORDIS opiera się na wielojęzycznej taksonomii EuroSciVoc, obejmującej wszystkie dziedziny nauki, w oparciu o półautomatyczny proces bazujący na technikach przetwarzania języka naturalnego. Więcej informacji: Europejski Słownik Naukowy.
Klasyfikacja projektów w serwisie CORDIS opiera się na wielojęzycznej taksonomii EuroSciVoc, obejmującej wszystkie dziedziny nauki, w oparciu o półautomatyczny proces bazujący na technikach przetwarzania języka naturalnego. Więcej informacji: Europejski Słownik Naukowy.
- nauki przyrodnicze nauki biologiczne biochemia
- nauki przyrodnicze informatyka bazy danych
- nauki przyrodnicze nauki biologiczne genetyka DNA
- nauki przyrodnicze matematyka matematyka czysta analiza matematyczna analiza funkcjonalna
- nauki przyrodnicze nauki biologiczne genetyka genom
Aby użyć tej funkcji, musisz się zalogować lub zarejestrować
Przepraszamy… podczas wykonywania operacji wystąpił nieoczekiwany błąd.
Wymagane uwierzytelnienie. Powodem może być wygaśnięcie sesji.
Dziękujemy za przesłanie opinii. Wkrótce otrzymasz wiadomość e-mail z potwierdzeniem zgłoszenia. W przypadku wybrania opcji otrzymywania powiadomień o statusie zgłoszenia, skontaktujemy się również gdy status ulegnie zmianie.
Program(-y)
Wieloletnie programy finansowania, które określają priorytety Unii Europejskiej w obszarach badań naukowych i innowacji.
Wieloletnie programy finansowania, które określają priorytety Unii Europejskiej w obszarach badań naukowych i innowacji.
Temat(-y)
Zaproszenia do składania wniosków dzielą się na tematy. Każdy temat określa wybrany obszar lub wybrane zagadnienie, których powinny dotyczyć wnioski składane przez wnioskodawców. Opis tematu obejmuje jego szczegółowy zakres i oczekiwane oddziaływanie finansowanego projektu.
Zaproszenia do składania wniosków dzielą się na tematy. Każdy temat określa wybrany obszar lub wybrane zagadnienie, których powinny dotyczyć wnioski składane przez wnioskodawców. Opis tematu obejmuje jego szczegółowy zakres i oczekiwane oddziaływanie finansowanego projektu.
Zaproszenie do składania wniosków
Procedura zapraszania wnioskodawców do składania wniosków projektowych w celu uzyskania finansowania ze środków Unii Europejskiej.
Brak dostępnych danych
Procedura zapraszania wnioskodawców do składania wniosków projektowych w celu uzyskania finansowania ze środków Unii Europejskiej.
System finansowania
Program finansowania (lub „rodzaj działania”) realizowany w ramach programu o wspólnych cechach. Określa zakres finansowania, stawkę zwrotu kosztów, szczegółowe kryteria oceny kwalifikowalności kosztów w celu ich finansowania oraz stosowanie uproszczonych form rozliczania kosztów, takich jak rozliczanie ryczałtowe.
Program finansowania (lub „rodzaj działania”) realizowany w ramach programu o wspólnych cechach. Określa zakres finansowania, stawkę zwrotu kosztów, szczegółowe kryteria oceny kwalifikowalności kosztów w celu ich finansowania oraz stosowanie uproszczonych form rozliczania kosztów, takich jak rozliczanie ryczałtowe.
Koordynator
38124 BRAUNSCHWEIG
Niemcy
Ogół kosztów poniesionych przez organizację w związku z uczestnictwem w projekcie. Obejmuje koszty bezpośrednie i pośrednie. Kwota stanowi część całkowitego budżetu projektu.