Cel
An avalanche of data has been gathered by the various genome mapping and sequencing projects. This data combined with the biological information in databases has an inestimable potential value. The realization of that potential is heavily dependent on investments in the development of tools to make use of the underlying data in databases and to make this knowledge available to the scientific community.
Protein sequence databases form a key computational resource for modern molecular biology. Searches against such a database frequently allow transfer of important functional information to a new sequence. However, transferring information from pairwise hits to other sequences is prone to error, particularly when this must be done on a large scale, for instance when annotating predicted genes from genome projects at the genome centres or when annotating sequences for inclusion in databases like SWISS-PROT + TREMBL. In recognition of these limitations, it is now essential to extend search strategies to include a range of "secondary" databases when analysing novel protein sequences. Databases on functional sites and domains like PROSITE, PRINTS, PFAM, PRODOM, BLOCKS, etc., have become vital resources for identifying distant relationships in novel sequences, and hence for predicting protein function and structure.
Unfortunately, these secondary databases do not share the same formats and nomenclature, which makes the use of all of them in an automated way difficult. In response to this the partners in this proposal (EBI, University of Geneva, ISREC, UCL, Sanger Centre, INRIA, CNRS/INRA, Compugen, LION, Pfizer and University of Bergen) want to address these problems by establishing an Integrated resource of Protein domains and functional sites (InterPro), and to apply this resource to accelerate protein functional analysis. This will create the pre-eminent world-wide secondary database for protein annotation.
The main objectives and goals of this proposal are:
- Creation of InterPro, allowing users to access a wider, complementary range of site and domain recognition methods in a single package.
- Establishment of WWW servers which allow the scientific community to useInterPro in protein sequence analysis.
- Incorporation of InterPro in the computer-generation of annotation in TREMBL,the protein database supplementing SWISS-PROT.
- Use of InterPro in the annotation of predicted genes from genome projects.
Dziedzina nauki (EuroSciVoc)
Klasyfikacja projektów w serwisie CORDIS opiera się na wielojęzycznej taksonomii EuroSciVoc, obejmującej wszystkie dziedziny nauki, w oparciu o półautomatyczny proces bazujący na technikach przetwarzania języka naturalnego. Więcej informacji: Europejski Słownik Naukowy.
Klasyfikacja projektów w serwisie CORDIS opiera się na wielojęzycznej taksonomii EuroSciVoc, obejmującej wszystkie dziedziny nauki, w oparciu o półautomatyczny proces bazujący na technikach przetwarzania języka naturalnego. Więcej informacji: Europejski Słownik Naukowy.
- nauki przyrodnicze informatyka bazy danych
- nauki przyrodnicze nauki biologiczne biochemia biocząsteczki białka
- nauki przyrodnicze matematyka matematyka czysta analiza matematyczna analiza funkcjonalna
- nauki przyrodnicze nauki biologiczne genetyka genom
- nauki przyrodnicze nauki biologiczne biologia molekularna
Aby użyć tej funkcji, musisz się zalogować lub zarejestrować
Program(-y)
Wieloletnie programy finansowania, które określają priorytety Unii Europejskiej w obszarach badań naukowych i innowacji.
Wieloletnie programy finansowania, które określają priorytety Unii Europejskiej w obszarach badań naukowych i innowacji.
Temat(-y)
Zaproszenia do składania wniosków dzielą się na tematy. Każdy temat określa wybrany obszar lub wybrane zagadnienie, których powinny dotyczyć wnioski składane przez wnioskodawców. Opis tematu obejmuje jego szczegółowy zakres i oczekiwane oddziaływanie finansowanego projektu.
Zaproszenia do składania wniosków dzielą się na tematy. Każdy temat określa wybrany obszar lub wybrane zagadnienie, których powinny dotyczyć wnioski składane przez wnioskodawców. Opis tematu obejmuje jego szczegółowy zakres i oczekiwane oddziaływanie finansowanego projektu.
Zaproszenie do składania wniosków
Procedura zapraszania wnioskodawców do składania wniosków projektowych w celu uzyskania finansowania ze środków Unii Europejskiej.
Brak dostępnych danych
Procedura zapraszania wnioskodawców do składania wniosków projektowych w celu uzyskania finansowania ze środków Unii Europejskiej.
System finansowania
Program finansowania (lub „rodzaj działania”) realizowany w ramach programu o wspólnych cechach. Określa zakres finansowania, stawkę zwrotu kosztów, szczegółowe kryteria oceny kwalifikowalności kosztów w celu ich finansowania oraz stosowanie uproszczonych form rozliczania kosztów, takich jak rozliczanie ryczałtowe.
Program finansowania (lub „rodzaj działania”) realizowany w ramach programu o wspólnych cechach. Określa zakres finansowania, stawkę zwrotu kosztów, szczegółowe kryteria oceny kwalifikowalności kosztów w celu ich finansowania oraz stosowanie uproszczonych form rozliczania kosztów, takich jak rozliczanie ryczałtowe.
Koordynator
CB10 1SD SAFFRON WALDEN
Zjednoczone Królestwo
Ogół kosztów poniesionych przez organizację w związku z uczestnictwem w projekcie. Obejmuje koszty bezpośrednie i pośrednie. Kwota stanowi część całkowitego budżetu projektu.