Cel
Nucleotide excision repair (NER) is involved in preserving genomic integrity by removing a number of diverse lesions, including those formed by UV-light, various environmental mutagens and certain anti-tumour agents from DNA. NER fulfils an important role in protecting humans from cancer. NER is a complex process that involves the concerted action of over 30 polypeptides and involves the following steps: damage recognition, opening of the DNA around the lesion, dual incision of the damaged strand, repair synthesis and ligation. We will pursue an interdisciplinary project to study mammalian NER in vitro and in vivo. We will design and synthesize photoreactive and fluorescent NER substrates and investigate how they interact with NER factors. The novelty of this project involves design of NER substrates containing bulky photoreactive damages and their application to study mammalian NER system. Photocrosslinking studies using photoreactive probes as damages and in proximity to the damage will provide a picture of how NER factors (XPC-HR23B,TFIIH, XPA, RPA, DDB1/2 and others) and their subunits are connected with NER damages or to the undamaged strand in the process of damage verification and processing. Using RPA mutants will allow us to determine subunits and domains of RPA critical for functioning of NER machinery. The advantage of this approach consists in the possibility to identify unstable (transient) NER complexes and to define their architecture and hand-off of damage DNA from one protein to another in NER processing. Novel fluorescent, photoreactive or both NER substrates will be used to determine the intermolecular distances between the individual proteins and damaged sites using fluorescence resonance energy transfer (FRET) and fluorescence cross-correlation spectroscopy (FCCS) in live cells. FRET and FCCS studies will be performed by introducing fluorescent NER substrates into cells that already express GFP-tagged NER factors. The kinetics of NER factor assembly and their possible dynamic exchange on locally inflicted lesions will be determined by ultra-fast time-lapse imaging of GFP-tagged factors. While in vitro data should provide a detailed picture of damage recognition, complex assembly and incision during NER, in vivo studies will provide information on the dynamics of the assembly process in the cell. We expect that our studies will provide more insight into the NER mechanism and will contribute to close the gap between in vitro and in vivo studies. Our studies will provide more detailed insight into the assembly and architecture of the NER machinery at various stages of the reaction and in more general terms, provide knowledge into how an intricate protein complex assembles and performs its enzymatic activity in mammalian cells. The data resulted from this project will have a high impact to counteract consequences related to human diseases linked to the NER system and may help to design drugs to combat cancer and aging.
Dziedzina nauki (EuroSciVoc)
Klasyfikacja projektów w serwisie CORDIS opiera się na wielojęzycznej taksonomii EuroSciVoc, obejmującej wszystkie dziedziny nauki, w oparciu o półautomatyczny proces bazujący na technikach przetwarzania języka naturalnego. Więcej informacji: Europejski Słownik Naukowy.
Klasyfikacja projektów w serwisie CORDIS opiera się na wielojęzycznej taksonomii EuroSciVoc, obejmującej wszystkie dziedziny nauki, w oparciu o półautomatyczny proces bazujący na technikach przetwarzania języka naturalnego. Więcej informacji: Europejski Słownik Naukowy.
Projekt nie został jeszcze sklasyfikowany według klasyfikacji EuroSciVoc.
Wskaż dziedziny nauki, które twoim zdaniem są najbardziej istotne z punktu widzenia tego projektu i pomóż nam usprawnić naszą usługę klasyfikacji.
Aby użyć tej funkcji, musisz się zalogować lub zarejestrować
Słowa kluczowe
Słowa kluczowe dotyczące projektu wybrane przez koordynatora projektu. Nie należy mylić ich z pojęciami z taksonomii EuroSciVoc dotyczącymi dziedzin nauki.
Słowa kluczowe dotyczące projektu wybrane przez koordynatora projektu. Nie należy mylić ich z pojęciami z taksonomii EuroSciVoc dotyczącymi dziedzin nauki.
Program(-y)
Wieloletnie programy finansowania, które określają priorytety Unii Europejskiej w obszarach badań naukowych i innowacji.
Wieloletnie programy finansowania, które określają priorytety Unii Europejskiej w obszarach badań naukowych i innowacji.
Temat(-y)
Zaproszenia do składania wniosków dzielą się na tematy. Każdy temat określa wybrany obszar lub wybrane zagadnienie, których powinny dotyczyć wnioski składane przez wnioskodawców. Opis tematu obejmuje jego szczegółowy zakres i oczekiwane oddziaływanie finansowanego projektu.
Brak dostępnych danych
Zaproszenia do składania wniosków dzielą się na tematy. Każdy temat określa wybrany obszar lub wybrane zagadnienie, których powinny dotyczyć wnioski składane przez wnioskodawców. Opis tematu obejmuje jego szczegółowy zakres i oczekiwane oddziaływanie finansowanego projektu.
Zaproszenie do składania wniosków
Procedura zapraszania wnioskodawców do składania wniosków projektowych w celu uzyskania finansowania ze środków Unii Europejskiej.
Brak dostępnych danych
Procedura zapraszania wnioskodawców do składania wniosków projektowych w celu uzyskania finansowania ze środków Unii Europejskiej.
System finansowania
Program finansowania (lub „rodzaj działania”) realizowany w ramach programu o wspólnych cechach. Określa zakres finansowania, stawkę zwrotu kosztów, szczegółowe kryteria oceny kwalifikowalności kosztów w celu ich finansowania oraz stosowanie uproszczonych form rozliczania kosztów, takich jak rozliczanie ryczałtowe.
Program finansowania (lub „rodzaj działania”) realizowany w ramach programu o wspólnych cechach. Określa zakres finansowania, stawkę zwrotu kosztów, szczegółowe kryteria oceny kwalifikowalności kosztów w celu ich finansowania oraz stosowanie uproszczonych form rozliczania kosztów, takich jak rozliczanie ryczałtowe.
Brak dostępnych danych
Koordynator
ROTTERDAM
Niderlandy
Ogół kosztów poniesionych przez organizację w związku z uczestnictwem w projekcie. Obejmuje koszty bezpośrednie i pośrednie. Kwota stanowi część całkowitego budżetu projektu.