Czynnościowa rola białek
W ramach finansowanego przez UE projektu IDPBYNMR (High resolution tools to understand the functional role of protein intrinsic disorder) nawiązało współpracę pięć renomowanych instytutów biomedycznych, aby zbadać rolę czynnościową takich białek o strukturze nieuporządkowanej (IDP). Dane uzyskane w obrazowaniu NMR umożliwiają scharakteryzowanie białek z rozdzielczością w skali atomowej po opracowaniu odpowiednich metod i technik uzupełniających. Doktoranci nowo zrekrutowani do trudnych projektów badawczych poszukiwali potencjalnie użytecznych danych doświadczalnych do określenia zależności struktury od funkcji w przypadku IDP. Przeprowadzono też szereg szkoleń z udziałem cenionych ekspertów, aby zapewnić interdyscyplinarną wiedzę specjalistyczną. Badacze z projektu IDPBYNMR opracowali nowe techniki komputerowe i metody NMR do badania IDP w układach komórkowych. Udało się z powodzeniem scharakteryzować wirusowe IDP związane z atakiem na układ regulatorowy komórki oraz amyloidy wywołujące liczne choroby. Do innych istotnych IDP należą amyloidy, które odgrywają podstawową rolę w przebiegu wielu chorób. Naukowcy zaprojektowali i uzupełnili bazę danych IDP i danych doświadczalnych. Artykuł szczegółowo opisujący tę bazę danych został opublikowany w czasopiśmie Nucleic Acids Research. Wyniki popularyzowano też dzięki książce opublikowanej przez wydawnictwo Springer, "Intrinsically Disordered Proteins Studied by NMR Spectroscopy" oraz filmowi o projekcie. Ponadto opublikowano szereg artykułów w następujących czasopismach naukowych: PLoS ONE, Nature Communications i Nucleic Acids Research. Przełomowe działania w ramach projektu mogą być kluczem do opracowania nowych programów edukacyjnych i szkoleniowych dotyczących względnie nowej dziedziny jaką są IDP. Możliwe zastosowania są bardzo liczne i dotyczą w szczególności sektora biomedycznego i farmaceutycznego. Skutkiem może być opracowanie nowych, potencjalnych leków i biomarkerów do rozpoznawania i leczenia chorób oraz monitorowania postępów terapii.
Słowa kluczowe
Biologia strukturalna, białka o strukturze nieuporządkowanej, NMR, komputerowy, wirusowy, amyloid, biomedyczny, farmaceutyczny