Le risposte ai danni subiti dal DNA
Le cellule rispondono agli stress genotossici mediante numerosi percorsi, chiamati collettivamente risposta ai danni del DNA (DNA damage response, DDR), meccanismi di sorveglianza che fanno in modo che il DNA sia riparato o che la cellula muoia, impedendo così che trasferisca le mutazioni alle cellule figlie. Il percorso di riparazione del DNA è stato oggetto di studi approfonditi, tuttavia l’impatto dei regolatori post-trascrizionali come le proteine leganti l’RNA (RNA-binding protein, RBP) durante la DDR è ancora poco noto. Per approfondire questo aspetto, il progetto POSTSCRIBEDNADAMAGE (“Global characterization of post-transcriptional regulatory interactions in DNA damage response”), finanziato dall’UE, ha cercato di individuare quali RBP si legano alle molecole di mRNA in risposta ai danni del DNA. A questo scopo, il team ha sviluppato un test per identificare le proteine il cui legame con il mRNA cambia in seguito all’irradiazione ionizzante delle cellule del cancro al seno. Da queste cellule sono stati ottenuti complessi proteine-mRNA che sono poi stati analizzati tramite spettrometria di massa per valutare le modifiche specifiche della DDR nell’interazione mRNA-proteine. Applicando questa metodologia, i ricercatori hanno potuto identificare un maggiore legame del mRNA da parte di quasi 200 proteine in risposta all’irradiazione ionizzante. Tra queste proteine vi erano le RBP nucleari, proteine che partecipano alla biogenesi ribosomiale e che svolgono un ruolo noto nella DDR. Attività successive hanno mostrato che nella DDR potrebbero svolgersi oltre 12.000 eventi di legame proteine-mRNA, tuttavia saranno necessari ulteriori approfondimenti per chiarire con precisione il ruolo meccanicistico che svolgono nel processo. Ad oggi, i trascritti che contribuiscono al controllo del ciclo cellulare sono risultati più occupati dalle RBP durante la DDR. L’identificazione della natura post-trascrizionale della DDR getta nuova luce sugli eventi regolatori che si svolgono dopo il danneggiamento del DNA. Il coinvolgimento, scoperto recentemente, delle RBP nelle patologie umane rende questo studio di estrema importanza per la ricerca medica in questo settore. Considerato il malfunzionamento del percorso della DDR nel cancro, inoltre, i risultati ottenuti dal progetto potrebbero fornire nuovi obiettivi per lo studio delle terapie oncologiche.
Parole chiave
Risposta ai danni del DNA, regolatori post-trascrizionali, proteine leganti l’RNA, cancro