Analiza strukturalna bakteryjnych pomp wyrzutu leków
Transbłonowe białka transportowe stanowią komórkowe punkty wejścia różnych cząsteczek, jonów i składników odżywczych. W komórkach eukariotycznych znacząca część genów jest zakodowana dla takich białek transportowych, dodatkowo podkreślając zależność cyklu życia bakterii od tych cząsteczek. Analiza in silico wykazała obecność niespotykanie dużej ilości potencjalnych wielolekoodpornych (MDR) pomp wyrzutu u różnych bakterii chorobotwórczych, takich jak Bacillus cereus. Biorąc pod uwagę funkcję pomp MDR w wypompowywaniu leków przeciwbakteryjnych, badanie tych procesów transportu błonowego jest ważne dla zrozumienia ich wpływu na patogenezę chorób bakteryjnych. Mają to na uwadze, naukowcy z finansowanego przez UE projektu BACMT (Functional and structural analysis of bacterial membrane transporters) postanowili zbadać zależność między strukturą a funkcją białek transportu błonowego i ich ewolucyjne powiązania. Badacze scharakteryzowali przypuszczalne transportery wielolekowe, które są zachowane w ponad 80 patogennych szczepów B. cereus. W tym kontekście naukowcy usunęli kilka z tych genów pomp wyrzutu MDR i porównali mutacje do ich odpowiedników wśród dzikich szczepów. Te prace doprowadziły do odkrycia nowych pomp wyrzutu leków i całkowicie nowej rodziny wielolekowych pomp wyrzutu. Ponadto naukowcy dokonali nadekspresji tych pomp w E. coli i badali ich funkcjonalną rolę. Podsumowując, odkrycia zespołu BACMT dostarczyły cennych danych na temat roli pomp wyrzutu leków w patogenezie bakterii. Informacje strukturalne mogą stanowić podstawę do projektowania nowych leków lub terapii celowanych w zwalczaniu bakterii chorobotwórczych.
Słowa kluczowe
Bakterie, pompy wyrzutu leków, transbłonowe białka transportowe, wielolekoodporność