Wykorzystanie Internetu dla potrzeb genomiki
Autostrada informacyjna odgrywa kluczową rolę w łączeniu wielu różnych interesów biznesowych, a w ostatnich latach przyczyniła się do ich gwałtownego rozwoju. Jednak korzyści, jakie oferuje Internet, nie ograniczają się do interesów biznesowych i społecznych - także naukowcy z powodzeniem eksploatują jego olbrzymie możliwości. Celem nowego projektu finansowanego przez Unię Europejską jest zastosowanie Internetu do wychwytywania i gromadzenia w jednym miejscu informacji genetycznych, które oddziałują na ludzkie zdrowie i procesy chorobowe. Celem projektu jest utworzenie największego na świecie zintegrowanego katalogu zmian genetycznych, który stanowiłby dla naukowców źródło cennych informacji w walce z zaburzeniami takimi, jak cukrzyca, otyłość, choroby serca i nowotwory. Wartemu 12 milionów euro projektowi o nazwie Genotype-To-Phenotype Databases, w skrócie GEN2PHEN, będzie przewodniczył prof. Anthony Brookes z uniwersytetu w Leicester w Wielkiej Brytanii. Program obejmie 17 wiodących instytutów badawczych w Europie oraz po jednym z Indii i Południowej Afryki. Prof. Anthony Brookes tłumaczy: -Technologie badania zmian genetycznych w powszechnych zaburzeniach, takich jak cukrzyca, choroby serca, otyłość oraz choroby autoimmunologiczne, zostały opracowane zaledwie w ostatnich kilku latach i dopiero teraz znajdują szersze zastosowanie. - Ich efektem jest strumień interesujących, wartościowych i istotnych naukowych obserwacji dokonanych na niespotykaną dotąd skalę. Nadal brakuje jednak uniwersalnego systemu internetowego, w którym można by te dane zamieszczać, przechowywać i grupować oraz udostępniać na użytek badaczy i lekarzy. Autorzy projektu GEN2PHEN chcą, aby usprawnił on elektroniczne gromadzenie i wykorzystywanie międzynarodowych danych dotyczących wpływu sekwencji genów na różnice międzyosobnicze w zakresie przebiegu chorób, reakcji na lekarstwa i innych elementów, np. charakterystyki fenotypowej. Związki te uważa się za kluczowe dla przyszłego prognozowania, diagnozowania i leczenia chorób. W ramach GEN2PHEN powstanie zestaw elementów, narzędzi i technologii baz danych, które umożliwią właściwą integrację wszystkich wyników badań dotyczących chorób i zmian genomów oraz natychmiastową ich dostępność przez Internet dla potrzeb całościowej analizy. Częścią projektu będzie duży portal internetowy o nazwie GEN2PHEN Knowledge Centre. Będzie on ukazywał znaczenie rozwiązań wypracowanych w ramach projektu, a także umieszczał je w kontekście zaawansowanych funkcji wyszukiwania danych dotyczących korelacji genotyp-fenotyp i najnowszej wiedzy na temat baz danych z tej dziedziny. - Z tak zróżnicowanego składu uczestników projektu GEN2PHEN wynikają głębokie powiązania z kilkoma innymi ważnymi projektami międzynarodowymi realizowanymi w tej dziedzinie - powiedział prof. Brookes. - Stanowi to obietnicę osiągnięcia skoordynowanych na skalę globalną postępów w pozyskiwaniu bardziej wszechstronnej, użytecznej i dostępnej wiedzy o genetycznych podstawach życia człowieka. - Można spodziewać się, że z medycznego i społecznego punktu widzenia korzyści z tego projektu będą ogromne.