La lotta dell’Europa contro la resistenza microbica
i batteri farmacoresistenti ad alto rischio, che hanno una forte rilevanza critica e possono essere trasmessi in modo molto efficiente tra i pazienti ricoverati in ospedale. Altrettanto pericolosi sono i loro cloni, che provocano gravi infezioni per lunghi periodi di tempo. Tra le specie più a rischio di diffusione c’è l’MRSA (Staphylococcus aureus resistente alla meticillina), il VRE (Enterococcus resistente alla vancomicina) e l’ESMAC-BL (Enterobacteriaceae che produce beta-lattamasi AmpC), oltre alla Pseudomonas aeruginosa e all’Acinetobacter baumannii, multiresistenti. Il progetto TROCAR (Translational research on combating antimicrobial resistance), finanziato dall’UE, ha cercato di individuare le traiettorie evolutive e la storia naturale dei ceppi farmacoresistenti più virulenti dei patogeni batterici, con l’obiettivo di fornire alle autorità scientifiche e ai responsabili della salute pubblica linee di ricerca utili per testare nuovi interventi di contrasto. Avvalendosi dei dati epidemiologici e di metodologie di genomica e di proteomica, i ricercatori sono riusciti a definire i tratti specifici associati a virulenza, trasmissione e persistenza dei cloni resistenti. Il confronto diretto con i cloni non epidemici ha permesso di identificare i determinanti della resistenza e la loro localizzazione genetica. Nel VRE, ad esempio, un approccio trascrittomico globale ha identificato nell’AsrR un regolatore chiave che modula i tratti opportunistici e la patogenesi. Collettivamente, le informazioni ottenute hanno fornito un inventario dei ceppi di MRSA, VRE, ESMAC-BL e Pseudomonas. La distribuzione geografica dei cloni MRSA è stata illustrata grazie a uno strumento di mappatura Web basato su interfaccia Google. Il consorzio, inoltre, ha sviluppato nuovi strumenti basati su array per la rilevazione semplice e rapida dei geni di resistenza nell’ESMAC-BL in circolazione. Uno dei meccanismi chiave per l’acquisizione della resistenza è il trasferimento orizzontale di DNA tra i batteri. Il lavoro svolto dal team TROCAR ha rivelato una variazione significativa nei tassi di ricombinazione tra i gruppi filogenetici diversi, che dimostra l’esistenza di una correlazione tra i fattori epidemiologici e le dinamiche molecolari. Nel complesso, le osservazioni e gli strumenti del progetto TROCAR aiuteranno a identificare i possibili serbatoi di geni della resistenza agli antibiotici e a tenere sotto controllo la diffusione dei principali patogeni ospedalieri e delle comunità.
Parole chiave
Resistenza agli antibiotici, MRSA, VRE, filogenetico, epidemiologia
