Skip to main content
Przejdź do strony domowej Komisji Europejskiej (odnośnik otworzy się w nowym oknie)
polski pl
CORDIS - Wyniki badań wspieranych przez UE
CORDIS

Cross-evolutionary dissection of the functional plasticity of the ribosomal epitranscriptome

Opis projektu

Jaką funkcjonalną rolę odgrywają modyfikacje rybosomalnego RNA?

Rybosomalny RNA (rRNA) jest integralnym składnikiem rybosomów odpowiedzialnych za produkcję białek. Coraz więcej dowodów wskazuje na istnienie epigenetycznych modyfikacji rRNA, które w zależności od rodzaju komórek lub warunków środowiskowych mogą się od siebie różnić. To z kolei sugeruje, że regulacja właściwości rybosomu może odbywać się za pośrednictwem modyfikacji rRNA i przypominać procesy adaptacyjne zachodzące w odpowiedzi na zmiany środowiska, narażenie na stres lub patologię. Głównym celem finansowanego ze środków UE projektu EpiRibo jest profilowanie modyfikacji rRNA w różnych rodzajach komórek oraz dokładniejsze poznanie ich regulacji w drodze ewolucji. Ponadto, dzięki podejściu opartemu na zyskiwaniu i utracie funkcji, naukowcy poznają funkcje rybosomów będące efektem modyfikacji RNA.

Cel

A remarkable diversity of post-transcriptional modifications adorn the ribosomal RNA (rRNA) throughout all domains of life. While initially conceptualized as a constitutive component of the ribosome, recent evidence demonstrates that some modifications are only present on a fraction of cellular ribosomes, and our lab recently revealed unprecedented environmentally-mediated dynamics of an rRNA modification. This suggests that some rRNA modification may serve as a tunable layer for regulation of ribosome properties, facilitating adaptation to a new environment, stress or pathological state. Here we aim to systematically explore the extent to which rRNA modifications are tunable across evolution and highly diverse growth conditions, and to understand the consequences thereof. We seek to understand which rRNA modifications are subject to regulation, to uncover the contexts in which such regulation occurs, and to unravel the underlying mechanisms. Dissecting these questions requires an approach allowing systematic measurement of diverse rRNA modifications. We propose to establish a streamlined workflow, allowing multiplexed, precise, robust and cost-efficient systematic profiling of 19 distinct rRNA modifications in dozens of samples in a single experiment (Aim 1). In Aim 2, we will systematically measure rRNA modifications across the three domains of life, focusing on species that can thrive across two widely different physical/chemical gradients, where the potential for tunable rRNA modifications is particularly high. In Aim 3, we will combine gain- and loss-of-function approaches to systematically explore the functions RNA modifications can bestow on ribosomes. Collectively, EpiRibo addresses a fundamental open question regarding the extent of plasticity and regulatory potential present within the ribosome itself and encoded via its epitranscriptome, setting the stage for investigations in other RNA species, and in more complex and disease-related contexts.

Dziedzina nauki (EuroSciVoc)

Słowa kluczowe

Program(-y)

Temat(-y)

System finansowania

ERC-COG - Consolidator Grant

Wyświetl wszystkie projekty finansowane w ramach tego programu finansowania

Zaproszenie do składania wniosków

(odnośnik otworzy się w nowym oknie) ERC-2020-COG

Wyświetl wszystkie projekty finansowane w ramach tego zaproszenia

Instytucja przyjmująca

WEIZMANN INSTITUTE OF SCIENCE
Wkład UE netto
€ 2 000 000,00
Koszt całkowity
€ 2 000 000,00

Beneficjenci (1)