Skip to main content
Przejdź do strony domowej Komisji Europejskiej (odnośnik otworzy się w nowym oknie)
polski polski
CORDIS - Wyniki badań wspieranych przez UE
CORDIS

Enabling Live-Cell 4D Super-Resolution Microscopy Guided by Artificial Intelligence

CORDIS oferuje możliwość skorzystania z odnośników do publicznie dostępnych publikacji i rezultatów projektów realizowanych w ramach programów ramowych HORYZONT.

Odnośniki do rezultatów i publikacji związanych z poszczególnymi projektami 7PR, a także odnośniki do niektórych konkretnych kategorii wyników, takich jak zbiory danych i oprogramowanie, są dynamicznie pobierane z systemu OpenAIRE .

Publikacje

High-fidelity 3D live-cell nanoscopy through data-driven enhanced super-resolution radial fluctuation (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Romain F. Laine, Hannah S. Heil, Simao Coelho, Jonathon Nixon-Abell, Angélique Jimenez, Theresa Wiesner, Damián Martínez, Tommaso Galgani, Louise Régnier, Aki Stubb, Gautier Follain, Samantha Webster, Jesse Goyette, Aurelien Dauphin, Audrey Salles, Siân Culley, Guillaume Jacquemet, Bassam Hajj, Christophe Leterrier, Ricardo Henriques
Opublikowane w: Nature Methods, 2023, ISSN 1548-7091
Wydawca: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41592-023-02057-w

Democratising deep learning for microscopy with ZeroCostDL4Mic (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Lucas von Chamier, Romain F. Laine, Johanna Jukkala, Christoph Spahn, Daniel Krentzel, Elias Nehme, Martina Lerche, Sara Hernández-Pérez, Pieta K. Mattila, Eleni Karinou, Séamus Holden, Ahmet Can Solak, Alexander Krull, Tim-Oliver Buchholz, Martin L. Jones, Loïc A. Royer, Christophe Leterrier, Yoav Shechtman, Florian Jug, Mike Heilemann, Guillaume Jacquemet, Ricardo Henriques
Opublikowane w: Nature Communications, 2021, ISSN 2041-1723
Wydawca: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-021-22518-0

DeepBacs for multi-task bacterial image analysis using open-source deep learning approaches (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Christoph Spahn, Estibaliz Gómez-de-Mariscal, Romain F. Laine, Pedro M. Pereira, Lucas von Chamier, Mia Conduit, Mariana G. Pinho, Guillaume Jacquemet, Séamus Holden, Mike Heilemann, Ricardo Henriques
Opublikowane w: Communications Biology, 2022, ISSN 2399-3642
Wydawca: Springer Nature
DOI: 10.1038/s42003-022-03634-z

Avoiding a replication crisis in deep-learning-based bioimage analysis (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Romain F. Laine, Ignacio Arganda-Carreras, Ricardo Henriques, Guillaume Jacquemet
Opublikowane w: Nature Methods, Numer 18, 2021, Strona(/y) 1136-1144, ISSN 1548-7091
Wydawca: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41592-021-01284-3

CellTracksColab is a platform that enables compilation, analysis, and exploration of cell tracking data (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Estibaliz Gómez-de-Mariscal, Hanna Grobe, Joanna W. Pylvänäinen, Laura Xénard, Ricardo Henriques, Jean-Yves Tinevez, Guillaume Jacquemet
Opublikowane w: PLOS Biology, Numer 22, 2024, Strona(/y) e3002740, ISSN 1545-7885
Wydawca: Public Library of Science (PLoS)
DOI: 10.1371/journal.pbio.3002740

Mapping molecular complexes with super-resolution microscopy and single-particle analysis (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Afonso Mendes; Hannah S. Heil; Simao Coelho; Christophe Leterrier; Ricardo Henriques
Opublikowane w: Open Biology, Numer 2, 2022, ISSN 2046-2441
Wydawca: Royal Society Publishing
DOI: 10.1098/rsob.220079

Trimethine Cyanine Dyes as NA-Sensitive Probes for Visualization of Cell Compartments in Fluorescence Microscopy (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Daria Aristova; Roman Selin; Hannah Sophie Heil; Viktoriia Kosach; Yuriy Slominsky; Sergiy Yarmoluk; Vasyl Pekhnyo; Vladyslava Kovalska; Ricardo Henriques; Andriy Mokhir; Svitlana Chernii
Opublikowane w: ACS Omega, Numer 3, 2022, ISSN 2470-1343
Wydawca: American Chemical Society omega
DOI: 10.1021/acsomega.2c05231

Cell constriction requires processive septal peptidoglycan synthase movement independent of FtsZ treadmilling in Staphylococcus aureus (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Simon Schäper, António D. Brito, Bruno M. Saraiva, Georgia R. Squyres, Matthew J. Holmes, Ethan C. Garner, Zach Hensel, Ricardo Henriques, Mariana G. Pinho
Opublikowane w: Nature Microbiology, Numer 9, 2024, Strona(/y) 1049-1063, ISSN 2058-5276
Wydawca: Springer Science and Business Media LLC
DOI: 10.1038/s41564-024-01629-6

Efficiently accelerated bioimage analysis with NanoPyx, a Liquid Engine-powered Python framework (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Bruno M. Saraiva, Inês Cunha, António D. Brito, Gautier Follain, Raquel Portela, Robert Haase, Pedro M. Pereira, Guillaume Jacquemet, Ricardo Henriques
Opublikowane w: Nature Methods, Numer 22, 2025, Strona(/y) 283-286, ISSN 1548-7091
Wydawca: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41592-024-02562-6

Fast4DReg: Fast registration of 4D microscopy datasets

Autorzy: Joanna W Pylvänäinen; Romain F Laine; Bruno M.S. Saraiva; Sujan Ghimire; Gautier Follain; Ricardo Henriques; Guillaume Jacquemet
Opublikowane w: Journal of Cell Science, 2023, ISSN 0021-9533
Wydawca: The Company of Biologists Ltd.

The rise of data‐driven microscopy powered by machine learning (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Leonor Morgado, Estibaliz Gómez‐de‐Mariscal, Hannah S. Heil, Ricardo Henriques
Opublikowane w: Journal of Microscopy, Numer 295, 2024, Strona(/y) 85-92, ISSN 0022-2720
Wydawca: Blackwell Publishing Inc.
DOI: 10.1111/jmi.13282

Single-Molecule Super-Resolution Imaging of T-Cell Plasma Membrane CD4 Redistribution upon HIV-1 Binding. (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Yue Yuan; Caron Jacobs; Caron Jacobs; Isabel Llorente Garcia; Pedro M. Pereira; Pedro M. Pereira; Scott P. Lawrence; Romain F. Laine; Romain F. Laine; Mark Marsh; Ricardo Henriques; Ricardo Henriques; Ricardo Henriques
Opublikowane w: Viruses, Numer 1, 2021, ISSN 1999-4915
Wydawca: Multidisciplinary Digital Publishing Institute (MDPI)
DOI: 10.3390/v13010142

Expansion microscopy on Saccharomyces cerevisiae (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Artemis G. Korovesi, Leonor Morgado, Marco Fumasoni, Ricardo Henriques, Hannah Heil, Mario Del Rosario
Opublikowane w: microPublication Biology, 2022, ISSN 2578-9430
Wydawca: microPublication Biology
DOI: 10.17912/micropub.biology.000566

Nanoscale Colocalization of NK Cell Activating and Inhibitory Receptors Controls Signal Integration (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: David Tomaz; Pedro Matos Pereira; Nadia Guerra; Julian Dyson; Keith Gould; Ricardo Henriques
Opublikowane w: Frontiers in Immunology, 2022, ISSN 1664-3224
Wydawca: Frontiers in immunology
DOI: 10.3389/fimmu.2022.868496

eHooke: A tool for automated image analysis of spherical bacteria based on cell cycle progression (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Bruno M. Saraiva, Ludwig Krippahl, Sérgio R. Filipe, Ricardo Henriques, Mariana G. Pinho
Opublikowane w: Biological Imaging, Numer 1, 2021, ISSN 2633-903X
Wydawca: Cambridge University Press (CUP)
DOI: 10.1017/s2633903x21000027

Live-cell imaging in the deep learning era (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Joanna W Pylvänäinen, Estibaliz Gómez-de-Mariscal, Ricardo Henriques, Guillaume Jacquemet
Opublikowane w: Current opinion in cell biology, 2023, ISSN 1879-0410
Wydawca: Current opinion in cell biology
DOI: 10.1016/j.ceb.2023.102271

PhotoFiTT: A Quantitative Framework for Assessing Phototoxicity in Live-Cell Microscopy Experiments (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Mario Del Rosario, Estibaliz Gómez-de-Mariscal, Leonor Morgado, Raquel Portela, Guillaume Jacquemet, Pedro M. Pereira, Ricardo Henriques
Opublikowane w: bioRxiv, 2024, ISSN 2692-8205
Wydawca: bioRxiv
DOI: 10.1101/2024.07.16.603046

Processive movement of Staphylococcus aureus essential septal peptidoglycan synthases is independent of FtsZ treadmilling and drives cell constriction (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Simon Schaeper, Antonio D Brito, Bruno M Saraiva, Georgia R Squyres, Matthew J Holmes, Ethan C Garner, Zach Hensel, Ricardo Henriques, Mariana G Pinho
Opublikowane w: bioRxiv, 2023, ISSN 2692-8205
Wydawca: bioRxiv
DOI: 10.1101/2023.06.29.547026

NanoPyx: super-fast bioimage analysis powered by adaptive machine learning (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Bruno M. Saraiva, Inês M. Cunha, António D. Brito, Gautier Follain, Raquel Portela, Robert Haase, Pedro M. Pereira, Guillaume Jacquemet, Ricardo Henriques
Opublikowane w: bioRxiv, 2023, ISSN 2692-8205
Wydawca: bioRxiv
DOI: 10.1101/2023.08.13.553080

Transertion and cell geometry organize the Escherichia coli nucleoid during rapid growth (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Christoph Spahn, Stuart Middlemiss, Estibaliz Gómez-de-Mariscal, Ricardo Henriques, Helge B. Bode, Séamus Holden, Mike Heilemann
Opublikowane w: bioRxiv, 2023, ISSN 2692-8205
Wydawca: bioRxiv
DOI: 10.1101/2023.10.16.562172

Roadmap on Deep Learning for Microscopy (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Volpe, Giovanni; Wählby, Carolina; Tian, Lei; Hecht, Michael; Yakimovich, Artur; Monakhova, Kristina; Waller, Laura; Sbalzarini, Ivo F.; Metzler, Christopher A.; Xie, Mingyang; Zhang, Kevin; Lenton, Isaac C. D.; Rubinsztein-Dunlop, Halina; Brunner, Daniel; Bai, Bijie; Ozcan, Aydogan; Midtvedt, Daniel; Wang, Hao; Sladoje, Nataša; Lindblad, Joakim; Smith, Jason T.; Ochoa, Marien; Barroso, Margarid
Opublikowane w: arXiv, 2023, ISSN 2331-8422
Wydawca: arXiv
DOI: 10.48550/arxiv.2303.03793

Harnessing Artificial Intelligence To Reduce Phototoxicity in Live Imaging (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Gómez-de-Mariscal, Estibaliz; Del Rosario, Mario; Pylvänäinen, Joanna W; Jacquemet, Guillaume; Henriques, Ricardo
Opublikowane w: arXiv, 2023, ISSN 2331-8422
Wydawca: arXiv
DOI: 10.48550/arxiv.2308.04387

CLEM-Reg: An automated point cloud based registration algorithm for correlative light and volume electron microscopy (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Daniel Krentzel; Matouš Elphick; Marie-Charlotte Domart; Christopher J. Peddie; Romain F. Laine; Ricardo Henriques; Lucy M. Collinson; Martin L. Jones
Opublikowane w: bioRxiv, 2023, ISSN 2692-8205
Wydawca: bioRxiv
DOI: 10.1101/2023.05.11.540445

DL4MicEverywhere: Deep learning for microscopy made flexible, shareable, and reproducible (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Iván Hidalgo-Cenalmor, Joanna W Pylvänäinen, Mariana G Ferreira, Craig T Russell, Ignacio Arganda-Carreras, AI4Life Consortium, Guillaume Jacquemet, Ricardo Henriques, Estibaliz Gómez-de-Mariscal
Opublikowane w: bioRxiv, 2023, ISSN 2692-8205
Wydawca: bioRxiv
DOI: 10.1101/2023.11.19.567606

Wyszukiwanie danych OpenAIRE...

Podczas wyszukiwania danych OpenAIRE wystąpił błąd

Brak wyników

Moja broszura 0 0