Opis projektu
Przewidywanie struktury i funkcji cząsteczek RNA
W ostatnich latach odkryto wiele cząsteczek RNA, na przykład mikroRNA, małe jądrowe RNA oraz piRNA, w związku z czym pojawiła się potrzeba opracowania niezawodnych metod przewidywania ich struktury i funkcji. Zespół finansowanego ze środków UE projektu RNA-RAPSODY zaproponował zatem ramy matematyczne, które pozwolą uwzględnić wiele parametrów biologicznych i strukturalnych cząsteczek RNA oraz będą generować przydatne wyniki. Wdrożenie takiego rozwiązania pozwoli naukowcom uzyskiwać istotne informacje na temat cząsteczek RNA powiązanych z procesami molekularnymi i genetycznymi o dużym znaczeniu medycznym i farmaceutycznym.
Cel
The proposed bioinformatics project has strong ties to even several diverse disciplines, namely computer science, molecular biology, genetics, mathematics and statistics. RNA Biology plays a central role in bioinformatics research such that numerous model-driven algorithms and methods are developed to predict and calculate structures and functions or compare sequences of RNA molecules that are essential in molecular and genetic processes and thus for medical and pharmaceutical applications.
Many of these problems can be cleanly phrased as optimization problems with 'optimal substructure' and thus solved exactly and efficiently by dynamic programming (for arbitrary parametrization of the objective function). This project will systematically explore the impact of parameter changes on the quality of results of DP optimization methods, such as predictions of molecule structures or comparison of sequences. Our approach strongly relies on algebraic dynamic programming (ADP), which decouples the decomposition of the search space from the algebra used to compute a final result. Thus, the ADP framework provides a unified setting and a generic implementation to quickly test working hypotheses. Here, it enables naturally implementing the suggested parametric optimization by developing novel algebras. Those include the polytope algebra, which allows to segment the parameter space based on its impact of the final prediction, and a formal derivative algebra, which allows to compute the derivative of ensemble predictions with respect to a given parameter. Conversely, those methods can be used to learn the optimal parameter sets based on a reference set of instances. This will result in deeper insights into robustness of the algorithms to changes of parameters or input data and hence, results can be assessed based on robustness measures and leads to the calculation of biologically more meaningful results.
The overall methodology will be applied to problems in RNA Bioinformatics.
Dziedzina nauki (EuroSciVoc)
Klasyfikacja projektów w serwisie CORDIS opiera się na wielojęzycznej taksonomii EuroSciVoc, obejmującej wszystkie dziedziny nauki, w oparciu o półautomatyczny proces bazujący na technikach przetwarzania języka naturalnego. Więcej informacji: Europejski Słownik Naukowy.
Klasyfikacja projektów w serwisie CORDIS opiera się na wielojęzycznej taksonomii EuroSciVoc, obejmującej wszystkie dziedziny nauki, w oparciu o półautomatyczny proces bazujący na technikach przetwarzania języka naturalnego. Więcej informacji: Europejski Słownik Naukowy.
- inżynieria i technologia biotechnologia przemysłowa biomateriały bioplastik kwas polimlekowy
- nauki przyrodnicze matematyka matematyka czysta algebra
- nauki przyrodnicze nauki biologiczne genetyka RNA
Aby użyć tej funkcji, musisz się zalogować lub zarejestrować
Przepraszamy… podczas wykonywania operacji wystąpił nieoczekiwany błąd.
Wymagane uwierzytelnienie. Powodem może być wygaśnięcie sesji.
Dziękujemy za przesłanie opinii. Wkrótce otrzymasz wiadomość e-mail z potwierdzeniem zgłoszenia. W przypadku wybrania opcji otrzymywania powiadomień o statusie zgłoszenia, skontaktujemy się również gdy status ulegnie zmianie.
Słowa kluczowe
Słowa kluczowe dotyczące projektu wybrane przez koordynatora projektu. Nie należy mylić ich z pojęciami z taksonomii EuroSciVoc dotyczącymi dziedzin nauki.
Słowa kluczowe dotyczące projektu wybrane przez koordynatora projektu. Nie należy mylić ich z pojęciami z taksonomii EuroSciVoc dotyczącymi dziedzin nauki.
Program(-y)
Wieloletnie programy finansowania, które określają priorytety Unii Europejskiej w obszarach badań naukowych i innowacji.
Wieloletnie programy finansowania, które określają priorytety Unii Europejskiej w obszarach badań naukowych i innowacji.
-
H2020-EU.1.3. - EXCELLENT SCIENCE - Marie Skłodowska-Curie Actions
GŁÓWNY PROGRAM
Wyświetl wszystkie projekty finansowane w ramach tego programu -
H2020-EU.1.3.2. - Nurturing excellence by means of cross-border and cross-sector mobility
Wyświetl wszystkie projekty finansowane w ramach tego programu
Temat(-y)
Zaproszenia do składania wniosków dzielą się na tematy. Każdy temat określa wybrany obszar lub wybrane zagadnienie, których powinny dotyczyć wnioski składane przez wnioskodawców. Opis tematu obejmuje jego szczegółowy zakres i oczekiwane oddziaływanie finansowanego projektu.
Zaproszenia do składania wniosków dzielą się na tematy. Każdy temat określa wybrany obszar lub wybrane zagadnienie, których powinny dotyczyć wnioski składane przez wnioskodawców. Opis tematu obejmuje jego szczegółowy zakres i oczekiwane oddziaływanie finansowanego projektu.
System finansowania
Program finansowania (lub „rodzaj działania”) realizowany w ramach programu o wspólnych cechach. Określa zakres finansowania, stawkę zwrotu kosztów, szczegółowe kryteria oceny kwalifikowalności kosztów w celu ich finansowania oraz stosowanie uproszczonych form rozliczania kosztów, takich jak rozliczanie ryczałtowe.
Program finansowania (lub „rodzaj działania”) realizowany w ramach programu o wspólnych cechach. Określa zakres finansowania, stawkę zwrotu kosztów, szczegółowe kryteria oceny kwalifikowalności kosztów w celu ich finansowania oraz stosowanie uproszczonych form rozliczania kosztów, takich jak rozliczanie ryczałtowe.
MSCA-IF - Marie Skłodowska-Curie Individual Fellowships (IF)
Wyświetl wszystkie projekty finansowane w ramach tego programu finansowania
Zaproszenie do składania wniosków
Procedura zapraszania wnioskodawców do składania wniosków projektowych w celu uzyskania finansowania ze środków Unii Europejskiej.
Procedura zapraszania wnioskodawców do składania wniosków projektowych w celu uzyskania finansowania ze środków Unii Europejskiej.
(odnośnik otworzy się w nowym oknie) H2020-MSCA-IF-2020
Wyświetl wszystkie projekty finansowane w ramach tego zaproszeniaKoordynator
Kwota netto dofinansowania ze środków Unii Europejskiej. Suma środków otrzymanych przez uczestnika, pomniejszona o kwotę unijnego dofinansowania przekazanego powiązanym podmiotom zewnętrznym. Uwzględnia podział unijnego dofinansowania pomiędzy bezpośrednich beneficjentów projektu i pozostałych uczestników, w tym podmioty zewnętrzne.
91128 PALAISEAU CEDEX
Francja
Ogół kosztów poniesionych przez organizację w związku z uczestnictwem w projekcie. Obejmuje koszty bezpośrednie i pośrednie. Kwota stanowi część całkowitego budżetu projektu.