Skip to main content
Przejdź do strony domowej Komisji Europejskiej (odnośnik otworzy się w nowym oknie)
polski pl
CORDIS - Wyniki badań wspieranych przez UE
CORDIS

How epigenetic reprogramming modulates 3D chromatin organization in totipotent embryos

Opis projektu

Przeprogramowanie epigenetyczne definiuje trójwymiarową strukturę chromatyny oraz aktywację genomu w zygocie

Totipotencja zygoty jednokomórkowej, dzięki której powstają wszystkie typy komórek organizmu, jest bardzo intrygującym zagadnieniem biologicznym. Ogólnym celem finansowanego ze środków UE projektu Epigenome_embryo jest zrozumienie mechanizmów powstawania stanu totipotencji. Tworzenie zygoty wiąże się z demetylacją DNA genomu ojca oraz asymetrią w modyfikacjach histonów pomiędzy genomami rodziców. Naukowcy zbadają, czy i w jaki sposób przeprogramowanie epigenetyczne moduluje trójwymiarową strukturę chromatyny w zygotach. Aby przeanalizować aktywację genomu zygoty, badacze wykorzystają ukierunkowane badanie przesiewowe z wyłączaniem w embrionach, by poznać czynniki konieczne dla takiej aktywacji.

Cel

One of the most intriguing questions in biology is how a single cell (zygote) is generated that has the potential to give rise to all cell types of an organism, known as totipotency. The overall purpose of this project is to gain mechanistic insights into the establishment of the totipotent state, in terms of 3D chromatin organization and zygotic genome activation (ZGA), summarized in two key aims:

i)To test whether and how epigenetic reprogramming modulates the 3D chromatin structure in zygotes: The generation of a zygote is accompanied by Tet3-dependent active DNA demethylation of the paternal genome and asymmetry in histone modifications between the parental genomes. Whether this alters chromatin organization and promotes transcription is poorly understood. To test this, I will perturb Tet3 activity and perform single nucleus Hi-C (snHi-C) of zygotes to determine changes in genome architecture. In addition, I will study the effect of the absence of Kdm4a on the different histone marks and the consequent potential effect on chromatin architecture. This work will provide the first insights into how epigenetic reprogramming alters chromatin organization.

ii) To study the mechanism of ZGA: The activation of embryonic transcription is crucial for the development of an organism. However, the essential activators of ZGA in mammals remain largely unidentified. Based on work in Drosophila, a leading hypothesis is that ZGA is triggered by pioneer transcription factors. To identify these, I will participate in a targeted knockdown screen in embryos to identify factors required for ZGA. I will focus on one potential candidate and generate transgenic mouse strains to study its function in early embryos. This high-risk high-gain aim has the potential to identify novel regulators of the mammalian ZGA.

Dziedzina nauki (EuroSciVoc)

Słowa kluczowe

Program(-y)

Temat(-y)

System finansowania

MSCA-IF - Marie Skłodowska-Curie Individual Fellowships (IF)

Wyświetl wszystkie projekty finansowane w ramach tego programu finansowania

Zaproszenie do składania wniosków

(odnośnik otworzy się w nowym oknie) H2020-MSCA-IF-2020

Wyświetl wszystkie projekty finansowane w ramach tego zaproszenia

Koordynator

INSTITUT FUER MOLEKULARE BIOTECHNOLOGIE GMBH
Wkład UE netto
€ 174 167,04
Adres
DR BOHRGASSE 3
1030 Wien
Austria
Region
Ostösterreich Wien Wien
Rodzaj działalności
Private for-profit entities (excluding Higher or Secondary Education Establishments)
Linki
Koszt całkowity
€ 174 167,04