Deep Neuron Embeddings: Data-driven multi-modal discovery of cell types in the neocortex

Informacje na temat projektu

DeepNeuronEmbeddings

Identyfikator umowy o grant: 101041669

DOI

10.3030/101041669

Data podpisania przez KE 8 Lutego 2022

Data rozpoczęcia 1 Czerwca 2022

Data zakończenia 31 Maja 2027

Finansowanie w ramach

• European Research Council (ERC)

Koszt całkowity

€ 1 500 000,00

Wkład UE

€ 1 500 000,00

Koordynowany przez

GEORG-AUGUST-UNIVERSITAT GOTTINGEN STIFTUNG OFFENTLICHEN RECHTS
Germany

CORDIS oferuje możliwość skorzystania z odnośników do publicznie dostępnych publikacji i rezultatów projektów realizowanych w ramach programów ramowych HORYZONT.

Odnośniki do rezultatów i publikacji związanych z poszczególnymi projektami 7PR, a także odnośniki do niektórych konkretnych kategorii wyników, takich jak zbiory danych i oprogramowanie, są dynamicznie pobierane z systemu OpenAIRE .

Rezultaty

Documents, reports (1)

Data Management Plan

A plan for managing and publishing data will be developed.

Publikacje

Conference proceedings (6)

Learning to cluster neuronal function

Autorzy: Nina S Nellen, Polina Turishcheva, Michaela Vystrčilová, Shashwat Sridhar, Tim Gollisch, Andreas S Tolias, Alexander S Ecker
Opublikowane w: Advances in Neural Information Processing Systems, 2025
Wydawca: Advances in Neural Information Processing Systems

What should a neuron aim for? Designing local objective functions based on information theory

Autorzy: Schneider, Andreas C.; Neuhaus, Valentin; Ehrlich, David Alexander; Makkeh, Abdullah; Ecker, Alexander S.; Priesemann, Viola; Wibral, Michael
Opublikowane w: International Conference on Learning Representations (ICLR), 2024
Wydawca: International Conference on Learning Representations (ICLR)
DOI: 10.5281/ZENODO.15510651

The Sensorium competition on predicting large-scale mouse primary visual cortex activity

Autorzy: Willeke, Konstantin F.; Fahey, Paul G.; Bashiri, Mohammad; Pede, Laura; Burg, Max F.; Blessing, Christoph; Cadena, Santiago A.; Ding, Zhiwei; Lurz, Konstantin-Klemens; Ponder, Kayla; Muhammad, Taliah; Patel, Saumil S.; Ecker, Alexander S.; Tolias, Andreas S.; Sinz, Fabian H.
Opublikowane w: Advances in Neural Information Processing Systems (NeurIPS), 2023
Wydawca: Advances in Neural Information Processing Systems (NeurIPS)
DOI: 10.48550/arxiv.2206.08666

Retrospective for the Dynamic Sensorium Competition for predicting large-scale mouse primary visual cortex activity from videos

Autorzy: Polina Turishcheva, Paul G. Fahey, Michaela Vystrčilová, Laura Hansel, ..., Andreas S. Tolias, Fabian H. Sinz, Alexander S. Ecker
Opublikowane w: Advances in Neural Information Processing Systems, 2024
Wydawca: Advances in Neural Information Processing Systems

Most discriminative stimuli for functional cell type identification

Autorzy: Burg, Max F.; Zenkel, Thomas; Vystrčilová, Michaela; Oesterle, Jonathan; Höfling, Larissa; Willeke, Konstantin F.; Lause, Jan; Müller, Sarah; Fahey, Paul G.; Ding, Zhiwei; Restivo, Kelli; Sridhar, Shashwat; Gollisch, Tim; Berens, Philipp; Tolias, Andreas S.; Euler, Thomas; Bethge, Matthias; Ecker, Alexander S.
Opublikowane w: International Conference on Learning Representations, 2024
Wydawca: International Conference on Learning Representations

Reproducibility of predictive networks for mouse visual cortex

Autorzy: Polina Turishcheva, Max Burg, Fabian H Sinz, Alexander Ecker
Opublikowane w: Advances in Neural Information Processing Systems, 2024
Wydawca: NeurIPS Foundation

Other (4)

Bipartite invariance in mouse primary visual cortex

Autorzy: Zhiwei Ding; Dat T. Tran; Kayla Ponder; Erick Cobos; Zhuokun Ding; Paul G. Fahey; Eric Wang; Taliah Muhammad; Jiakun Fu; Santiago A. Cadena; Stelios Papadopoulos; Saumil Patel; Katrin Franke; Jacob Reimer; Fabian H. Sinz; Alexander S. Ecker; Xaq Pitkow; Andreas S. Tolias
Opublikowane w: bioRxiv, 2023
Wydawca: bioRxiv
DOI: 10.1101/2023.03.15.532836

MorphOcc: An Implicit Generative Model of Neuronal Morphologies

Autorzy: Laura Hansel, Timo Lüddecke, Marissa A. Weis, Alexander S Ecker
Opublikowane w: OpenReview, 2023
Wydawca: OpenReview

Willeke, Restivo, Franke, Nix, Cadena, ... Ecker, Sinz & Tolias (2023): Deep learning-driven characterization of single cell tuning in primate visual area V4 unveils topological organization. bioRxiv.

Autorzy: Willeke, K.F., Restivo, K., Franke, K., Nix, A.F., Cadena, S.A., Shinn, T., Nealley, C., Rodriguez, G., Patel, S.S., Ecker, A.S., Sinz, F.H., & Tolias, A.S.
Opublikowane w: bioRxiv, 2023
Wydawca: bioRxiv
DOI: 10.1101/2023.05.12.540591

Pattern completion and disruption characterize contextual modulation in mouse visual cortex

Autorzy: Jiakun Fu; Suhas Shrinivasan; Kayla Ponder; Taliah Muhammad; Zhuokun Ding; Eric Wang; Zhiwei Ding; Dat T. Tran; Paul G. Fahey; Stelios Papadopoulos; Saumil Patel; Jacob Reimer; Alexander S. Ecker; Xaq Pitkow; Ralf M. Haefner; Fabian H. Sinz; Katrin Franke; Andreas S. Tolias
Opublikowane w: bioRxiv, 2023
Wydawca: bioRxiv
DOI: 10.1101/2023.03.13.532473

Peer reviewed articles (4)

Nature Communications

Autorzy: Weis, MA ... Ecker, AS
Opublikowane w: Nature Communications, 2025, ISSN 2041-1723
Wydawca: Springer Nature
DOI: 10.1101/2022.12.22.521541

Foundation model of neural activity predicts response to new stimulus types

Autorzy: Eric Y. Wang; Paul G. Fahey; Zhuokun Ding; Stelios Papadopoulos; Kayla Ponder; Marissa A. Weis; Andersen Chang; Taliah Muhammad; Saumil Patel; Zhiwei Ding; Dat Tran; Jiakun Fu; Casey M. Schneider-Mizell; Nuno Maçarico da Costa; R. Clay Reid; Forrest Collman; Nuno Maçarico da Costa; Katrin Franke; Alexander S. Ecker; Jacob Reimer; Xaq Pitkow; Fabian H. Sinz; Andreas S. Tolias
Opublikowane w: Nature, 2025, ISSN 1476-4687
Wydawca: Springer Nature
DOI: 10.1038/S41586-025-08829-Y

Self-Supervised Graph Representation Learning for Neuronal Morphologies

Autorzy: Weis, Marissa A.; Hansel, Laura; Lüddecke, Timo; Ecker, Alexander S.
Opublikowane w: Transactions on Machine Learning Research, 2023
Wydawca: TMLR
DOI: 10.48550/arXiv.2112.12482

eLife

Autorzy: Larissa Höfling; Klaudia P Szatko; Christian Behrens; Yuyao Deng; Yongrong Qiu; David Alexander Klindt; Zachary Jessen; Gregory W Schwartz; Matthias Bethge; Philipp Berens; Katrin Franke; Alexander S Ecker; Thomas Euler
Opublikowane w: eLife, 2024, ISSN 2050-084X
Wydawca: eLife Sciences Publications Ltd
DOI: 10.7554/ELIFE.86860