Opis projektu
Badanie biogenezy polimerazy RNA
W ludzkim genomie znajduje się około 20 000 genów kodujących białka. Są one poddawane transkrypcji na mRNA przez enzym polimerazę RNA II (RNAPII), kompleks wielobiałkowy, który składa się z 12 jednostek podrzędnych. W związku z tym regulacja i składanie RNAPII mają kluczowe znaczenie dla prawidłowej ekspresji genów. Uczeni skupieni wokół projektu RNAPII, finansowanego z działań „Maria Skłodowska-Curie” zbadają ilość enzymu, transport i czas montażu, aby uzyskać całościowy obraz biogenezy RNAPII. Zbadają też, czy jednostki RNAPII w komórkach eukariotycznych składają się ko-translacyjnie. Prace nad biogenezą RNAPII przyczynią się do rozwoju przyszłych badań nad jej potencjalnym wykorzystaniem jako celu działania leków przeciwnowotworowych.
Cel
Cellular diversity in eukaryotic organisms is obtained through differential regulation of transcription, which is therefore a heavily studied step in gene expression. Protein-coding genes are transcribed by RNA polymerase II (RNAPII), an enzyme consisting of twelve subunits. Recently, work from my host lab, the Svejstrup lab, has suggested that depleting the number of fully assembled RNAPII molecules in the cell, through degradation of its main catalytic subunit RPB1, is crucial for achieving transcription recovery after DNA damage. This finding underscores the importance of understanding how RNAPII levels are regulated. Therefore, in this proposal I aim to gain insight into the mechanisms influencing RNAPII abundance, by studying RPB1 mRNA and protein levels, RNAPII assembly, and RNAPII transport in human cells. Specifically, I will leverage my background in RNA biology and bioinformatics analysis to identify RNA-binding proteins interacting with the 3’UTR of RPB1, and study their role in regulating RPB1 mRNA turnover and translation efficiency. Moreover, using state-of-the-art selective ribosomal profiling techniques, I will determine whether RNAPII is assembled co-translationally, as was recently proposed to be the mechanism of assembly for most multi-subunit complexes in eukaryotes. Finally, I will perform a CRISPR-Cas9 screen to identify novel factors that mediate RNAPII nuclear import. Together, this proposal will elucidate the biogenesis of RNAPII, which is crucial for a better understanding of transcription regulation. The proposed experiments will enhance my postdoctoral training by broadening my conceptual and technical skills and will provide data and tools to start my own laboratory in the future. Ultimately, these findings might also have therapeutic implications, as RNAPII is one of the targets being investigated for cancer treatments.
Dziedzina nauki
Klasyfikacja projektów w serwisie CORDIS opiera się na wielojęzycznej taksonomii EuroSciVoc, obejmującej wszystkie dziedziny nauki, w oparciu o półautomatyczny proces bazujący na technikach przetwarzania języka naturalnego.
Klasyfikacja projektów w serwisie CORDIS opiera się na wielojęzycznej taksonomii EuroSciVoc, obejmującej wszystkie dziedziny nauki, w oparciu o półautomatyczny proces bazujący na technikach przetwarzania języka naturalnego.
Program(-y)
- HORIZON.1.2 - Marie Skłodowska-Curie Actions (MSCA) Main Programme
Zaproszenie do składania wniosków
Zobacz inne projekty w ramach tego zaproszeniaSystem finansowania
MSCA-PF - MSCA-PFKoordynator
1165 Kobenhavn
Dania