Opis projektu
Interakcje zwrotne gospodarz–bakterie jelitowe w obliczu stanu zapalnego
Jak się okazuje, mikrobiota jelitowa jest kluczowym czynnikiem regulującym stan zdrowia. Choroba Leśniowskiego-Crohna (ang. Crohn’s disease, CD) podkreśla znaczenie przestrzennej organizacji mikrobioty, gdy ogniska zapalne w jelitach u tego samego gospodarza otoczone są obszarami bez stanu zapalnego. Wcześniejsze badania wskazują na funkcjonalne sprzężenie zwrotne na linii gospodarz–drobnoustrój w adaptacji bakterii do funkcji immunomodulacyjnych, w tym zmian w bakteriach jelitowych pacjentów z CD. Zespół finansowanego ze środków UE projektu ExtractABact proponuje zbadanie plastyczności przestrzenno-funkcjonalnej bakterii i interakcji na linii gospodarz-drobnoustrój w przebiegu CD, co wpływa na stan zapalny. Połączenie mikrobiologii, immunologii i biologii systemów pozwoli na zrozumienie plastyczności funkcjonalnej bakterii podczas stanu zapalnego, mechanizmów sprzężenia zwrotnego i potencjalnej roli w inicjacji zapalenia jelit.
Cel
Over the past two decades, gut bacteria have emerged as major regulators of human health. The focus in the field thus far has been on bacterial taxonomy, with their spatial organization and functionality largely overlooked. Crohns disease (CD) vividly portrays this spatiofunctional dimension, as it features patches of gut inflammation (skip lesions) surrounded by uninflamed regionsin the same hostwith a clear demarcation but unknown cause. Our preliminary data demonstrate host-microbe functional feedback loops in which bacterial strains can adapt and modify their immunomodulatory functions in response to the host. Moreover, we find functional alterations in gut bacteria of IBD patients. Thus, we hypothesize that bacterial spatio-functionality can be largely affected by host physiology, and, in turn, modulate the pathophysiological state, creating a functional feedback loop.
We propose to study bacterial spatiofunctional plasticity and mechanisms of host-microbe interactions in CD, and their potential causal effects on inflammation, combining microbiology, immunology and systems biology approaches. We intend to focus on three independent yet complementary aims: (1) Characterize host-microbe spatio-functional alterations in skip lesions and assess their potential causal effects on inflammation; (2) Decipher the functional and molecular mechanisms of host-microbe feedback loops in healthy and inflamed intestines; and (3) Develop a toolbox for high-resolution functional analyses of gut bacteria directly in their natural environments.
This study will address, for the first time, bacterial functional plasticity in response to host inflammation, unveiling the phenomena, its mechanism of action, and potential causal effects on gut inflammation. Such understanding can shift our perception on microbiota-host interactions, may explain contradictions in the field, point to novel contributing factors to CD and related disorders, and guide future translational studies.
Dziedzina nauki (EuroSciVoc)
Klasyfikacja projektów w serwisie CORDIS opiera się na wielojęzycznej taksonomii EuroSciVoc, obejmującej wszystkie dziedziny nauki, w oparciu o półautomatyczny proces bazujący na technikach przetwarzania języka naturalnego.
Klasyfikacja projektów w serwisie CORDIS opiera się na wielojęzycznej taksonomii EuroSciVoc, obejmującej wszystkie dziedziny nauki, w oparciu o półautomatyczny proces bazujący na technikach przetwarzania języka naturalnego.
- nauki przyrodniczenauki biologicznemikrobiologiabakteriologia
- medycyna i nauki o zdrowiumedycyna klinicznaimmunologia
- medycyna i nauki o zdrowiumedycyna klinicznafizjologia
Aby użyć tej funkcji, musisz się zalogować lub zarejestrować
Słowa kluczowe
Program(-y)
- HORIZON.1.1 - European Research Council (ERC) Main Programme
Temat(-y)
System finansowania
HORIZON-ERC - HORIZON ERC GrantsInstytucja przyjmująca
32000 Haifa
Izrael