Opis projektu
Badanie wpływu centromerów na fenotypy komórek
Wszystkie komórki somatyczne posiadają te same informacje genetyczne - zawierają kompletną kopię genomu umożliwiającą im wytwarzanie dowolnego z milionów zakodowanych białek. Poszczególne komórki produkują tylko część z nich w zależności od funkcji. Czy centromer odgrywa jakąś rolę w tym procesie? Centromer, czyli obszar DNA, który łączy siostrzane chromatydy i przyczepia się do wrzeciona podczas podziału komórki, stanowi element 5 % ludzkiego DNA, którego sekwencje nie zostały dotychczas w pełni opisane. Sekwencje i rozmiary centromerów różnią się w zależności od tkanki, organizmu i stanu chorobowego. Zespół finansowanego ze środków Europejskiej Rady ds. Badań Naukowych projektu CentroFun zbada zmienność genetyczną ludzkich centromerów oraz to, w jaki sposób różnice w sekwencji, strukturze i funkcji mogą wpływać na fenotypy komórkowe.
Cel
The last decades have seen an extraordinary leap in our knowledge of the human genome and its role in health and disease. Yet, approximately 5% of our DNA still lacks sequence annotation and has been largely excluded from functional and disease-association studies. These genomic gaps include DNA repeats such as centromeres, which are large tandem arrays of alpha-satellite DNA. Centromeres chromatin is functionally essential for chromosome segregation serving as the basal template for the mitotic kinetochore. A recent breakthrough has been the complete genome assembly, including centromeres, of a haploid cell line derived from fetoplacental growth of a molar pregnancy. However, centromeres sequence and size vary across tissues, between individuals and in disease states. The main challenges are to understand how is centromere variation generated and especially, the consequences at a functional level. The specific objectives of my project are: (1) Identify the mutagenic processes and DNA repair responses operating at centromeres; (2) Determine the impact of centromeres sequence variation on chromatin structure, kinetochore function and chromosome behavior; and (3) Understand how these changes contribute to genome instability, cellular phenotypes and disease predisposition. The originality of this project is to follow a multidisciplinary approach that combines experimental studies spanning structural biochemistry to cell biology and bioinformatic analyses, that will benefit from the information on centromere reference already available and soon to be generated. The proposed research therefore represents a very appropriate and timely contribution to provide an integrated view of human centromere variation and its role in determining phenotypic traits. Furthermore, it will provide important insight on the functional role of the missing genome in human diseases and promises to yield key information and tools for expanding this novel field.
Dziedzina nauki (EuroSciVoc)
Klasyfikacja projektów w serwisie CORDIS opiera się na wielojęzycznej taksonomii EuroSciVoc, obejmującej wszystkie dziedziny nauki, w oparciu o półautomatyczny proces bazujący na technikach przetwarzania języka naturalnego.
Klasyfikacja projektów w serwisie CORDIS opiera się na wielojęzycznej taksonomii EuroSciVoc, obejmującej wszystkie dziedziny nauki, w oparciu o półautomatyczny proces bazujący na technikach przetwarzania języka naturalnego.
- nauki przyrodniczenauki biologicznebiochemia
- nauki przyrodniczenauki biologicznegenetykaDNA
- medycyna i nauki o zdrowiumedycyna klinicznapołożnictwo
- nauki przyrodniczenauki biologicznegenetykachromosomy
- nauki przyrodniczenauki biologicznegenetykagenom
Aby użyć tej funkcji, musisz się zalogować lub zarejestrować
Program(-y)
- HORIZON.1.1 - European Research Council (ERC) Main Programme
Temat(-y)
System finansowania
HORIZON-ERC - HORIZON ERC GrantsInstytucja przyjmująca
00185 Roma
Włochy