The malaria chemical atlas: Revealing the parasite-host functional interactome

Opis projektu

Odkrywanie funkcjonalnych związków chemicznych w przebiegu malarii

Malaria jest śmiertelną chorobą pasożytniczą, która powoduje zakłócenie komunikacji komórkowej w wyniku przedostania się do krwiobiegu zarodźca sierpowatego (Plasmodium falciparum). Pierwotniak ten wykorzystuje pęcherzyki zewnątrzkomórkowe do komunikacji, wydzielając induktory chemiczne, takie jak metabolity i peptydy. Komunikacja służy do koordynowania najważniejszych decyzji dotyczących przetrwania pasożyta i kontroli nad sąsiednimi komórkami żywiciela. Konsorcjum finansowanego przez Europejską Radę ds. Badań Naukowych projektu MalChemAtlas zamierza połączyć możliwości technologii chemicznych, biofizycznych i omicznych z uczeniem maszynowym, aby odkryć i szczegółowo opisać funkcjonalne substancje chemiczne, które odgrywają kluczową rolę w zagęszczeniu, wzroście i rozwoju płciowym pasożytów. Te substancje chemiczne regulują wzajemne oddziaływania między pasożytem a krążącymi we krwi komórkami układu odpornościowego gospodarza oraz jego krwinkami czerwonymi. Co więcej, ich wpływ rozciąga się także na kaskady sygnalizacyjne w obrębie nieswoistego i adaptacyjnego układu odpornościowego gospodarza.

Cel

Malaria is the most life-threatening parasitic disease in humans. Invasion of the malaria parasite, Plasmodium falciparum (Pf), into the blood circulation rewires the harmonious networking between the resident cells.

Until recently, Pf was not thought to be able to communicate when nested within infected human red blood cells (RBCs). However, we and others have laid the foundations of Pf communication via extracellular vesicles.

We now hypothesize that in order to survive in the hostile host environment, Pf secretes chemical inducers (e.g. metabolites, peptides) to actively coordinate life decisions as a group and to control the surrounding host cells. Remarkably, we obtained proof-of-principle preliminary results in the form of an isolated, active chemical fraction that inhibits Pf population growth in a density-dependent manner.

Our overarching goal in MalChemAtlas is to expose this yet-to-be-revealed mode of communication in malaria: cell-to-cell chemical signaling. We will combine analytic chemical, biophysical and omics technologies with machine-learning approaches to comprehensively reveal and characterize the functional chemicals that: I) facilitate parasite density, growth and sexual development (parasite-parasite signaling), II) dictate parasite crosstalk with circulating host immune cells and naïve RBCs (parasite-host communication), and III) affect downstream signaling cascades between the host’s innate and adaptive immunity (host-host communication).

In this effort, we will leverage our extensive (HPLC-based) analytical fractionation pipeline, combined with NMR and metabolomics analyses, for identifying malaria-secreted autoinducers.

Our preliminary findings demonstrate the potential of our basic research to be applied to the translational level of intervention.
Identifying “natural chemical killers” offers a previously unexplored direct strategy to fight malaria - the highest gain we can ask for when researching this deadly disease.