GENOMIC SURVEILLANCE TO CONTROL PATHOGEN INFECTIONS IN AFRICA

Informacje na temat projektu

GenPath Africa

Identyfikator umowy o grant: 101103171

DOI

10.3030/101103171

Data podpisania przez KE 28 Sierpnia 2023

Data rozpoczęcia 1 Maja 2023

Data zakończenia 30 Kwietnia 2027

Finansowanie w ramach

• Health

Koszt całkowity

€ 4 999 170,25

Wkład UE

€ 4 999 170,25

Koordynowany przez

STELLENBOSCH UNIVERSITY
South Africa

CORDIS oferuje możliwość skorzystania z odnośników do publicznie dostępnych publikacji i rezultatów projektów realizowanych w ramach programów ramowych HORYZONT.

Odnośniki do rezultatów i publikacji związanych z poszczególnymi projektami 7PR, a także odnośniki do niektórych konkretnych kategorii wyników, takich jak zbiory danych i oprogramowanie, są dynamicznie pobierane z systemu OpenAIRE .

Publikacje

Peer reviewed articles (10)

Detection of Mycobacterium bovis in nasal swabs from communal goats (Capra hircus) in rural KwaZulu-Natal, South Africa

Autorzy: Deborah M. Cooke; Charlene Clarke; Tanya J. Kerr; Robin M. Warren; Carmel Witte, Michele A. Miller; Wynand J. Goosen
Opublikowane w: Frontiers in Microbiology, Numer 15:1349163, 2024, ISSN 1664-302X
Wydawca: Frontiers Media S.A.
DOI: 10.3389/fmicb.2024.1349163

The third era of genomics is at risk of being dismantled across the global south

Autorzy: Tulio de Oliveira
Opublikowane w: Science, Numer 386:6718, 2024, ISSN 0036-8075
Wydawca: American Association for the Advancement of Science
DOI: 10.1126/science.adt484

Genomic Characterization of Circulating Dengue Virus, Ethiopia, 2022–2023

Autorzy: Adugna Abera, Houriiyah Tegally, Geremew Tasew, Eduan Wilkinson, Abraham Ali, Feyisa Regasa, Molalegne Bitew, Mahlet Belachew, Lucious Chabuka, Gaspary Mwanyika, Derek Tshiabuila, Jennifer Giandhari, Sureshnee Pillay, Jenicca Poogavanan, Monika Moir, Moritz U.G. Kraemer, Kamran Khan, Carmen Huber, Getachew Tollera, Tobias F. Rinke de Wit, Cheryl Baxter, Richard Lessells, Dawit Wolday, Dereje Beyene, Tulio de Oliveira, null null
Opublikowane w: Emerging Infectious Diseases, Numer 31, 2025, ISSN 1080-6040
Wydawca: Centers for Disease Control and Prevention (CDC)
DOI: 10.3201/EID3103.240996

An Oxford Nanopore Technology-Based Hepatitis B Virus Sequencing Protocol Suitable for Genomic Surveillance Within Clinical Diagnostic Settings

Autorzy: Derek Tshiabuila, Wonderful Choga, James E. San, Tongai Maponga, Gert Van Zyl, Jennifer Giandhari, Sureshnee Pillay, Wolfgang Preiser, Yeshnee Naidoo, Cheryl Baxter, Darren P. Martin, Tulio de Oliveira
Opublikowane w: International Journal of Molecular Sciences, Numer 25, 2024, ISSN 1422-0067
Wydawca: MDPI AG
DOI: 10.3390/ijms252111702

Evidence of Mycobacterium bovis DNA in shared water sources at livestock–wildlife–human interfaces in KwaZulu-Natal, South Africa

Autorzy: Megan C. Matthews, Deborah M. Cooke, Tanya J. Kerr, Andre G. Loxton, Robin M. Warren, Giovanni Ghielmetti, Elizabeth M. Streicher, Carmel S. Witte, Michele A. Miller, Wynand J. Goosen
Opublikowane w: Frontiers in Veterinary Science, Numer 12, 2025, ISSN 2297-1769
Wydawca: Frontiers Media SA
DOI: 10.3389/FVETS.2025.1483162

A decade of dengue disease burden in Africa (2013–2023): a systematic review

Autorzy: Gaspary O. Mwanyika, Monika Moir, Abdualmoniem O. Musa, Jenicca Poongavanan, Graeme Dor, Eduan Wilkinson, Cheryl Baxter, Tulio de Oliveira, Houriiyah Tegally
Opublikowane w: Travel Medicine and Infectious Disease, Numer 67, 2025, ISSN 1477-8939
Wydawca: Elsevier BV
DOI: 10.1016/J.TMAID.2025.102897

Insights into mycobacteriome composition in Mycobacterium bovis-infected African buffalo (Syncerus caffer) tissue samples

Autorzy: Giovanni Ghielmetti; Tanya J. Kerr; Netanya Bernit; Sinegugu K. Mhlophe; Elizma Streicher; Andre G. Loxton; Robin M. Warren; Michele A. Miller; Wynand J. Goosen
Opublikowane w: Scientific Reports, Numer 14:17537, 2024, ISSN 2045-2322
Wydawca: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41598-024-68189-x

Genomic Epidemiology of Rift Valley Fever Virus Involved in the 2018 and 2022 Outbreaks in Livestock in Rwanda

Autorzy: Isidore Nsengimana; John Juma; Kristina Roesel; Methode N. Gasana; Fabrice Ndayisenga; Claude M. Muvunyi; Emmanuel Hakizimana; Jean N. Hakizimana; Gillian Eastwood; Augustino A. Chengula; Bernard Bett; Christopher J. Kasanga; Samuel O. Oyola
Opublikowane w: Viruses, Numer 16(7):1148, 2024, ISSN 1999-4915
Wydawca: Multidisciplinary Digital Publishing Institute (MDPI)
DOI: 10.3390/v16071148

Identification and molecular characterization of Mycobacterium bovis DNA in GeneXpert® MTB/RIF ultra-positive, culture-negative sputum from a rural community in South Africa

Autorzy: Wynand J. Goosen; Sashen Moodley; Giovanni Ghielmetti; Yumna Moosa; Thando Zulu; Theresa Smit; Vukuzazi Team; Leanie Kleynhans; Tanya J. Kerr; Elizabeth M. Streicher; Willem A. Hanekom; Robin M. Warren; Emily B. Wong; Michele A. Miller
Opublikowane w: One Health, Numer 18:100702, 2024, ISSN 2352-7714
Wydawca: Elsevier
DOI: 10.1016/j.onehlt.2024.100702

Targeted deep sequencing of mycobacteria species from extrapulmonary sites not identified by routine line probe assays: a retrospective laboratory analysis of stored clinical cultures

Autorzy: Christoffel Opperman, Janré Steyn, Megan Ceris Matthews, Sarishna Singh, Yonas Ghebrekristos, Tanya Jane Kerr, Michele Miller, Aliasgar Esmail, Helen Cox, Robin Warren, Giovanni Ghielmetti, Wynand Goosen
Opublikowane w: IJID Regions, 2024, ISSN 2772-7076
Wydawca: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.ijregi.2024.100464