Opis projektu
Haplotypy genomu i partenogeneza
Wszystkie gatunki glisty z rodzaju Plectus rozmnażają się jedynie bezpłciowo. Nie wiadomo jednak, w jaki sposób utraciły one zdolność do rozmnażania płciowego. Hybrydyzacja między gatunkami, w ramach której allele z gatunków rozmnażających się płciowo łączą się z blisko spokrewnionymi gatunkami, jest jedną z możliwości, która być może stanowiła sposób przystosowania do ekstremalnych środowisk. Zespół finansowanego ze środków działania „Maria Skłodowska-Curie” projektu CHOPPE zamierza zbadać to zagadnienie. W ramach projektu badacze opracują genomy na poziomie chromosomów dla kilku przedstawicieli gatunku Plectus i jego najbliższego krewnego Anaplectus z różnych siedlisk. Nowe metody obliczeniowe umożliwią wygenerowanie zespołów haplotypów (genów dziedziczonych od jednego rodzica). Złożone i haplotypowe zespoły pozwolą na odkrycie podstaw adaptacji do ekstremalnych środowisk poprzez partenogenezę.
Cel
Sexual reproduction is a costly but seemingly necessary trait in animals. However, species in diverse branches of the animal kingdom have secondarily reverted to asexual reproduction. In the roundworms (phylum Nematoda), this reversal appears particularly frequent, as parthenogenetic species have emerged in numerous genera. Species in the genus Plectus are obligately parthenogenetic, and are distributed in non-extreme and extreme environments across the globe. Mechanisms leading to the loss of sex, for example hybridisation, have received some attention, but are still poorly understood, in particular on the genomic level. This is in part due to the lack of sequencing and analysis tools for complex genomes of minute organisms.
CHOPPE will generate chromosome-level collapsed and phased genome assemblies using latest assembly strategies for several species of Plectus and its closest sexual relative Anaplectus from diverse habitats. CHOPPE will develop new computational methods for generating fully phased assemblies of diverse non-model species. Collapsed assemblies, and haplotype assemblies of several Plectus and Anaplectus species generated in the project, will allow to decipher the genomic basis of their adaption in the context of parthenogenesis and extreme environments. The project will further investigate the reversal to sexuality of Plectus through crossing with heat induced males, and establish this genus as a new model for the study of parthenogenesis.
Dziedzina nauki (EuroSciVoc)
Klasyfikacja projektów w serwisie CORDIS opiera się na wielojęzycznej taksonomii EuroSciVoc, obejmującej wszystkie dziedziny nauki, w oparciu o półautomatyczny proces bazujący na technikach przetwarzania języka naturalnego. Więcej informacji: https://op.europa.eu/en/web/eu-vocabularies/euroscivoc
Klasyfikacja projektów w serwisie CORDIS opiera się na wielojęzycznej taksonomii EuroSciVoc, obejmującej wszystkie dziedziny nauki, w oparciu o półautomatyczny proces bazujący na technikach przetwarzania języka naturalnego. Więcej informacji: https://op.europa.eu/en/web/eu-vocabularies/euroscivoc
Aby użyć tej funkcji, musisz się zalogować lub zarejestrować
Słowa kluczowe
Program(-y)
- HORIZON.1.2 - Marie Skłodowska-Curie Actions (MSCA) Main Programme
Zaproszenie do składania wniosków
(odnośnik otworzy się w nowym oknie) HORIZON-MSCA-2022-PF-01
Zobacz inne projekty w ramach tego zaproszeniaSystem finansowania
HORIZON-TMA-MSCA-PF-EF - HORIZON TMA MSCA Postdoctoral Fellowships - European FellowshipsKoordynator
50931 Koln
Niemcy