Opis projektu
Zrozumienie ewolucji kondensatów biomolekularnych
Komórki organizują miliardy białek w dwa kompartmenty: struktury związane z błoną i bezbłonowe, przy czym te drugie nazywane są kondensatami biomolekularnymi. Pomimo licznych postępów naukowych wciąż nie mamy pełnej wiedzy na temat mechanizmu, za pomocą którego białka są kierowane do tych kondensatów, ani o ich ewolucyjnym pochodzeniu. Zespół finansowanego przez Europejską Radę ds. Badań Naukowych projektu CONDEVO zamierza zweryfikować koncepcję, według której lokalizacja białek w kondensatach jest zakodowana w ich sekwencjach, a kondensaty te są podtrzymywane w drodze selekcji ewolucyjnej. W ramach projektu uczeni zmapują proteomy kondensatów na całym drzewie życia, odtworzą historię ich ewolucji i zidentyfikują zachowane w procesie ewolucji cechy sekwencji, które są odpowiedzialne za lokalizację. Ponadto opracują narzędzia do przewidywania określonych proteomów kondensatów, przeprowadzą doświadczenia dotyczące podziałów białek, sklasyfikują rodziny kondensatów i porównają ich ewolucję z ewolucją organizmów i organelli.
Cel
Cells organize billions of protein molecules into membrane-bound and membrane-less compartments, called biomolecular condensates. Previous research on condensates focused on identifying their components, material properties, and function in homeostasis and disease. In contrast to our relatively precise understanding of membrane-bound compartments, we lack a comprehensive picture of the mechanisms that target proteins into condensates and how condensates emerged during evolution. I hypothesize that localization into condensate is encoded in protein sequences, and that functional condensates are under selection pressure and therefore conserved. I propose a comprehensive research program including both theoretical and experimental approaches to reveal how and when protein condensates emerged during evolution.
I propose to:
1. Map proteomes of condensates across the tree of life,
2. Reconstruct the history of condensates,
3. Follow trajectories of condensate evolution.
Specifically, I will:
1. Investigate what conserved sequence features drive localization to condensates by developing computational tools to predict the proteome of specific condensates across the tree of life; and by testing partitioning of proteins into condensates experimentally.
2. Reconstruct the evolutionary history of the protein components of conserved condensates, and thereby trace their evolutionary origin. Analogous to protein families, we will define condensate families based on shared properties of their proteins and function by developing similarity metrics. We will reconstruct the phylogeny of condensate families and compare to organism and organelle evolution.
3. Perform directed evolution of ancestral non-condensate-forming proteins towards condensate partitioning and follow their mutational trajectories.
Building on our already developed tools and the new algorithms proposed here combined with experiments, we will be able to map the molecular history of condensates on the Tree of Life.
Dziedzina nauki (EuroSciVoc)
Klasyfikacja projektów w serwisie CORDIS opiera się na wielojęzycznej taksonomii EuroSciVoc, obejmującej wszystkie dziedziny nauki, w oparciu o półautomatyczny proces bazujący na technikach przetwarzania języka naturalnego. Więcej informacji: Europejski Słownik Naukowy.
Klasyfikacja tego projektu została potwierdzona przez zespół projektowy.
Klasyfikacja projektów w serwisie CORDIS opiera się na wielojęzycznej taksonomii EuroSciVoc, obejmującej wszystkie dziedziny nauki, w oparciu o półautomatyczny proces bazujący na technikach przetwarzania języka naturalnego. Więcej informacji: Europejski Słownik Naukowy.
Klasyfikacja tego projektu została potwierdzona przez zespół projektowy.
- nauki przyrodnicze nauki biologiczne biochemia biocząsteczki białka proteomika
- nauki przyrodnicze nauki biologiczne biologia ewolucyjna
- nauki przyrodnicze informatyka oprogramowanie tworzenie oprogramowania
- nauki przyrodnicze informatyka sztuczna inteligencja uczenie maszynowe
- medycyna i nauki o zdrowiu medycyna kliniczna fizjologia homeostaza
Słowa kluczowe
Słowa kluczowe dotyczące projektu wybrane przez koordynatora projektu. Nie należy mylić ich z pojęciami z taksonomii EuroSciVoc dotyczącymi dziedzin nauki.
Słowa kluczowe dotyczące projektu wybrane przez koordynatora projektu. Nie należy mylić ich z pojęciami z taksonomii EuroSciVoc dotyczącymi dziedzin nauki.
Program(-y)
Wieloletnie programy finansowania, które określają priorytety Unii Europejskiej w obszarach badań naukowych i innowacji.
Wieloletnie programy finansowania, które określają priorytety Unii Europejskiej w obszarach badań naukowych i innowacji.
-
HORIZON.1.1 - European Research Council (ERC)
GŁÓWNY PROGRAM
Wyświetl wszystkie projekty finansowane w ramach tego programu
Temat(-y)
Zaproszenia do składania wniosków dzielą się na tematy. Każdy temat określa wybrany obszar lub wybrane zagadnienie, których powinny dotyczyć wnioski składane przez wnioskodawców. Opis tematu obejmuje jego szczegółowy zakres i oczekiwane oddziaływanie finansowanego projektu.
Zaproszenia do składania wniosków dzielą się na tematy. Każdy temat określa wybrany obszar lub wybrane zagadnienie, których powinny dotyczyć wnioski składane przez wnioskodawców. Opis tematu obejmuje jego szczegółowy zakres i oczekiwane oddziaływanie finansowanego projektu.
System finansowania
Program finansowania (lub „rodzaj działania”) realizowany w ramach programu o wspólnych cechach. Określa zakres finansowania, stawkę zwrotu kosztów, szczegółowe kryteria oceny kwalifikowalności kosztów w celu ich finansowania oraz stosowanie uproszczonych form rozliczania kosztów, takich jak rozliczanie ryczałtowe.
Program finansowania (lub „rodzaj działania”) realizowany w ramach programu o wspólnych cechach. Określa zakres finansowania, stawkę zwrotu kosztów, szczegółowe kryteria oceny kwalifikowalności kosztów w celu ich finansowania oraz stosowanie uproszczonych form rozliczania kosztów, takich jak rozliczanie ryczałtowe.
HORIZON-ERC - HORIZON ERC Grants
Wyświetl wszystkie projekty finansowane w ramach tego programu finansowania
Zaproszenie do składania wniosków
Procedura zapraszania wnioskodawców do składania wniosków projektowych w celu uzyskania finansowania ze środków Unii Europejskiej.
Procedura zapraszania wnioskodawców do składania wniosków projektowych w celu uzyskania finansowania ze środków Unii Europejskiej.
(odnośnik otworzy się w nowym oknie) ERC-2023-STG
Wyświetl wszystkie projekty finansowane w ramach tego zaproszeniaInstytucja przyjmująca
Kwota netto dofinansowania ze środków Unii Europejskiej. Suma środków otrzymanych przez uczestnika, pomniejszona o kwotę unijnego dofinansowania przekazanego powiązanym podmiotom zewnętrznym. Uwzględnia podział unijnego dofinansowania pomiędzy bezpośrednich beneficjentów projektu i pozostałych uczestników, w tym podmioty zewnętrzne.
80539 MUNCHEN
Niemcy
Ogół kosztów poniesionych przez organizację w związku z uczestnictwem w projekcie. Obejmuje koszty bezpośrednie i pośrednie. Kwota stanowi część całkowitego budżetu projektu.