Unraveling the dark matter of infectious diseases, environmental and genetic factors tipping the balance towards NCDs

Informacje na temat projektu

ID-DarkMatter-NCD

Identyfikator umowy o grant: 101136582

DOI

10.3030/101136582

Data podpisania przez KE 11 Grudnia 2023

Data rozpoczęcia 1 Stycznia 2024

Data zakończenia 31 Grudnia 2028

Finansowanie w ramach

• Health

Koszt całkowity

€ 7 185 870,01

Wkład UE

€ 7 185 361,00

Koordynowany przez

MEDIZINISCHE UNIVERSITAET WIEN
Austria

CORDIS oferuje możliwość skorzystania z odnośników do publicznie dostępnych publikacji i rezultatów projektów realizowanych w ramach programów ramowych HORYZONT.

Odnośniki do rezultatów i publikacji związanych z poszczególnymi projektami 7PR, a także odnośniki do niektórych konkretnych kategorii wyników, takich jak zbiory danych i oprogramowanie, są dynamicznie pobierane z systemu OpenAIRE .

Rezultaty

Documents, reports (3)

Ethics framework

Ethics and Governance framework (HRequirement No. 1 [9], POPD- Requirement no 3 [6])

Genetic data

Report on data curation & exchange

D,E,C plan

Plan for dissemination, exploit, comm

Data Management Plan (1)

DMP

Data management plan

Websites, patent fillings, videos etc. (1)

Public website

Public website of ID-DarkMatter-NCD

Publikacje

Peer reviewed articles (25)

Antigen-specific activation of gut immune cells drives autoimmune neuroinflammation

Autorzy: Lena K. Siewert, Kristina Berve, Elisabeth Pössnecker, Julia Dyckow, Amel Zulji, Ryan Baumann, Aida Munoz-Blazquez, Gurumoorthy Krishnamoorthy, David Schreiner, Sharon Sagan, Charlotte Nelson, Joseph J. Sabatino, Kazuki Nagashima, Médéric Diard, Andrew J. Macpherson, Stephanie C. Ganal-Vonarburg, Michael A. Fischbach, Scott S. Zamvil, Lucas Schirmer, Sergio E. Baranzini, Anne-Katrin Pröbstel
Opublikowane w: Gut Microbes, Numer 18, 2026, ISSN 1949-0976
Wydawca: Informa UK Limited
DOI: 10.1080/19490976.2025.2601430

A journey to your self: The vague definition of immune self and its practical implications

Autorzy: Koncz, Balázs; Balogh, Gergő Mihály; Manczinger, Máté
Opublikowane w: Proceedings of the National Academy of Sciences, 2024, ISSN 1091-6490
Wydawca: National Academy of Sciences.
DOI: 10.1073/PNAS.2309674121

Molecular Systems Biology

Autorzy: Szilvia Juhász; Benjamin Tamás Papp; Anna Tácia Fülöp; Zoltán Farkas; Dávid Kókai; Dóra Alexandra Gyémánt; Franciska Tóth; Zsófia Nacsa; Dóra Spekhardt; Balázs Koncz; Péter Burkovics; Csaba Pál; Máté Manczinger
Opublikowane w: Molecular Systems Biology, 2026, ISSN 1744-4292
Wydawca: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/S44320-026-00193-X

Systemic antibody responses against bacterial and viral antigens associate with fatigue in patients with inflammatory bowel disease

Autorzy: Maximilian G Griesbaum, Thomas Vogl, Marijn C Visschedijk, Eleonora A M Festen, Gerard Dijkstra, Adina Weinberger, Eran Segal, Rinse K Weersma, Arno R Bourgonje
Opublikowane w: iScience, 2026, ISSN 2589-0042
Wydawca: Cell Press, an imprint of Elsevier
DOI: 10.1016/j.isci.2026.116828

Associations between HLA-II variation and antibody specificity are predicted by antigen properties

Autorzy: Innocenti G.; Andreu-Sánchez S.; Hörstke N.V.; Elabd H.; Barozzi I.; Franke A.; Manczinger M.; Vogl T.
Opublikowane w: Genome Medicine, 2025, ISSN 1756-994X
Wydawca: BioMed Central
DOI: 10.1186/S13073-025-01486-W

Mapping adaptive immune responses toward fungal antigens in inflammatory bowel disease using T cell repertoire sequencing and phage-immunoprecipitation sequencing

Autorzy: Mahdy AKH, ElAbd H, Prinzensteiner M, Jebens H, Sivickis K, Bacher P, Vogl T, Franke A, et al
Opublikowane w: Journal of Crohn's and Colitis, 2026, ISSN 1876-4479
Wydawca: Oxford Academic
DOI: 10.1093/ECCO-JCC/JJAG015

Free Radical Biology and Medicine

Autorzy: Sem Geertsema; Hannah J. Holstein; Marian L.C. Bulthuis; Sofie de Jong; Marjan Reinders-Luinge; Karin Koerts-Steijn; Anneke C. Muller Kobold; Klaas Nico Faber; Harry van Goor; Gerard Dijkstra; Arno R. Bourgonje
Opublikowane w: Free Radical Biology and Medicine, 2026, ISSN 0891-5849
Wydawca: Elsevier BV
DOI: 10.1016/J.FREERADBIOMED.2025.11.057

Anti-CD20 B cell depletion is associated with elevated mucosal-originating circulating regulatory IgA B cells in multiple sclerosis

Autorzy: Tradite Neziraj, Elisabeth Pössnecker, Angela A. Wang, Paul Saary, Adrian-Minh Schumacher, Florian Ingelfinger, Amandine Mathias, Edoardo Galli, Marco Häfelfinger, Michelle Zuo, Samuel Jones, Vasiliki Pantazou, Joep Killestein, Sabine Schädelin, Pascal Benkert, Cristina Granziera, Caroline Pot, Antje Bischof, Jan Hendrik Niess, Magdalena Filipowicz Sinnreich, Tobias Derfuss, Charlotte E. Teunissen, Jens Kuhle, David A. Hafler, Renaud Du Pasquier, Yoshiaki Yasumizu, Jennifer L. Gommerman, Anne-Katrin Pröbstel
Opublikowane w: Science Translational Medicine, Numer 18, 2026, ISSN 1946-6234
Wydawca: American Association for the Advancement of Science (AAAS)
DOI: 10.1126/SCITRANSLMED.AEE1580

Deciphering the prodrome of inflammatory bowel disease up to 10 years before disease onset by massively parallel serology

Autorzy: Arno R Bourgonje, Gabriel Innocenti, Alexandra E Livanos, Melanie Prinzensteiner, Jared S Magee, Mark S Riddle, Renee M Laird, Thierry Dervieux, Chad K Porter, Sacha Gnjatic, Francesca Petralia, Joana Torres, Mayte Suárez-Fariñas, Thomas Vogl, Jean-Frederic Colombel, Saurabh Mehandru
Opublikowane w: Gut, 2026, ISSN 0017-5749
Wydawca: BMJ
DOI: 10.1136/GUTJNL-2025-337762

Nature Communications

Autorzy: Manczinger, Innocenti, Vogl, Zhernakova, Weersma, Et Al.
Opublikowane w: Nature Communications 2026, 2026, ISSN 2041-1723
Wydawca: Springer Nature
DOI: 10.1038/s41467-019-14177-z

Molecular mimicry in the pathogenesis of autoimmune rheumatic diseases

Autorzy: Michaela Fehringer; Thomas Vogl
Opublikowane w: Journal of Translational Autoimmunity, 2025, ISSN 2589-9090
Wydawca: Elsevier
DOI: 10.1016/J.JTAUTO.2025.100269

Patient-Derived Monoclonal Myelin Oligodendrocyte Glycoprotein Autoantibodies Mediate Cytotoxicity

Autorzy: Nora Sandrine Wetzel, Laila Kulsvehagen, Anne-Catherine Lecourt, Beata Filipek, Patrick Lipps, Laura Rieder, Kristina Berve, Gurumoorthy Krishnamoorthy, Bert A. 't Hart, Lucas Schirmer, Soumya S. Yandamuri, Kevin C. O'Connor, Anne-Katrin Pröbstel
Opublikowane w: Neurology Neuroimmunology & Neuroinflammation, Numer 13, 2025, ISSN 2332-7812
Wydawca: Ovid Technologies (Wolters Kluwer Health)
DOI: 10.1212/NXI.0000000000200520

Myelin antigen capture in the CNS by B cells expressing EBV latent membrane protein 1 leads to demyelinating lesion formation

Autorzy: Kim, Schneider, Raach, Karypidis, Roux, Perdikaris, Holdermann, Pröbstel, et al.
Opublikowane w: Cell, ISSN 1097-4172
Wydawca: Cell Press, an imprint of Elsevier
DOI: 10.1016/j.cell.2025.12.031

Nature Communications

Autorzy: Rakoff-Nahoum, Seth; Debelius, Justine; Valles-Colomer, Mireia; Noordzij, Hanna Theodora; Esteban-Torres, Maria; Zhernakova, Alexandra; Brusselaers, Nele; Pettersen, Veronika Kuchařová
Opublikowane w: Nature Communications, 2025, ISSN 2041-1723
Wydawca: Nature Publishing Group (Springer Nature)
DOI: 10.1038/S41467-025-61998-2

A reconceptualized framework for human microbiome transmission in early life

Autorzy: Seth Rakoff-Nahoum, Justine Debelius, Mireia Valles-Colomer, Hanna Theodora Noordzij, Maria Esteban-Torres, Alexandra Zhernakova, Nele Brusselaers, Veronika Kuchařová Pettersen
Opublikowane w: Nature Communications, Numer 16, 2025, ISSN 2041-1723
Wydawca: Springer Science and Business Media LLC
DOI: 10.1038/S41467-025-61998-2

Elevated serum glutathione reflects endoscopic disease activity in inflammatory bowel disease

Autorzy: Sem Geertsema, Hannah J. Holstein, Marian L.C. Bulthuis, Sofie de Jong, Marjan Reinders-Luinge, Karin Koerts-Steijn, Anneke C. Muller Kobold, Klaas Nico Faber, Harry van Goor, Gerard Dijkstra, Arno R. Bourgonje
Opublikowane w: Free Radical Biology and Medicine, Numer 243, 2026, ISSN 0891-5849
Wydawca: Elsevier BV
DOI: 10.1016/J.FREERADBIOMED.2025.11.057

Modulator of VRAC Current 1 Is a Potential Target Antigen in Multiple Sclerosis

Autorzy: Johannes Raffael Dahl; Alicia Weier; Christopher Winter; Maik Hintze; Veit Rothhammer; Thanos Tsaktanis; Anne-Katrin Proebstel; Tradite Neziraj; Elisabeth Poessnecker; Johanna Oechtering; Jens Kuhle; Boris-Alexander Kallmann; Gabriele Luber; Thorsten Heider; Luisa Klotz; Rittika Chunder; Stefanie Kuerten
Opublikowane w: Neurology: Neuroimmunology & Neuroinflammation, 2025, ISSN 2332-7812
Wydawca: Ovid Technologies (Wolters Kluwer Health) — published on behalf of the American Academy of Neurology
DOI: 10.1212/NXI.0000000000200374

Genome Medicine

Autorzy: Innocenti, Gabriel; Andreu-Sánchez, Sergio; Hörstke, Nicolai V.; Elabd, Hesham; Barozzi, Iros; Franke, Andre; Manczinger, Máté; Vogl, Thomas
Opublikowane w: Genome Medicine, 2025, ISSN 1756-994X
Wydawca: BMC
DOI: 10.1186/S13073-025-01486-W

Digestive Diseases and Sciences

Autorzy: Bourgonje, Arno R.; Posner, Hannah; Carbonnel, Franck; Colombel, Jean-Frédéric; Kayal, Maia
Opublikowane w: Digestive Diseases and Sciences, 2025, ISSN 0163-2116
Wydawca: Springer Science and Business Media LLC (Springer)
DOI: 10.1007/S10620-024-08809-8

Immune signatures link myelin oligodendrocyte glycoprotein antibody–associated disease to other autoantibody-mediated conditions

Autorzy: Jonas Schmid, Chiara Alberti, Laura Power, Nicolás G. Nuñez, Donatella De Feo, Sofia Tyystjärvi, Laila Kulsvehagen, Victor Kreiner, Ana Beatriz Ayroza Bleher, Patrick Lipps, Stijn Swinnen, Florian Ingelfinger, Can Ulutekin, Camille Chaubet, Susanne Unger, Stefanie Kreutmair, Romain Marignier, Thomas Korn, Anne-Katrin Pröbstel, Roland Liblau, Burkhard Becher
Opublikowane w: Science Translational Medicine, Numer 17, 2025, ISSN 1946-6234
Wydawca: American Association for the Advancement of Science (AAAS)
DOI: 10.1126/SCITRANSLMED.ADW0358

Untargeted faecal metabolomics for the discovery of biomarkers and treatment targets for inflammatory bowel diseases

Autorzy: Arnau Vich Vila, Jingwan Zhang, Moting Liu, Klaas Nico Faber, Rinse K Weersma
Opublikowane w: Gut, Numer 73, 2024, ISSN 0017-5749
Wydawca: BMJ
DOI: 10.1136/GUTJNL-2023-329969

Systemic antibody responses against gut microbiota flagellins implicate shared and divergent immune reactivity in Crohn’s disease and chronic fatigue syndrome

Autorzy: Bourgonje, Arno R.; Hörstke, Nicolai V.; Fehringer, Michaela; Innocenti, Gabriel; Vogl, Thomas
Opublikowane w: Microbiome, 2024, ISSN 2049-2618
Wydawca: BioMed Central
DOI: 10.1186/S40168-024-01858-1

Gut

Autorzy: Arnau Vich Vila; Jingwan Zhang; Moting Liu; Klaas Nico Faber; Rinse K Weersma
Opublikowane w: Gut, 2024, ISSN 0017-5749
Wydawca: BMJ
DOI: 10.1136/GUTJNL-2023-329969

Das Mikrobiom bei rheumatoider Arthritis und systemischem Lupus erythematodes

Autorzy: Michaela Fehringer; Thomas Vogl
Opublikowane w: rheuma plus, 2025, ISSN 1868-260X
Wydawca: Springer Verlag
DOI: 10.1007/S12688-025-00857-W

Five dominant amino acid substitution signatures shape tumour immunity

Autorzy: Szilvia Juhász, Benjamin Tamás Papp, Anna Tácia Fülöp, Zoltán Farkas, Dávid Kókai, Dóra Alexandra Gyémánt, Franciska Tóth, Zsófia Nacsa, Dóra Spekhardt, Balázs Koncz, Péter Burkovics, Csaba Pál, Máté Manczinger
Opublikowane w: Molecular Systems Biology, Numer 22, 2026, ISSN 1744-4292
Wydawca: Springer Science and Business Media LLC
DOI: 10.1038/S44320-026-00193-X