Opis projektu
Rozszyfrowanie kwestii wiązania czynników transkrypcyjnych
Czynniki transkrypcyjne mają znaczenie kliniczne, ponieważ ich mutacje są często związane z chorobą i mogą być celami terapii. Zrozumienie, dlaczego czynnik transkrypcyjny wiąże się z określoną chromatyną, może prowadzić do lepszych prognoz klinicznych i ukierunkowanych terapii. Jednak obecnie nie ma dostępnych sposobów pomiaru biochemicznej kinetyki zdarzeń wiązania czynników transkrypcyjnych. Finansowany przez ERBN projekt TF-KINETIX ma na celu opracowanie nowych narzędzi proteomicznych i genomicznych, które mogłyby mierzyć regulację kinetyki wiązania czynników transkrypcyjnych z chromatynizowanym genomem. W tym celu rozwikła kwestię kinetyki na poziomie interaktomu i genomu dla trzech czynników transkrypcyjnych związanych z rakiem płuc. Zaprojektuje również predykcyjne modele wiązania w celu stworzenia profili wiązania czynników transkrypcyjnych swoistych dla stanu komórki.
Cel
Transcription factor binding is orchestrated by a complex interplay between DNA sequence, chromatin composition, protein interactions, and transcription factor concentration. These regulatory features determine the binding kinetics: how long it takes for a certain amount of transcription factor to associate, and subsequently dissociate from specific binding sites. These kinetics are in turn determined by the thermodynamic properties of each interaction.
It is currently not possible to measure the biochemical kinetics of transcription factor binding across the chromatinized genome inside the nucleus of a cell. To understand why a transcription factor binds to a specific chromatin:DNA-sequence context in a specific cellular state at a specific time, we need to measure how chromatin and DNA influence the biochemical parameters that underpin transcription factor binding. This gap in knowledge limits our functional understanding of why a binding event occurs, and it hampers accurate predictions of transcription factor binding.
Here, I will establish a novel proteomics and genomics toolkit to decipher the regulation of transcription factor binding kinetics to the chromatinized genome. I will resolve interactome- and genome-wide binding kinetics of three lung-cancer-associated transcription factors. By delineating association and dissociation rates, and changes in disorder and binding energy, of all binding events across the genome, I aim to obtain a quantitative understanding of how the proteome composition, epigenetic landscape, and genetic code dictate transcription factor binding. Finally, I will build predictive binding models to engineer cell-state-specific transcription factor binding profiles.
Together, this will transform our knowledge about transcription factor binding into a functional understanding where instead of observing, we understand why each binding event occurs when it occurs, and how we can steer these events.
Dziedzina nauki (EuroSciVoc)
Klasyfikacja projektów w serwisie CORDIS opiera się na wielojęzycznej taksonomii EuroSciVoc, obejmującej wszystkie dziedziny nauki, w oparciu o półautomatyczny proces bazujący na technikach przetwarzania języka naturalnego. Więcej informacji: Europejski Słownik Naukowy.
Klasyfikacja projektów w serwisie CORDIS opiera się na wielojęzycznej taksonomii EuroSciVoc, obejmującej wszystkie dziedziny nauki, w oparciu o półautomatyczny proces bazujący na technikach przetwarzania języka naturalnego. Więcej informacji: Europejski Słownik Naukowy.
- nauki przyrodnicze nauki biologiczne biochemia biocząsteczki białka proteomika
- nauki przyrodnicze nauki biologiczne genetyka DNA
- nauki przyrodnicze nauki biologiczne genetyka genom
Aby użyć tej funkcji, musisz się zalogować lub zarejestrować
Przepraszamy… podczas wykonywania operacji wystąpił nieoczekiwany błąd.
Wymagane uwierzytelnienie. Powodem może być wygaśnięcie sesji.
Dziękujemy za przesłanie opinii. Wkrótce otrzymasz wiadomość e-mail z potwierdzeniem zgłoszenia. W przypadku wybrania opcji otrzymywania powiadomień o statusie zgłoszenia, skontaktujemy się również gdy status ulegnie zmianie.
Słowa kluczowe
Słowa kluczowe dotyczące projektu wybrane przez koordynatora projektu. Nie należy mylić ich z pojęciami z taksonomii EuroSciVoc dotyczącymi dziedzin nauki.
Słowa kluczowe dotyczące projektu wybrane przez koordynatora projektu. Nie należy mylić ich z pojęciami z taksonomii EuroSciVoc dotyczącymi dziedzin nauki.
Program(-y)
Wieloletnie programy finansowania, które określają priorytety Unii Europejskiej w obszarach badań naukowych i innowacji.
Wieloletnie programy finansowania, które określają priorytety Unii Europejskiej w obszarach badań naukowych i innowacji.
-
HORIZON.1.1 - European Research Council (ERC)
GŁÓWNY PROGRAM
Wyświetl wszystkie projekty finansowane w ramach tego programu
Temat(-y)
Zaproszenia do składania wniosków dzielą się na tematy. Każdy temat określa wybrany obszar lub wybrane zagadnienie, których powinny dotyczyć wnioski składane przez wnioskodawców. Opis tematu obejmuje jego szczegółowy zakres i oczekiwane oddziaływanie finansowanego projektu.
Zaproszenia do składania wniosków dzielą się na tematy. Każdy temat określa wybrany obszar lub wybrane zagadnienie, których powinny dotyczyć wnioski składane przez wnioskodawców. Opis tematu obejmuje jego szczegółowy zakres i oczekiwane oddziaływanie finansowanego projektu.
System finansowania
Program finansowania (lub „rodzaj działania”) realizowany w ramach programu o wspólnych cechach. Określa zakres finansowania, stawkę zwrotu kosztów, szczegółowe kryteria oceny kwalifikowalności kosztów w celu ich finansowania oraz stosowanie uproszczonych form rozliczania kosztów, takich jak rozliczanie ryczałtowe.
Program finansowania (lub „rodzaj działania”) realizowany w ramach programu o wspólnych cechach. Określa zakres finansowania, stawkę zwrotu kosztów, szczegółowe kryteria oceny kwalifikowalności kosztów w celu ich finansowania oraz stosowanie uproszczonych form rozliczania kosztów, takich jak rozliczanie ryczałtowe.
HORIZON-ERC - HORIZON ERC Grants
Wyświetl wszystkie projekty finansowane w ramach tego programu finansowania
Zaproszenie do składania wniosków
Procedura zapraszania wnioskodawców do składania wniosków projektowych w celu uzyskania finansowania ze środków Unii Europejskiej.
Procedura zapraszania wnioskodawców do składania wniosków projektowych w celu uzyskania finansowania ze środków Unii Europejskiej.
(odnośnik otworzy się w nowym oknie) ERC-2024-STG
Wyświetl wszystkie projekty finansowane w ramach tego zaproszeniaInstytucja przyjmująca
Kwota netto dofinansowania ze środków Unii Europejskiej. Suma środków otrzymanych przez uczestnika, pomniejszona o kwotę unijnego dofinansowania przekazanego powiązanym podmiotom zewnętrznym. Uwzględnia podział unijnego dofinansowania pomiędzy bezpośrednich beneficjentów projektu i pozostałych uczestników, w tym podmioty zewnętrzne.
1066 CX AMSTERDAM
Niderlandy
Ogół kosztów poniesionych przez organizację w związku z uczestnictwem w projekcie. Obejmuje koszty bezpośrednie i pośrednie. Kwota stanowi część całkowitego budżetu projektu.