Opis projektu
Badanie mechanizmów choroby Alzheimera dzięki sekwencjonowaniu RNA
Choroba Alzheimera jest jedną z najpowszechniejszych chorób neurodegeneracyjnych, która wynika z wielu uwarunkowań genetycznych i molekularnych, a wiele z nich wciąż nie zostało dokładnie zbadane. Luki w wiedzy dotyczą przede wszystkim dziedzicznej i wczesnej postaci tej choroby. Zespół finansowanego ze środków działania „Maria Skłodowska-Curie” projektu TranscriptAccuracyAD wykorzysta sekwencjonowanie RNA metodą długich odczytów w celu zbadania różnic określonych mutacji genu PSEN1 w liniach komórkowych z mutacją i w liniach skorygowanych, aby zidentyfikować zmiany transkrypcyjne związane z chorobą oraz mechanizmy wspólne dla typowej postaci choroby Alzheimera. Badacze połączą w tym celu zaawansowaną analizę obliczeniową oraz zestawienia zbiorów danych w celu wskazania zaburzonych szlaków sygnalizacyjnych, a także zbadania potencjalnych celów dla leków opartych na RNA. Celem projektu jest pogłębienie zrozumienia choroby Alzheimera na poziomie molekularnym i pomoc w opracowaniu nowatorskich metod leczenia opartych na mechanizmach chorobowych.
Cel
Mutations in Presenilin 1 (PSEN1) represent the most common cause of autosomal dominant familial Alzheimer’s disease (fAD), resulting in a severe early-onset phenotype. Two pathogenic PSEN1 variants, the intron 4 deletion (int4del) and the missense mutation R278I, have been associated with fAD. However, their transcriptional consequences remain remarkably understudied.
I hypothesise that int4del and R278I (i) perturb PSEN1 splicing, thereby compromising diverse PSEN1 functions in neuronal pathways that are central to Alzheimer’s pathogenesis, with the potential to exacerbate pathology; and (ii) can reveal molecular mechanisms shared with sporadic forms of the disease, paving the way for novel therapeutic strategies.
To test this hypothesis, I propose analysing a novel long-read RNA-sequencing dataset formed by 12 induced pluripotent stem cell (iPSC)-derived samples from two fAD patients. These include triplicate neuronal lines harbouring the int4del and R278I mutations, respectively, alongside isogenic CRISPR-Cas9-corrected controls. Using cutting-edge techniques developed at Prof. Ana Conesa’s lab (I2SysBio, Valencia, Spain), I will: (i) characterise the complex transcriptional landscape associated with each mutation; (ii) predict the disruption of cis-acting regulators and related consequences on transcript structure; (iii) evaluate downstream cellular pathways compromised by altered transcripts; and (iv) cross-evaluate the fAD transcriptional signatures detected against published datasets from sporadic AD (sAD) patients. During my secondment at the Institute of Neurosciences (Alicante, Spain), I will be excellently trained in wet-lab assays to acquire practical skills in shRNA delivery and cell line manipulation within the context of neurodegeneration.
This work will provide critical insights into the transcriptional mechanisms underlying fAD pathogenesis, aiming to inform the identification of novel RNA therapeutic strategies with applications in sAD.
Dziedzina nauki (EuroSciVoc)
Klasyfikacja projektów w serwisie CORDIS opiera się na wielojęzycznej taksonomii EuroSciVoc, obejmującej wszystkie dziedziny nauki, w oparciu o półautomatyczny proces bazujący na technikach przetwarzania języka naturalnego. Więcej informacji: Europejski Słownik Naukowy.
Klasyfikacja projektów w serwisie CORDIS opiera się na wielojęzycznej taksonomii EuroSciVoc, obejmującej wszystkie dziedziny nauki, w oparciu o półautomatyczny proces bazujący na technikach przetwarzania języka naturalnego. Więcej informacji: Europejski Słownik Naukowy.
- nauki przyrodnicze nauki biologiczne neurobiologia
- medycyna i nauki o zdrowiu medycyna kliniczna neurologia demencja choroba Alzheimera
- medycyna i nauki o zdrowiu medycyna kliniczna fizjologia patofizjologia
- medycyna i nauki o zdrowiu biotechnologia medyczna technologie komórkowe komórki macierzyste
- nauki przyrodnicze nauki biologiczne genetyka mutacja
Aby użyć tej funkcji, musisz się zalogować lub zarejestrować
Program(-y)
Wieloletnie programy finansowania, które określają priorytety Unii Europejskiej w obszarach badań naukowych i innowacji.
Wieloletnie programy finansowania, które określają priorytety Unii Europejskiej w obszarach badań naukowych i innowacji.
-
HORIZON.1.2 - Marie Skłodowska-Curie Actions (MSCA)
GŁÓWNY PROGRAM
Wyświetl wszystkie projekty finansowane w ramach tego programu
Temat(-y)
Zaproszenia do składania wniosków dzielą się na tematy. Każdy temat określa wybrany obszar lub wybrane zagadnienie, których powinny dotyczyć wnioski składane przez wnioskodawców. Opis tematu obejmuje jego szczegółowy zakres i oczekiwane oddziaływanie finansowanego projektu.
Zaproszenia do składania wniosków dzielą się na tematy. Każdy temat określa wybrany obszar lub wybrane zagadnienie, których powinny dotyczyć wnioski składane przez wnioskodawców. Opis tematu obejmuje jego szczegółowy zakres i oczekiwane oddziaływanie finansowanego projektu.
System finansowania
Program finansowania (lub „rodzaj działania”) realizowany w ramach programu o wspólnych cechach. Określa zakres finansowania, stawkę zwrotu kosztów, szczegółowe kryteria oceny kwalifikowalności kosztów w celu ich finansowania oraz stosowanie uproszczonych form rozliczania kosztów, takich jak rozliczanie ryczałtowe.
Program finansowania (lub „rodzaj działania”) realizowany w ramach programu o wspólnych cechach. Określa zakres finansowania, stawkę zwrotu kosztów, szczegółowe kryteria oceny kwalifikowalności kosztów w celu ich finansowania oraz stosowanie uproszczonych form rozliczania kosztów, takich jak rozliczanie ryczałtowe.
HORIZON-TMA-MSCA-PF-EF - HORIZON TMA MSCA Postdoctoral Fellowships - European Fellowships
Wyświetl wszystkie projekty finansowane w ramach tego programu finansowania
Zaproszenie do składania wniosków
Procedura zapraszania wnioskodawców do składania wniosków projektowych w celu uzyskania finansowania ze środków Unii Europejskiej.
Procedura zapraszania wnioskodawców do składania wniosków projektowych w celu uzyskania finansowania ze środków Unii Europejskiej.
(odnośnik otworzy się w nowym oknie) HORIZON-MSCA-2025-PF
Wyświetl wszystkie projekty finansowane w ramach tego zaproszeniaKoordynator
Kwota netto dofinansowania ze środków Unii Europejskiej. Suma środków otrzymanych przez uczestnika, pomniejszona o kwotę unijnego dofinansowania przekazanego powiązanym podmiotom zewnętrznym. Uwzględnia podział unijnego dofinansowania pomiędzy bezpośrednich beneficjentów projektu i pozostałych uczestników, w tym podmioty zewnętrzne.
28006 Madrid
Hiszpania
Ogół kosztów poniesionych przez organizację w związku z uczestnictwem w projekcie. Obejmuje koszty bezpośrednie i pośrednie. Kwota stanowi część całkowitego budżetu projektu.