Skip to main content
Przejdź do strony domowej Komisji Europejskiej (odnośnik otworzy się w nowym oknie)
polski polski
CORDIS - Wyniki badań wspieranych przez UE
CORDIS
Zawartość zarchiwizowana w dniu 2024-05-30

Chromatin and transcription in ES cells: from single cells to genome wide views

Cel

How embryonic stem cells (ESCs) maintain their dual capacity to self-renew and to differentiate into all cell types is one of the fundamental questions in biology. Although this question remains largely open, there is growing evidence suggesting that chromatin plasticity is a fundamental hallmark of ESCs, providing their necessary flexibility.
Previously we found that ESCs possess a relatively open chromatin conformation, giving rise to permissive transcriptional program. Here I propose to investigate the mechanisms that support chromatin plasticity and pluripotency in ESCs.
Using a simple biochemical assay which I developed (DCAP: Differential Chromatin Associated Proteins), based on micrococcal nuclease (MNase) digestion combined with multi-dimensional protein identification technology (MudPIT), I seek to identify ESC-specific chromatin proteins. Selected proteins will be knocked-down (or out) and their ESC function will be evaluated.
In addition, I will conduct a hypothesis-driven research using mutant ESCs and epigenetic-related drugs to search for potential mechanisms, (i.e. histone modifications, DNA methylation), that may support chromatin plasticity in ESCs. Based on our intriguing preliminary data, I will also focus on the link between the nuclear lamina and ESC plasticity.
Thirdly, we will analyze non-polyadenylated transcription using genome-wide tiling arrays and RNA-seq. We will design custom microarrays containing the identified sequences, which will allow us to reveal, using ChIP-chip experiments, the mechanistic regulation of the non-polyadenylated transcripts. Finally, we will knockout, using zinc-finger nuclease technology, selected highly conserved candidates in search of their function.
Understanding chromatin regulation, plasticity and function will enable one to intelligently manipulate ESCs to transition between the pluripotent, multipotent and unipotent states and to expedite their use in the clinic.

Dziedzina nauki (EuroSciVoc)

Klasyfikacja projektów w serwisie CORDIS opiera się na wielojęzycznej taksonomii EuroSciVoc, obejmującej wszystkie dziedziny nauki, w oparciu o półautomatyczny proces bazujący na technikach przetwarzania języka naturalnego. Więcej informacji: https://op.europa.eu/pl/web/eu-vocabularies/euroscivoc.

Aby użyć tej funkcji, musisz się zalogować lub zarejestrować

Program(-y)

Wieloletnie programy finansowania, które określają priorytety Unii Europejskiej w obszarach badań naukowych i innowacji.

Temat(-y)

Zaproszenia do składania wniosków dzielą się na tematy. Każdy temat określa wybrany obszar lub wybrane zagadnienie, których powinny dotyczyć wnioski składane przez wnioskodawców. Opis tematu obejmuje jego szczegółowy zakres i oczekiwane oddziaływanie finansowanego projektu.

Zaproszenie do składania wniosków

Procedura zapraszania wnioskodawców do składania wniosków projektowych w celu uzyskania finansowania ze środków Unii Europejskiej.

ERC-2011-StG_20101109
Zobacz inne projekty w ramach tego zaproszenia

System finansowania

Program finansowania (lub „rodzaj działania”) realizowany w ramach programu o wspólnych cechach. Określa zakres finansowania, stawkę zwrotu kosztów, szczegółowe kryteria oceny kwalifikowalności kosztów w celu ich finansowania oraz stosowanie uproszczonych form rozliczania kosztów, takich jak rozliczanie ryczałtowe.

ERC-SG - ERC Starting Grant

Instytucja przyjmująca

THE HEBREW UNIVERSITY OF JERUSALEM
Wkład UE
€ 1 500 000,00
Koszt całkowity

Ogół kosztów poniesionych przez organizację w związku z uczestnictwem w projekcie. Obejmuje koszty bezpośrednie i pośrednie. Kwota stanowi część całkowitego budżetu projektu.

Brak danych

Beneficjenci (1)

Moja broszura 0 0