Cel
The human genome is largely composed of non-coding DNA, only 3-5% codes for exons. The majority of the non-coding DNA is however fundamental for the correct functioning and regulation of the genome. Transposable elements (TEs) like LINEs generated up to 50% of the human genome during evolution. They can mobilize, causing mutations but also conferring genomic plasticity. The generation of new insertions in the germ line led to the concept of TEs as ‘selfish’ DNA. However, inconsistent with their hereditary transmission, it was recently shown by the host lab and others that most of the action of TEs occurs in somatic cells during early embryogenesis.
Thus, to deeply understand the impact of the somatic activity of LINE elements, we propose to develop and use an in vivo mouse model for LINE transposition. We will use human embryonic stem cells (hESCs) and tissue-specific iPSCs, containing an eGFP-marked LINE reporter cassette. Once injected into immuno-suppressed mice these cells will develop teratomas containing tissues of the 3 germ layers (endo, meso, ectoderm). For the proof of principle, the host lab has injected human embryonic carcinoma cells (hECs). With this model, we aim to answer the following: 1) Are LINEs active in all three germ layers?; 2) Are LINEs differentially regulated, depending on the germ layer?; 3) What’s the impact of LINE activity in the somatic tissues?
To answer these questions, we will FACS-sort parts of the teratoma into ecto-, meso-, and endoderm-like cells and map the site of new LINE insertions during development, using deep sequencing. We aim to detect hot spots of LINE integration, allowing the analysis of possible genetic and phenotypic consequences. Imaging of the rest of the teratoma will further show us cell types where transposition occurs with higher frequency and possible phenotypic alterations. We therefore hope to detect new principles of genomic plasticity that could regulate gene expression.
Dziedzina nauki (EuroSciVoc)
Klasyfikacja projektów w serwisie CORDIS opiera się na wielojęzycznej taksonomii EuroSciVoc, obejmującej wszystkie dziedziny nauki, w oparciu o półautomatyczny proces bazujący na technikach przetwarzania języka naturalnego. Więcej informacji: Europejski Słownik Naukowy.
Klasyfikacja projektów w serwisie CORDIS opiera się na wielojęzycznej taksonomii EuroSciVoc, obejmującej wszystkie dziedziny nauki, w oparciu o półautomatyczny proces bazujący na technikach przetwarzania języka naturalnego. Więcej informacji: Europejski Słownik Naukowy.
- nauki przyrodnicze nauki biologiczne genetyka DNA
- nauki przyrodnicze nauki biologiczne biologia rozwoju
- medycyna i nauki o zdrowiu biotechnologia medyczna technologie komórkowe komórki macierzyste
- nauki przyrodnicze nauki biologiczne genetyka mutacja
- nauki przyrodnicze nauki biologiczne genetyka genom
Aby użyć tej funkcji, musisz się zalogować lub zarejestrować
Przepraszamy… podczas wykonywania operacji wystąpił nieoczekiwany błąd.
Wymagane uwierzytelnienie. Powodem może być wygaśnięcie sesji.
Dziękujemy za przesłanie opinii. Wkrótce otrzymasz wiadomość e-mail z potwierdzeniem zgłoszenia. W przypadku wybrania opcji otrzymywania powiadomień o statusie zgłoszenia, skontaktujemy się również gdy status ulegnie zmianie.
Program(-y)
Wieloletnie programy finansowania, które określają priorytety Unii Europejskiej w obszarach badań naukowych i innowacji.
Wieloletnie programy finansowania, które określają priorytety Unii Europejskiej w obszarach badań naukowych i innowacji.
Temat(-y)
Zaproszenia do składania wniosków dzielą się na tematy. Każdy temat określa wybrany obszar lub wybrane zagadnienie, których powinny dotyczyć wnioski składane przez wnioskodawców. Opis tematu obejmuje jego szczegółowy zakres i oczekiwane oddziaływanie finansowanego projektu.
Zaproszenia do składania wniosków dzielą się na tematy. Każdy temat określa wybrany obszar lub wybrane zagadnienie, których powinny dotyczyć wnioski składane przez wnioskodawców. Opis tematu obejmuje jego szczegółowy zakres i oczekiwane oddziaływanie finansowanego projektu.
Zaproszenie do składania wniosków
Procedura zapraszania wnioskodawców do składania wniosków projektowych w celu uzyskania finansowania ze środków Unii Europejskiej.
Procedura zapraszania wnioskodawców do składania wniosków projektowych w celu uzyskania finansowania ze środków Unii Europejskiej.
FP7-PEOPLE-2011-IEF
Zobacz inne projekty w ramach tego zaproszenia
System finansowania
Program finansowania (lub „rodzaj działania”) realizowany w ramach programu o wspólnych cechach. Określa zakres finansowania, stawkę zwrotu kosztów, szczegółowe kryteria oceny kwalifikowalności kosztów w celu ich finansowania oraz stosowanie uproszczonych form rozliczania kosztów, takich jak rozliczanie ryczałtowe.
Program finansowania (lub „rodzaj działania”) realizowany w ramach programu o wspólnych cechach. Określa zakres finansowania, stawkę zwrotu kosztów, szczegółowe kryteria oceny kwalifikowalności kosztów w celu ich finansowania oraz stosowanie uproszczonych form rozliczania kosztów, takich jak rozliczanie ryczałtowe.
Koordynator
41092 Sevilla
Hiszpania
Ogół kosztów poniesionych przez organizację w związku z uczestnictwem w projekcie. Obejmuje koszty bezpośrednie i pośrednie. Kwota stanowi część całkowitego budżetu projektu.