Cel
With ever new emerging experimental techniques and advances in computer simulations, it could be shown that solvation dynamics plays a fundamental role in many processes that are essential to life on a molecular scale. In particular, an ongoing intensive activity aims to elucidate the dynamical features of hydration water in the picoseconds time scale and terahertz (THz) spectral range, owing to the fact that numerous processes in water occur on this time scale.
The main aim of the project MOLDYKITA is to characterize the solvation dynamics at THz frequencies for a physiologic scenario of enzymatic catalysis, i.e. the interaction between a zinc metalloprotease enzyme and collagen-like molecules. The study will be carried out by means of molecular dynamics (MD) simulations and time resolved kinetic THz absorption spectroscopy (KITA) techniques, thus providing a robust basis for the interpretation of the experimental results.
The catalytic domain of human membrane type-1 matrix metalloproteinase (MMP) will be used as model enzyme. Two collagen-like molecules, a highly flexible single chain peptide (SCP) versus a more rigid triple helical peptides (THP), will be used as model substrates and compared in the process of substrate-enzyme docking.
This project will provide a microscopic picture of the changes in the water motions associated with substrate binding in the MMP-SCP and MMP-THP system. The aim is to answer to fundamental questions regarding solvation in enzyme catalysis, e.g. do water networks motions play a role in enzymatic catalysis and can water networks sense different substrates. The results of the project will show whether changes in protein and solvent dynamics are not mere epiphenomena, but have a vital role in substrate binding and recognition. These answers are of paramount importance for the fields of Physics, Chemistry and Biology and might turn out to be crucial for technological applications in drug design.
Dziedzina nauki (EuroSciVoc)
Klasyfikacja projektów w serwisie CORDIS opiera się na wielojęzycznej taksonomii EuroSciVoc, obejmującej wszystkie dziedziny nauki, w oparciu o półautomatyczny proces bazujący na technikach przetwarzania języka naturalnego. Więcej informacji: https://op.europa.eu/pl/web/eu-vocabularies/euroscivoc.
Klasyfikacja projektów w serwisie CORDIS opiera się na wielojęzycznej taksonomii EuroSciVoc, obejmującej wszystkie dziedziny nauki, w oparciu o półautomatyczny proces bazujący na technikach przetwarzania języka naturalnego. Więcej informacji: https://op.europa.eu/pl/web/eu-vocabularies/euroscivoc.
- nauki przyrodnicze nauki chemiczne chemia nieorganiczna metale przejściowe
- nauki przyrodnicze nauki fizyczne optyka spektroskopia spektroskopia absorpcyjna
- nauki przyrodnicze nauki chemiczne kataliza
- nauki przyrodnicze nauki biologiczne biochemia biocząsteczki białka enzymy
- nauki przyrodnicze matematyka matematyka stosowana model matematyczny
Aby użyć tej funkcji, musisz się zalogować lub zarejestrować
Przepraszamy… podczas wykonywania operacji wystąpił nieoczekiwany błąd.
Wymagane uwierzytelnienie. Powodem może być wygaśnięcie sesji.
Dziękujemy za przesłanie opinii. Wkrótce otrzymasz wiadomość e-mail z potwierdzeniem zgłoszenia. W przypadku wybrania opcji otrzymywania powiadomień o statusie zgłoszenia, skontaktujemy się również gdy status ulegnie zmianie.
Program(-y)
Wieloletnie programy finansowania, które określają priorytety Unii Europejskiej w obszarach badań naukowych i innowacji.
Wieloletnie programy finansowania, które określają priorytety Unii Europejskiej w obszarach badań naukowych i innowacji.
Temat(-y)
Zaproszenia do składania wniosków dzielą się na tematy. Każdy temat określa wybrany obszar lub wybrane zagadnienie, których powinny dotyczyć wnioski składane przez wnioskodawców. Opis tematu obejmuje jego szczegółowy zakres i oczekiwane oddziaływanie finansowanego projektu.
Zaproszenia do składania wniosków dzielą się na tematy. Każdy temat określa wybrany obszar lub wybrane zagadnienie, których powinny dotyczyć wnioski składane przez wnioskodawców. Opis tematu obejmuje jego szczegółowy zakres i oczekiwane oddziaływanie finansowanego projektu.
Zaproszenie do składania wniosków
Procedura zapraszania wnioskodawców do składania wniosków projektowych w celu uzyskania finansowania ze środków Unii Europejskiej.
Procedura zapraszania wnioskodawców do składania wniosków projektowych w celu uzyskania finansowania ze środków Unii Europejskiej.
FP7-PEOPLE-2012-IEF
Zobacz inne projekty w ramach tego zaproszenia
System finansowania
Program finansowania (lub „rodzaj działania”) realizowany w ramach programu o wspólnych cechach. Określa zakres finansowania, stawkę zwrotu kosztów, szczegółowe kryteria oceny kwalifikowalności kosztów w celu ich finansowania oraz stosowanie uproszczonych form rozliczania kosztów, takich jak rozliczanie ryczałtowe.
Program finansowania (lub „rodzaj działania”) realizowany w ramach programu o wspólnych cechach. Określa zakres finansowania, stawkę zwrotu kosztów, szczegółowe kryteria oceny kwalifikowalności kosztów w celu ich finansowania oraz stosowanie uproszczonych form rozliczania kosztów, takich jak rozliczanie ryczałtowe.
Koordynator
44801 Bochum
Niemcy
Ogół kosztów poniesionych przez organizację w związku z uczestnictwem w projekcie. Obejmuje koszty bezpośrednie i pośrednie. Kwota stanowi część całkowitego budżetu projektu.