Skip to main content
Przejdź do strony domowej Komisji Europejskiej (odnośnik otworzy się w nowym oknie)
polski pl
CORDIS - Wyniki badań wspieranych przez UE
CORDIS
Zawartość zarchiwizowana w dniu 2024-06-16

Structure based fold recognition using Dynamic Bayesian Networks

Cel

Structure Based Protein Fold Recognition Using Dynamic Bayesian Networks Today it remains impossible to predict the three-dimensional structure of a protein based on its amino acid sequence alone. The ability to predict protein structure from sequence would have great impact on crucial areas ranging from understanding protein function over protein design to drug development. To simplify the problem, fold recognition methods try to evaluate the possibility that a query sequence adopts any of the already known folds (the template folds). This is already extremely useful, since knowing that a sequence likely corresponds to a certain fold can e.g. lead to the elucidation of the protein's function. This can e.g. be used to perform gene annotation on a genomic scale. We propose to construct a novel structure based protein fold recognition method that uses a probabilistic description of protein structure using Dynamic Bayesian Networks (Dens), a machine learning method for which efficient methods exist to perform inference and parameter learning from data. This will allow us to construct probabilistic models that are in many ways more advanced than currently used techniques. In particular, we will develop Dens that represents local amino acid preference, local backbone structure, residue exposure and no local residue-residue contacts of a 'general' protein structure. These probabilistic models can then be used to evaluate the fit between a given sequence family superimposed on a specific structure, le. As a scoring function in a fold recognition method.

Dziedzina nauki (EuroSciVoc)

Klasyfikacja projektów w serwisie CORDIS opiera się na wielojęzycznej taksonomii EuroSciVoc, obejmującej wszystkie dziedziny nauki, w oparciu o półautomatyczny proces bazujący na technikach przetwarzania języka naturalnego. Więcej informacji: Europejski Słownik Naukowy.

Aby użyć tej funkcji, musisz się zalogować lub zarejestrować

Słowa kluczowe

Słowa kluczowe dotyczące projektu wybrane przez koordynatora projektu. Nie należy mylić ich z pojęciami z taksonomii EuroSciVoc dotyczącymi dziedzin nauki.

Temat(-y)

Zaproszenia do składania wniosków dzielą się na tematy. Każdy temat określa wybrany obszar lub wybrane zagadnienie, których powinny dotyczyć wnioski składane przez wnioskodawców. Opis tematu obejmuje jego szczegółowy zakres i oczekiwane oddziaływanie finansowanego projektu.

Zaproszenie do składania wniosków

Procedura zapraszania wnioskodawców do składania wniosków projektowych w celu uzyskania finansowania ze środków Unii Europejskiej.

FP6-2002-MOBILITY-5
Zobacz inne projekty w ramach tego zaproszenia

System finansowania

Program finansowania (lub „rodzaj działania”) realizowany w ramach programu o wspólnych cechach. Określa zakres finansowania, stawkę zwrotu kosztów, szczegółowe kryteria oceny kwalifikowalności kosztów w celu ich finansowania oraz stosowanie uproszczonych form rozliczania kosztów, takich jak rozliczanie ryczałtowe.

EIF - Marie Curie actions-Intra-European Fellowships

Koordynator

KOEBENHAVNS UNIVERSITET
Wkład UE
Brak danych
Adres
Oster Voldgade 3
COPENHAGEN K
Dania

Zobacz na mapie

Koszt całkowity

Ogół kosztów poniesionych przez organizację w związku z uczestnictwem w projekcie. Obejmuje koszty bezpośrednie i pośrednie. Kwota stanowi część całkowitego budżetu projektu.

Brak danych
Moja broszura 0 0