Opis projektu
Identyfikacja biomarkerów agresywności nowotworów
Guzy raka sutka zostały podzielone na kilka podtypów w celu określenia rokowania i odpowiedniego leczenia. Jedną z podstawowych przyczyn oporności raka na leczenie i jego nawrotów jest heterogeniczność nowotworów. W przypadku większości nowotworów guzy składają się z niejednorodnej masy komórek o różnych cechach. Finansowany przez ERBN projekt PROTEOMICAN zbada heterogeniczność guzów w raku sutka przy użyciu najnowszych technologii proteomicznych. Po profilowaniu proteomicznym w skali genomu regionów nowotworowych o zróżnicowanej histopatologii nastąpi badanie funkcjonalne w celu określenia potencjału nowotworowego poszczególnych subpopulacji komórek. Identyfikacja biomarkerów agresywności nowotworu w próbkach surowicy może doprowadzić do opracowania nowych leków, które rozwiążą problem rozwoju oporności na leczenie.
Cel
"In the proposed research we will explore the functional proteomic diversity of histologically-defined regions within human breast tumors, aiming to identify novel protein biomarkers of tumor aggressiveness. Once identified, these proteins will serve as potent diagnostic markers and therapeutic targets. Towards this aim we will perform genome-scale proteomic profiling on tumor regions displaying diverse histopathology. This will be followed by functional investigation of these cancer cell sub-populations to determine their tumorigenic potential, and search for microparticle-based proteomic biomarkers from serum samples towards identification of cancer aggressiveness in blood tests.
Analysis of the proteomic diversity holds a promise to reveal yet unidentified regulators of the tumorigenic phenotype as quantitative protein profiling is expected to most faithfully predict cellular phenotypes. This will be accomplished using the 'super-SILAC' technology, which I developed during my post-doctoral research. Using this technology, we identified over 12,000 proteins in formalin-fixed paraffin embedded breast cancer tumors. In the current project we will take one large step further, namely, microdissect and analyze selected regions in breast tumors based on local histopathological characteristics, such as the expression of known markers, cancer cell density, the vicinity to blood vessels and to the tumor invasive front. This ""topological map"" of the proteome will be followed by functional in vitro and in vivo studies, directly probing the aggressiveness of these cell populations, manifested by an accelerated proliferation and invasive/metastatic capacity. Finally, proteins associated with tumor aggressiveness will serve as blood-based biomarkers for predicting the tumorigenic phenotype using non-invasive tests. This work will set the basis for quantitative probing of tumor heterogeneity, which is crucial for accurate diagnosis and effective therapy.
"
Dziedzina nauki (EuroSciVoc)
Klasyfikacja projektów w serwisie CORDIS opiera się na wielojęzycznej taksonomii EuroSciVoc, obejmującej wszystkie dziedziny nauki, w oparciu o półautomatyczny proces bazujący na technikach przetwarzania języka naturalnego.
Klasyfikacja projektów w serwisie CORDIS opiera się na wielojęzycznej taksonomii EuroSciVoc, obejmującej wszystkie dziedziny nauki, w oparciu o półautomatyczny proces bazujący na technikach przetwarzania języka naturalnego.
- nauki przyrodniczenauki biologicznebiochemiabiocząsteczkibiałkaproteomika
- medycyna i nauki o zdrowiumedycyna klinicznaonkologiarak piersi
- inżynieria i technologiainżynieria medycznatechnologia analityki medycznejtechnologie diagnostyczne
Aby użyć tej funkcji, musisz się zalogować lub zarejestrować
Program(-y)
Temat(-y)
System finansowania
ERC-STG - Starting GrantInstytucja przyjmująca
69978 Tel Aviv
Izrael