Opis projektu
Dogłębna analiza genetyczna cukrzycy monogenowej
Cukrzyca typu MODY (ang. Maturity Onset Diabetes of the Young), jeden z typów cukrzycy monogenowej, to choroba dziedziczona zgodnie z prawem Mendla odnosząca się do dowolnej spośród kilku postaci dziedzicznych cukrzycy, spowodowana przez mutacje dziedziczone autosomalnie dominująco, upośledzające produkcję insuliny. Testy genetyczne nie wykrywają mutacji przyczyniających się do rozwoju ponad 50 % znanych chorób dziedziczonych zgodnie z prawem Mendla, co podkreśla pilną potrzebę ustalenia roli niekodujących mutacji w rozwoju tej choroby. Celem finansowanego ze środków UE projektu DecodeDiabetes jest opracowanie strategii analizy genetycznej zmian regulacyjnych w chorobach dziedziczonych zgodnie z prawem Mendla. W ramach projektu powstały zasoby epigenomowe do interpretacji genomu regulacyjnego w trzustce zarodka i wysepkach Langerhansa u osób dorosłych. Co istotne, badacze zgromadzili dużą kohortę pacjentów różnych narodowości z fenotypem cukrzycy monogenowej, u których występuje zwiększone prawdopodobieństwo występowania niekodujących mutacji. W połączeniu z innowacyjnymi technologiami te zasoby pomogą w odkryciu niekodujących mutacji odpowiedzialnych za rozwój choroby.
Cel
Whole genome sequencing is quickly becoming a routine clinical instrument. However, our ability to decipher DNA variants is still largely limited to protein-coding exons, which comprise 1% of the genome. Most known Mendelian mutations are in exons, yet genetic testing still fails to show causal coding mutations in more than 50% of well-characterized Mendelian disorders. This defines a pressing need to interpret noncoding genome sequences, and to establish the role of noncoding mutations in Mendelian disease.
A recent case study harnessed whole genome sequencing, epigenomics, and functional genomics to show that mutations in an enhancer cause most cases of neonatal diabetes due to pancreas agenesis. This example raises major questions: (i) what is the overall impact of penetrant regulatory mutations in human diabetes? (ii) do regulatory mutations cause distinct forms of diabetes? (iii) more generally, can we develop a strategy to systematically tackle regulatory variation in Mendelian disease?
The current project will address these questions with unique resources. First, we have created epigenomic and functional perturbation resources to interpret the regulatory genome in embryonic pancreas and adult pancreatic islets. Second, we have collected an unprecedented international cohort of patients with a phenotype consistent with monogenic diabetes, yet lacking mutations in known gene culprits after genetic testing, and therefore with increased likelihood of harboring noncoding mutations. Third, we have developed a prototype platform to sequence regulatory mutations in a large number of patients.
These resources will be combined with innovative strategies to uncover causal enhancer mutations underlying Mendelian diabetes. If successful, this project will expand the diagnostic spectrum of diabetes, it will discover new genetic regulators of diabetes-relevant networks, and will provide a framework to understand regulatory variation in Mendelian disease.
Dziedzina nauki (EuroSciVoc)
Klasyfikacja projektów w serwisie CORDIS opiera się na wielojęzycznej taksonomii EuroSciVoc, obejmującej wszystkie dziedziny nauki, w oparciu o półautomatyczny proces bazujący na technikach przetwarzania języka naturalnego. Więcej informacji: https://op.europa.eu/en/web/eu-vocabularies/euroscivoc
Klasyfikacja projektów w serwisie CORDIS opiera się na wielojęzycznej taksonomii EuroSciVoc, obejmującej wszystkie dziedziny nauki, w oparciu o półautomatyczny proces bazujący na technikach przetwarzania języka naturalnego. Więcej informacji: https://op.europa.eu/en/web/eu-vocabularies/euroscivoc
- nauki przyrodniczenauki biologicznegenetykaDNA
- medycyna i nauki o zdrowiumedycyna klinicznaendokrynologiacukrzyca
- nauki przyrodniczenauki biologicznegenetykamutacja
- nauki przyrodniczenauki biologicznegenetykagenom
Aby użyć tej funkcji, musisz się zalogować lub zarejestrować
Przepraszamy… podczas wykonywania operacji wystąpił nieoczekiwany błąd.
Wymagane uwierzytelnienie. Powodem może być wygaśnięcie sesji.
Dziękujemy za przesłanie opinii. Wkrótce otrzymasz wiadomość e-mail z potwierdzeniem zgłoszenia. W przypadku wybrania opcji otrzymywania powiadomień o statusie zgłoszenia, skontaktujemy się również gdy status ulegnie zmianie.
Program(-y)
Temat(-y)
Zaproszenie do składania wniosków
(odnośnik otworzy się w nowym oknie) ERC-2017-ADG
Zobacz inne projekty w ramach tego zaproszeniaSystem finansowania
ERC-ADG -Instytucja przyjmująca
08003 Barcelona
Hiszpania