Skip to main content
Przejdź do strony domowej Komisji Europejskiej (odnośnik otworzy się w nowym oknie)
polski polski
CORDIS - Wyniki badań wspieranych przez UE
CORDIS

Discovering functional protein-RNA interactions through data integration and machine learning.

Cel

RNA-binding proteins are implicated across a wide spectrum of human genetic disorders, with molecular mechanisms ranging from aggregation of proteins and RNAs to defects in splicing and translation. Examples include heterogeneous and life-threatening genetic disorders such as Diamond-Blackfan anaemia, spinocerebellar ataxia and amyotrophic lateral sclerosis (ALS) among others.

The DeepRNA project targets genetic diseases via disease-associated variants in the human transcriptome and is enabled by recent data on expression quantitative trait loci (eQTLs) and experimentally determined RNA-protein and RNA-RNA interactions. The data will be complemented with high-quality RNA-protein interaction predictions carried out in the host group that has a strong track record in computing and validating RNA-protein associations.

To my knowledge the use of eQTL variants to study RNA-protein interactions is a novel approach and is useful for developing new tools for personalised medicine. My approach will expand the human interactome in a genome-wide manner beyond experimental data, which is currently available for only 352 of the 1,542 recently described RNA-binding proteins. Complementing experimentally determined interactions with predictions will allow me to expand my analyses of the human interactome to the genomic scale while maintaining accuracy, by using the experimental dataset as a gold standard. I will employ methods such as graph partitioning and graph neural network encoding to rationalise the effects of disease-associated variants on the human interaction network, and make quantitative predictions of polymorphisms associated with genetic diseases, thereby aiding personalised medicine.

I am confident that this fellowship will equip me with the domain knowledge, independence and transferrable skills to confidently and creatively build an interdisciplinary, globally recognised research team within Europe that will focus on medically relevant human signalling systems.

Dziedzina nauki (EuroSciVoc)

Klasyfikacja projektów w serwisie CORDIS opiera się na wielojęzycznej taksonomii EuroSciVoc, obejmującej wszystkie dziedziny nauki, w oparciu o półautomatyczny proces bazujący na technikach przetwarzania języka naturalnego. Więcej informacji: Europejski Słownik Naukowy.

Aby użyć tej funkcji, musisz się zalogować lub zarejestrować

Program(-y)

Wieloletnie programy finansowania, które określają priorytety Unii Europejskiej w obszarach badań naukowych i innowacji.

Temat(-y)

Zaproszenia do składania wniosków dzielą się na tematy. Każdy temat określa wybrany obszar lub wybrane zagadnienie, których powinny dotyczyć wnioski składane przez wnioskodawców. Opis tematu obejmuje jego szczegółowy zakres i oczekiwane oddziaływanie finansowanego projektu.

System finansowania

Program finansowania (lub „rodzaj działania”) realizowany w ramach programu o wspólnych cechach. Określa zakres finansowania, stawkę zwrotu kosztów, szczegółowe kryteria oceny kwalifikowalności kosztów w celu ich finansowania oraz stosowanie uproszczonych form rozliczania kosztów, takich jak rozliczanie ryczałtowe.

MSCA-IF-EF-ST - Standard EF

Wyświetl wszystkie projekty finansowane w ramach tego programu finansowania

Zaproszenie do składania wniosków

Procedura zapraszania wnioskodawców do składania wniosków projektowych w celu uzyskania finansowania ze środków Unii Europejskiej.

(odnośnik otworzy się w nowym oknie) H2020-MSCA-IF-2017

Wyświetl wszystkie projekty finansowane w ramach tego zaproszenia

Koordynator

FUNDACIO CENTRE DE REGULACIO GENOMICA
Wkład UE netto

Kwota netto dofinansowania ze środków Unii Europejskiej. Suma środków otrzymanych przez uczestnika, pomniejszona o kwotę unijnego dofinansowania przekazanego powiązanym podmiotom zewnętrznym. Uwzględnia podział unijnego dofinansowania pomiędzy bezpośrednich beneficjentów projektu i pozostałych uczestników, w tym podmioty zewnętrzne.

€ 158 121,60
Koszt całkowity

Ogół kosztów poniesionych przez organizację w związku z uczestnictwem w projekcie. Obejmuje koszty bezpośrednie i pośrednie. Kwota stanowi część całkowitego budżetu projektu.

€ 158 121,60
Moja broszura 0 0