Skip to main content
Przejdź do strony domowej Komisji Europejskiej (odnośnik otworzy się w nowym oknie)
polski polski
CORDIS - Wyniki badań wspieranych przez UE
CORDIS
CORDIScovery podcast 50th episode CORDIScovery podcast 50th episode

Towards Realistic Modelling of Nucleosome Organization Inside Functional Chromatin Domains

CORDIS oferuje możliwość skorzystania z odnośników do publicznie dostępnych publikacji i rezultatów projektów realizowanych w ramach programów ramowych HORYZONT.

Odnośniki do rezultatów i publikacji związanych z poszczególnymi projektami 7PR, a także odnośniki do niektórych konkretnych kategorii wyników, takich jak zbiory danych i oprogramowanie, są dynamicznie pobierane z systemu OpenAIRE .

Publikacje

Non-peer reviewed articles (1)
Reentrant liquid condensate phase of proteins is stabilized by hydrophobic and non-ionic interactions (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Georg Krainer, Timothy J. Welsh, Jerelle A. Joseph, Jorge R. Espinosa, Sina Wittmann, Ella de Csilléry, Akshay Sridhar, Zenon Toprakcioglu, Giedre Gudiškytė, Magdalena A. Czekalska, William E. Arter, Peter St George-Hyslop, Anthony A. Hyman, Rosana Collepardo-Guevara, Simon Alberti, Tuomas P.J. Knowles
Opublikowane w: Nature Communications, Numer 12, 2021, Strona(/y) 1085, ISSN 2041-1723
Wydawca: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-021-21181-9

Peer reviewed articles (13)
Nucleosome plasticity is a critical element of chromatin liquid–liquid phase separation and multivalent nucleosome interactions (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Stephen E Farr, Esmae J Woods, Jerelle A Joseph, Adiran Garaizar, Rosana Collepardo-Guevara
Opublikowane w: Nature Communications, Numer 12, 2021, Strona(/y) 2883, ISSN 2041-1723
Wydawca: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-021-23090-3

Valency and Binding Affinity Variations Can Regulate the Multilayered Organization of Protein Condensates with Many Components (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Ignacio Sanchez-Burgos, Jorge R. Espinosa, Jerelle A. Joseph, Rosana Collepardo-Guevara
Opublikowane w: Biomolecules, Numer 11, 2021, Strona(/y) 278, ISSN 2218-273X
Wydawca: MDPI
DOI: 10.3390/biom11020278

Targeted modulation of protein liquid-liquid phase separation by evolution of amino-acid sequence (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Simon M Lichtinger, Adiran Garaizar, Rosana Collepardo-Guevara, Aleks Reinhardt
Opublikowane w: Plos Computational Biology, Numer 17(8), 2021, Strona(/y) e1009328, ISSN 1553-734X
Wydawca: Public Library of Science
DOI: 10.1371/journal.pcbi.1009328

Physics-driven coarse-grained model for biomolecular phase separation with near-quantitative accuracy (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Jerelle A. Joseph, Aleks Reinhardt, Anne Aguirre, Pin Yu Chew, Kieran O. Russell, Jorge R. Espinosa, Adiran Garaizar, Rosana Collepardo-Guevara
Opublikowane w: Nature Computational Science, Numer 1, 2021, Strona(/y) 732–743, ISSN 2662-8457
Wydawca: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s43588-021-00155-3

Size conservation emerges spontaneously in biomolecular condensates formed by scaffolds and surfactant clients (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Ignacio Sanchez-Burgos, Jerelle A. Joseph, Rosana Collepardo-Guevara, Jorge R. Espinosa
Opublikowane w: Scientific Reports, Numer 11, 2021, Strona(/y) 15241, ISSN 2045-2322
Wydawca: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41598-021-94309-y

Liquid-like chromatin in the cell: What can we learn from imaging and computational modeling? (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Yuji Itoh, Esmae J. Woods, Katsuhiko Minami, Kazuhiro Maeshima, Rosana Collepardo-Guevara
Opublikowane w: Current Opinion in Structural Biology, Numer 71, 2021, Strona(/y) 123-135, ISSN 0959-440X
Wydawca: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.sbi.2021.06.004

Protein disorder-to-order transition enhances the nucleosome-binding affinity of H1 (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Akshay Sridhar, Modesto Orozco, Rosana Collepardo-Guevara
Opublikowane w: Nucleic Acids Research, Numer 48/10, 2020, Strona(/y) 5318–5331, ISSN 0305-1048
Wydawca: Oxford University Press
DOI: 10.1093/nar/gkaa285

Liquid network connectivity regulates the stability and composition of biomolecular condensates with many components (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Jorge R. Espinosa, Jerelle A. Joseph, Ignacio Sanchez-Burgos, Adiran Garaizar, Daan Frenkel, Rosana Collepardo-Guevara
Opublikowane w: Proceedings of the National Academy of Sciences, Numer 117/24, 2020, Strona(/y) 13238-13247, ISSN 0027-8424
Wydawca: National Academy of Sciences
DOI: 10.1073/pnas.1917569117

Expansion of Intrinsically Disordered Proteins Increases the Range of Stability of Liquid–Liquid Phase Separation (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Adiran Garaizar, Ignacio Sanchez-Burgos, Rosana Collepardo-Guevara, Jorge R. Espinosa
Opublikowane w: Molecules, Numer 25/20, 2020, Strona(/y) 4705, ISSN 1420-3049
Wydawca: Multidisciplinary Digital Publishing Institute (MDPI)
DOI: 10.3390/molecules25204705

Emergence of chromatin hierarchical loops from protein disorder and nucleosome asymmetry (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Akshay Sridhar, Stephen E. Farr, Guillem Portella, Tamar Schlick, Modesto Orozco, Rosana Collepardo-Guevara
Opublikowane w: Proceedings of the National Academy of Sciences, Numer 117/13, 2020, Strona(/y) 7216-7224, ISSN 0027-8424
Wydawca: National Academy of Sciences
DOI: 10.1073/pnas.1910044117

DNA binds to a specific site of the adhesive blood-protein von Willebrand factor guided by electrostatic interactions (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Angélica Sandoval-Pérez, Ricarda M L Berger, Adiran Garaizar, Stephen E Farr, Maria A Brehm, Gesa König, Stefan W Schneider, Rosana Collepardo-Guevara, Volker Huck, Joachim O Rädler, Camilo Aponte-Santamaría
Opublikowane w: Nucleic Acids Research, Numer 48/13, 2020, Strona(/y) 7333-7344, ISSN 0305-1048
Wydawca: Oxford University Press
DOI: 10.1093/nar/gkaa466

Thermodynamics and kinetics of phase separation of protein-RNA mixtures by a minimal model (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Jerelle A Joseph, Jorge R Espinosa, Ignacio Sanchez-Burgos, Adiran Garaizar, Daan Frenkel, Rosana Collepardo-Guevara
Opublikowane w: Biophysical Journal, Numer 120/7, 2021, Strona(/y) 1219-1230, ISSN 0006-3495
Wydawca: Biophysical Society
DOI: 10.1016/j.bpj.2021.01.031

Breakdown of the law of rectilinear diameter and related surprises in the liquid-vapor coexistence in systems of patchy particles (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Jorge R. Espinosa, Adiran Garaizar, Carlos Vega, Daan Frenkel, Rosana Collepardo-Guevara
Opublikowane w: The Journal of Chemical Physics, Numer 150/22, 2019, Strona(/y) 224510, ISSN 0021-9606
Wydawca: American Institute of Physics
DOI: 10.1063/1.5098551

Other (6)
Intermolecular reorganisation of single-component condensates during ageing promotes multiphase architectures (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Adiran Garaizar, Jorge R Espinosa, Jerelle A Joseph, Georg Krainer, Yi Shen, Tuomas PJ Knowles, Rosana Collepardo-Guevara
Opublikowane w: bioRxiv, 2021
Wydawca: Cold Spring Harbour
DOI: 10.1101/2021.10.09.463670

The chromatin regulator HMGA1a undergoes phase separation in the nucleus (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Hongjia Zhu, Masako Narita, Jerelle A. Joseph, Georg Krainer, Will Arter, Kadi L. Saar, Niklas Ermann, Jorge R. Espinosa, Yi Shen, Masami Ando Kuri, Runzhang Qi, Yufan Xu, Rosana Collepardo-Guevara, Masashi Narita, Tuomas P. J. Knowles
Opublikowane w: bioRxiv, 2021
Wydawca: Cold Spring Harbor
DOI: 10.1101/2021.10.14.464384

Oligonucleotides can act as superscaffolds that enhance liquid-liquid phase separation of intracellular mixtures (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Jerelle A. Joseph, Jorge R. Espinosa, Ignacio Sanchez-Burgos, Adiran Garaizar, Daan Frenkel, Rosana Collepardo-Guevara
Opublikowane w: bioRxiv, 2020
Wydawca: Cold Spring Harbor Laboratory
DOI: 10.1101/2020.01.24.916858

Kinetic interplay between droplet maturation and coalescence modulates shape of aged protein condensates (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Adiran Garaizar, Jorge R. Espinosa, Jerelle A. Joseph, Rosana Collepardo-Guevara
Opublikowane w: bioRxiv, 2021
Wydawca: Cold Spring Harbor
DOI: 10.1101/2021.10.07.463530

Surface electrostatics govern the emulsion stability of biomolecular condensates (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Timothy J. Welsh, Georg Krainer, Jorge R. Espinosa, Jerelle A. Joseph, Akshay Sridhar, Marcus Jahnel, William E. Arter, Kadi L. Saar, Simon Alberti, Rosana Collepardo-Guevara, Tuomas P.J. Knowles
Opublikowane w: bioRxiv, 2020
Wydawca: Cold Spring Harbor Labortory
DOI: 10.1101/2020.04.20.047910

RNA length has a non-trivial effect in the stability of biomolecular condensates formed by RNA-binding proteins (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Ignacio Sanchez-Burgos, Jorge R Espinosa, Jerelle A Joseph, Rosana Collepardo-Guevara
Opublikowane w: bioRxiv, 2021
Wydawca: Cold Spring Harbour
DOI: 10.1101/2021.10.07.463486

Wyszukiwanie danych OpenAIRE...

Podczas wyszukiwania danych OpenAIRE wystąpił błąd

Brak wyników

Udostępnij tę stronę Udostępnij tę stronę w mediach społecznościowych

Pobierz Pobierz zawartość strony

Ostatnia aktualizacja: 12 Maja 2025

Moja broszura

Permalink: https://cordis.europa.eu/project/id/803326/results/pl

European Union, 2025

Moja broszura 0 0