Skip to main content
Przejdź do strony domowej Komisji Europejskiej (odnośnik otworzy się w nowym oknie)
polski pl
CORDIS - Wyniki badań wspieranych przez UE
CORDIS

Erasing the superintegron to understand the role of chromosomal integrons in bacterial evolution

Opis projektu

Wgląd w ruchome elementy genetyczne bakterii – lekcje, jakich udzieliła nam cholera

Elementy genetyczne bakterii, takie jak integrony, są odpowiedzialne za ewolucję szczepów bakteryjnych na drodze transferu genów. Istnienie ruchomych integronów powiązane jest z opornością bakterii na antybiotyki, który to stan stanowi poważne wyzwanie dla opieki zdrowotnej. Uczeni pracujący nad finansowanym ze środków UE projektem KryptonInt badają superintegron (SI), nieruchomy integron chromosomalny (SCI) znajdujący się w chromosomie przecinkowca cholery, bakterii wywołującej cholerę. Poprzez usunięcie superintegronu naukowcy badają rolę i zdolność adaptacyjną integronów występujących w naturze i przyglądają się mechanizmom odpowiadającym za wycinanie genów do ruchomych elementów genetycznych. Wyniki badań doprowadzą do ujawnienia istotnych informacji dotyczących rozkładu elementów odpowiedzialnych za występowanie oporności na antybiotyki wśród gatunku ludzkiego, zwierząt, roślin i w ogólnie rozumianym środowisku.

Cel

Integrons are genetic platforms that enhance bacterial evolvability through the acquisition and stockpiling of new genes encoded in mobile elements named cassettes. They are found in the chromosomes of environmental bacteria but some have acquired mobility through their association to transposons and conjugative plasmids. These mobile integrons (MI) caused the unexpected rise of multidrug resistance that is now a major threat to modern medicine, and are good proof of the adaptive power of integrons. Class 1 integrons are the most relevant MI and the major experimental model. Yet little is known about the hundreds of sedentary chromosomal integrons (SCI) that have driven bacterial evolution for eons. The paradigm of SCI is the superintegron (SI), an extremely large integron located in the chromosome of Vibrio cholerae, the causative agent of Cholera disease. Despite its role in the adaptability of one of the deadliest pathogens in history, the SI is poorly characterized because it is only functional in its native genetic background, yet its presence interferes with, and precludes all studies performed in V. cholerae. I propose to solve this paradoxical situation by deleting the SI, an ambitious project not only for its size (126 Kb) but because it is highly stabilized by 17 toxin-antitoxin systems. To do so, I have developed SeqDelTA, a novel method that is already giving excellent preliminary results. I will then use V. cholerae∆SI to study fundamental aspects of SCIs, yet out of reach. I will elucidate the functions encoded in SI cassettes to understand the role and adaptive value of integrons in nature; I will also unravel the genesis of cassettes: how a gene is exapted from its genetic context to become a mobile module; and I will explore the circulation of antibiotic resistance cassettes among humans, animals, food, and the environment with a novel biosynthetic tool (the I3C). KryptonInt will open and explore the historically inaccessible field of study of SCIs.

Dziedzina nauki (EuroSciVoc)

Słowa kluczowe

Program(-y)

Temat(-y)

System finansowania

ERC-STG - Starting Grant

Wyświetl wszystkie projekty finansowane w ramach tego programu finansowania

Zaproszenie do składania wniosków

(odnośnik otworzy się w nowym oknie) ERC-2018-STG

Wyświetl wszystkie projekty finansowane w ramach tego zaproszenia

Instytucja przyjmująca

UNIVERSIDAD COMPLUTENSE DE MADRID
Wkład UE netto
€ 1 499 516,00
Koszt całkowity
€ 1 499 516,00

Beneficjenci (1)